RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000277010.8

SIGMAR1-201, Transcript of sigma non-opioid intracellular receptor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SIGMAR1, Length 1,656 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIGMAR1-201ENST00000277010 ADGRD1Q6QNK2 874 aa22.16■■□□□ 1.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 SPATA6LQ8N4H0 392 aa22.16■■□□□ 1.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa22.16■■□□□ 1.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 OR2W6PQ8NHA6 318 aa22.16■■□□□ 1.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 WDR48Q8TAF3 677 aa22.16■■□□□ 1.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 SRMSQ9H3Y6 488 aa22.16■■□□□ 1.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 SNX15Q9NRS6 342 aa22.16■■□□□ 1.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 FETUBQ9UGM5 382 aa22.16■■□□□ 1.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa22.16■■□□□ 1.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 ICKQ9UPZ9 632 aa22.16■■□□□ 1.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 OR6C74A6NCV1 312 aa22.15■■□□□ 1.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 D6RAR5 112 aa22.15■■□□□ 1.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 GFYI3L273 518 aa22.15■■□□□ 1.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 SLC35E2BP0CK96 405 aa22.15■■□□□ 1.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 CCNFP41002 786 aa22.15■■□□□ 1.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 AMIGO1Q86WK6 493 aa22.15■■□□□ 1.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 MREGQ8N565 214 aa22.15■■□□□ 1.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 DLG3Q92796 817 aa22.15■■□□□ 1.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 IL17FQ96PD4 163 aa22.15■■□□□ 1.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 EPB41L1Q9H4G0 881 aa22.15■■□□□ 1.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 TMEM9Q9P0T7 183 aa22.15■■□□□ 1.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 IKZF3Q9UKT9 509 aa22.15■■□□□ 1.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 TRIM49D1C9J1S8 452 aa22.14■■□□□ 1.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 CCDC166P0CW27 439 aa22.14■■□□□ 1.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 MPSTP25325 297 aa22.14■■□□□ 1.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 CNTFP26441 200 aa22.14■■□□□ 1.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 CRABP2P29373 138 aa22.14■■□□□ 1.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 SLCO1A2P46721 670 aa22.14■■□□□ 1.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 CAPZBP47756 277 aa22.14■■□□□ 1.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 SERPINB8P50452 374 aa22.14■■□□□ 1.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 RASGRP3Q8IV61 690 aa22.14■■□□□ 1.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa22.14■■□□□ 1.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 MAGEC3Q8TD91 643 aa22.14■■□□□ 1.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 RAD51AP1Q96B01 352 aa22.14■■□□□ 1.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 HRASLS2Q9NWW9 162 aa22.14■■□□□ 1.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa22.14■■□□□ 1.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 TBK1Q9UHD2 729 aa22.14■■□□□ 1.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 SMIM23A6NLE4 172 aa22.14■■□□□ 1.13
SIGMAR1-201ENST00000277010 CTIFO43310 598 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
SIGMAR1-201ENST00000277010 ZBTB14O43829 449 aa22.14■■□□□ 1.13
SIGMAR1-201ENST00000277010 TCEA3O75764 348 aa22.14■■□□□ 1.13
SIGMAR1-201ENST00000277010 KRT37O76014 449 aa22.14■■□□□ 1.13
SIGMAR1-201ENST00000277010 MT-CO3P00414 261 aa22.14■■□□□ 1.13
SIGMAR1-201ENST00000277010 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
SIGMAR1-201ENST00000277010 NUDT17P0C025 328 aa22.14■■□□□ 1.13
SIGMAR1-201ENST00000277010 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
SIGMAR1-201ENST00000277010 TYK2P29597 1187 aa22.14■■□□□ 1.13
SIGMAR1-201ENST00000277010 SQSTM1Q13501 440 aa22.14■■□□□ 1.13
SIGMAR1-201ENST00000277010 CDCP2Q5VXM1 449 aa22.14■■□□□ 1.13
SIGMAR1-201ENST00000277010 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
SIGMAR1-201ENST00000277010 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
SIGMAR1-201ENST00000277010 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
SIGMAR1-201ENST00000277010 MENTQ9BUN1 341 aa22.14■■□□□ 1.13
SIGMAR1-201ENST00000277010 OR5K3A6NET4 321 aa22.13■■□□□ 1.13
SIGMAR1-201ENST00000277010 KDM1AO60341 852 aa22.13■■□□□ 1.13
SIGMAR1-201ENST00000277010 SYF2O95926 243 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
SIGMAR1-201ENST00000277010 C2P06681 752 aa22.13■■□□□ 1.13
SIGMAR1-201ENST00000277010 C8GP07360 202 aa22.13■■□□□ 1.13
SIGMAR1-201ENST00000277010 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
SIGMAR1-201ENST00000277010 SHMT2P34897 504 aa22.13■■□□□ 1.13
SIGMAR1-201ENST00000277010 CSRP3P50461 194 aa22.13■■□□□ 1.13
SIGMAR1-201ENST00000277010 PDX1P52945 283 aa22.13■■□□□ 1.13
SIGMAR1-201ENST00000277010 GFERP55789 205 aa22.13■■□□□ 1.13
SIGMAR1-201ENST00000277010 PPP1CAP62136 330 aa22.13■■□□□ 1.13
SIGMAR1-201ENST00000277010 FOXC1Q12948 553 aa22.13■■□□□ 1.13
SIGMAR1-201ENST00000277010 CSHL1Q14406 222 aa22.13■■□□□ 1.13
SIGMAR1-201ENST00000277010 LGSNQ5TDP6 509 aa22.13■■□□□ 1.13
SIGMAR1-201ENST00000277010 KLHL35Q6PF15 583 aa22.13■■□□□ 1.13
SIGMAR1-201ENST00000277010 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa22.13■■□□□ 1.13
SIGMAR1-201ENST00000277010 OOSP2Q86WS3 158 aa22.13■■□□□ 1.13
SIGMAR1-201ENST00000277010 MARCH9Q86YJ5 346 aa22.13■■□□□ 1.13
SIGMAR1-201ENST00000277010 MYRIPQ8NFW9 859 aa22.13■■□□□ 1.13
SIGMAR1-201ENST00000277010 CLCA2Q9UQC9 943 aa22.13■■□□□ 1.13
SIGMAR1-201ENST00000277010 CCDC151A5D8V7 595 aa22.12■■□□□ 1.13
SIGMAR1-201ENST00000277010 FAM149AA5PLN7 773 aa22.12■■□□□ 1.13
SIGMAR1-201ENST00000277010 CDC7O00311 574 aa22.12■■□□□ 1.13
SIGMAR1-201ENST00000277010 BTN3A3O00478 584 aa22.12■■□□□ 1.13
SIGMAR1-201ENST00000277010 BTN3A1O00481 513 aa22.12■■□□□ 1.13
SIGMAR1-201ENST00000277010 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
SIGMAR1-201ENST00000277010 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
SIGMAR1-201ENST00000277010 PKLRP30613 574 aa22.12■■□□□ 1.13
SIGMAR1-201ENST00000277010 RAB28P51157 221 aa22.12■■□□□ 1.13
SIGMAR1-201ENST00000277010 IRF9Q00978 393 aa22.12■■□□□ 1.13
SIGMAR1-201ENST00000277010 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
SIGMAR1-201ENST00000277010 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
SIGMAR1-201ENST00000277010 OR9A1PQ8NGU1 263 aa22.12■■□□□ 1.13
SIGMAR1-201ENST00000277010 DENND1AQ8TEH3 1009 aa22.12■■□□□ 1.13
SIGMAR1-201ENST00000277010 UBXN10Q96LJ8 280 aa22.12■■□□□ 1.13
SIGMAR1-201ENST00000277010 TGM7Q96PF1 710 aa22.12■■□□□ 1.13
SIGMAR1-201ENST00000277010 PKP4Q99569 1192 aa22.12■■□□□ 1.13
SIGMAR1-201ENST00000277010 SLC12A9Q9BXP2 914 aa22.12■■□□□ 1.13
SIGMAR1-201ENST00000277010 DERL2Q9GZP9 239 aa22.12■■□□□ 1.13
SIGMAR1-201ENST00000277010 SEMA6CQ9H3T2 930 aa22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45 ms