RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533557.5

BBS1-222, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 2

Gene BBS1, Length 1,043 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-222	ENST00000533557	GFRAL	Q6UXV0	394 aa		11.7	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	NCCRP1	Q6ZVX7	275 aa	Predicted RBP	11.7	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	COX15	Q7KZN9	410 aa		11.7	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	FAM20C	Q8IXL6	584 aa		11.7	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	CFAP206	Q8IYR0	622 aa		11.7	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	DTWD1	Q8N5C7	304 aa		11.7	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	ACVR1C	Q8NER5	493 aa		11.7	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	OR52E1	Q8NGJ3	308 aa		11.7	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	DTX3L	Q8TDB6	740 aa		11.7	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	ADAMTS18	Q8TE60	1221 aa		11.7	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	PSMF1	Q92530	271 aa		11.7	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	SPSB2	Q99619	263 aa		11.7	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	SLC25A51	Q9H1U9	297 aa		11.7	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	ACTR10	Q9NZ32	417 aa		11.7	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	ACSL5	Q9ULC5	683 aa		11.7	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	NEU2	Q9Y3R4	380 aa		11.7	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	KCNN4	O15554	427 aa		11.69	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	UNC5C	O95185	931 aa		11.69	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	PDHA2	P29803	388 aa		11.69	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	CD68	P34810	354 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	SPAM1	P38567	509 aa		11.69	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	PBX1	P40424	430 aa		11.69	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	PRKG2	Q13237	762 aa		11.69	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	GSE1	Q14687	1217 aa		11.69	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	NPNT	Q6UXI9	565 aa		11.69	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	PLD5	Q8N7P1	536 aa		11.69	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	SERBP1	Q8NC51	408 aa	Known RBP eCLIP	11.69	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	OR11G2	Q8NGC1	345 aa		11.69	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	RAPGEF5	Q92565	580 aa		11.69	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	THOC3	Q96J01	351 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	MAGEB10	Q96LZ2	347 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	OR2A14	Q96R47	310 aa		11.69	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	FERD3L	Q96RJ6	166 aa		11.69	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	AP1M1	Q9BXS5	423 aa		11.69	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	XPO4	Q9C0E2	1151 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	LHPP	Q9H008	270 aa		11.69	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	THAP2	Q9H0W7	228 aa		11.69	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	MRPL47	Q9HD33	250 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	SPHK1	Q9NYA1	384 aa		11.69	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	NDOR1	Q9UHB4	597 aa		11.69	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	COLEC10	Q9Y6Z7	277 aa		11.69	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	NCOA6	Q14686	2063 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	GLYATL1P3	A0A0U1RQE8	302 aa		11.68	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	LOC285095	A0A1B0GVY8	99 aa		11.68	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	F10	P00742	488 aa		11.68	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	SLC35G4	P0C7Q5	338 aa		11.68	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	SSTR2	P30874	369 aa		11.68	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	PRKCI	P41743	596 aa		11.68	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	MFAP5	Q13361	173 aa		11.68	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	PPP2R5E	Q16537	467 aa		11.68	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	NKG7	Q16617	165 aa		11.68	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	CT47A1	Q5JQC4	288 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	SIRPB2	Q5JXA9	342 aa		11.68	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	FCRL6	Q6DN72	434 aa		11.68	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	PPP1R2P3	Q6NXS1	205 aa		11.68	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	SPESP1	Q6UW49	350 aa		11.68	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	KDELC1	Q6UW63	502 aa		11.68	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	ISLR2	Q6UXK2	745 aa		11.68	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	GPR135	Q8IZ08	494 aa		11.68	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	DNAJC22	Q8N4W6	341 aa		11.68	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	SLC25A41	Q8N5S1	370 aa		11.68	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	C19orf47	Q8N9M1	422 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	ACBD4	Q8NC06	268 aa		11.68	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	KCTD6	Q8NC69	237 aa		11.68	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	PROKR1	Q8TCW9	393 aa		11.68	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	LINC00615	Q96LM1	132 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	LMF1	Q96S06	567 aa		11.68	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	C17orf62	Q9BQA9	187 aa		11.68	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF670	Q9BS34	389 aa		11.68	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	OR52A5	Q9H2C5	316 aa		11.68	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	TFB2M	Q9H5Q4	396 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	GLOD4	Q9HC38	313 aa		11.68	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	SEMA3G	Q9NS98	782 aa		11.68	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	AIPL1	Q9NZN9	384 aa		11.68	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	CDC23	Q9UJX2	597 aa		11.68	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	ANAPC7	Q9UJX3	599 aa		11.68	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	ICK	Q9UPZ9	632 aa		11.68	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	AP1M2	Q9Y6Q5	423 aa		11.68	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	CACNA1C	Q13936	2221 aa		11.68	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	MATN2	O00339	956 aa		11.67	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	ZSCAN9	O15535	394 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	ZNHIT1	O43257	154 aa		11.67	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	ONECUT2	O95948	504 aa		11.67	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	CCDC172	P0C7W6	258 aa		11.67	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	MYBL1	P10243	752 aa		11.67	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	UGT2B7	P16662	529 aa		11.67	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	MX2	P20592	715 aa		11.67	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	CAPN3	P20807	821 aa		11.67	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	NDUFS1	P28331	727 aa		11.67	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	SSR1	P43307	286 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	TNFSF10	P50591	281 aa		11.67	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	TLE4	Q04727	773 aa		11.67	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	AP1B1	Q10567	949 aa		11.67	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	KRT33B	Q14525	404 aa		11.67	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	ASIC2	Q16515	512 aa		11.67	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	C3AR1	Q16581	482 aa		11.67	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	BCL7A	Q4VC05	210 aa		11.67	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	TMEM207	Q6UWW9	146 aa		11.67	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	OVCH1	Q7RTY7	1134 aa		11.67	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	AMIGO1	Q86WK6	493 aa		11.67	□□□□□ -0.54

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