RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa20.75■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 EXO5Q9H790 373 aa20.75■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 ATRNL1Q5VV63 1379 aa20.75■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF879B4DU55 563 aa20.75■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 AGRPO00253 132 aa20.75■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 ARPC2O15144 300 aa20.75■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 ORC5O43913 435 aa20.75■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 SNX4O95219 450 aa20.75■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 IQCCQ4KMZ1 466 aa20.75■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP20.75■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 NATD1Q8N6N6 113 aa20.75■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 CAMK1GQ96NX5 476 aa20.75■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 CGREF1Q99674 301 aa20.75■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 BCO2Q9BYV7 579 aa20.75■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 MAP10Q9P2G4 905 aa20.75■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 A0A1W2PQ72 361 aa20.75■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 EFCAB9A8MZ26 197 aa20.75■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 CRISP3P54108 245 aa20.75■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 OGFOD2Q6N063 350 aa20.75■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP20.75■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 PPP1R14BQ96C90 147 aa20.75■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 EFCAB11Q9BUY7 163 aa20.75■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP20.75■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 FAM172BPA6NC97 362 aa20.75■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP20.75■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP20.75■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 PTPN2P17706 415 aa20.75■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 CLCN4P51793 760 aa20.75■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP20.75■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 MXD1Q05195 221 aa20.75■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP20.75■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 SLC9A4Q6AI14 798 aa20.75■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 TIFABQ6ZNK6 161 aa20.75■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 SLC51AQ86UW1 340 aa20.75■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 OR14C36Q8NHC7 312 aa20.75■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP20.75■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 USP29Q9HBJ7 922 aa20.75■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP20.75■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 SLC17A6Q9P2U8 582 aa20.75■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 PITPNM1O00562 1244 aa20.74■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 ENPP3O14638 875 aa20.74■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 MATN4O95460 622 aa20.74■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 ARHGDIBP52566 201 aa20.74■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 NFKB2Q00653 900 aa20.74■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP20.74■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 MINDY2Q8NBR6 621 aa20.74■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 GPER1Q99527 375 aa20.74■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 ADAMTS3O15072 1205 aa20.74■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 PCDH7O60245 1069 aa20.74■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 DLX3O60479 287 aa20.74■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 ECI2O75521 394 aa20.74■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP20.74■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 SLC10A7Q0GE19 358 aa20.74■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP20.74■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 ADNP2Q6IQ32 1131 aa20.74■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP20.74■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 OXR1Q8N573 874 aa20.74■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP20.74■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 GPR22Q99680 433 aa20.74■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 PRODHO43272 600 aa20.74■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP20.74■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 CYP11A1P05108 521 aa20.74■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 HSD17B2P37059 387 aa20.74■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 PIK3CBP42338 1070 aa20.74■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 ALDH3A2P51648 485 aa20.74■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 ZBED5Q49AG3 693 aa20.74■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 EIPR1Q53HC9 387 aa20.74■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa20.74■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 OSER1Q9NX31 292 aa20.74■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP20.74■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 TVP23BQ9NYZ1 205 aa20.74■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 OAZ3Q9UMX2 235 aa20.74■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 A0A0X1KG70 313 aa20.74■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 A0A1W2PRB8 838 aa20.74■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 ILVBLA1L0T0 632 aa20.74■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 PEX10O60683 326 aa20.74■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP20.74■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 PLEKHG6Q3KR16 790 aa20.74■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 NEK7Q8TDX7 302 aa20.74■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 KAT2AQ92830 837 aa20.74■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 TWNKQ96RR1 684 aa20.74■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP20.74■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP20.73■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP20.73■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 RABGGTBP53611 331 aa20.73■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 GAD2Q05329 585 aa20.73■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 SPRYD7Q5W111 196 aa20.73■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 BCAS3Q9H6U6 928 aa20.73■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 ITM2CQ9NQX7 267 aa20.73■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 NIPSNAP2O75323 286 aa20.73■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 DGKGP49619 791 aa20.73■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 AP1S2P56377 157 aa20.73■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 OR10G2Q8NGC3 310 aa20.73■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP20.73■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 LPIN3Q9BQK8 851 aa20.73■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa20.73■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 VPS29Q9UBQ0 182 aa20.73■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 CFL2Q9Y281 166 aa20.73■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 FABP12A6NFH5 140 aa20.73■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 OR51F1A6NGY5 319 aa20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.9 ms