RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa22.01■■□□□ 1.11
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF366Q8N895 744 aa22.01■■□□□ 1.11
PTPRM-201ENST00000332175 IFT27Q9BW83 186 aa22.01■■□□□ 1.11
PTPRM-201ENST00000332175 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa22.01■■□□□ 1.11
PTPRM-201ENST00000332175 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
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PTPRM-201ENST00000332175 LRRC32Q14392 662 aa22.01■■□□□ 1.11
PTPRM-201ENST00000332175 OR4C6Q8NH72 309 aa22.01■■□□□ 1.11
PTPRM-201ENST00000332175 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
PTPRM-201ENST00000332175 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa22.01■■□□□ 1.11
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF536O15090 1300 aa22.01■■□□□ 1.11
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PTPRM-201ENST00000332175 SYPL2Q5VXT5 272 aa22.01■■□□□ 1.11
PTPRM-201ENST00000332175 CBR4Q8N4T8 237 aa22.01■■□□□ 1.11
PTPRM-201ENST00000332175 TSTD1Q8NFU3 115 aa22.01■■□□□ 1.11
PTPRM-201ENST00000332175 SPATA9Q9BWV2 254 aa22.01■■□□□ 1.11
PTPRM-201ENST00000332175 DTLQ9NZJ0 730 aa22.01■■□□□ 1.11
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PTPRM-201ENST00000332175 SOWAHAQ2M3V2 549 aa22.01■■□□□ 1.11
PTPRM-201ENST00000332175 ULK3Q6PHR2 472 aa22.01■■□□□ 1.11
PTPRM-201ENST00000332175 PCBD2Q9H0N5 130 aa22.01■■□□□ 1.11
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PTPRM-201ENST00000332175 TCEAL6Q6IPX3 200 aa22■■□□□ 1.11
PTPRM-201ENST00000332175 DEFB119Q8N690 84 aa22■■□□□ 1.11
PTPRM-201ENST00000332175 TBX5Q99593 518 aa22■■□□□ 1.11
PTPRM-201ENST00000332175 C11orf49Q9H6J7 331 aa22■■□□□ 1.11
PTPRM-201ENST00000332175 C1orf109Q9NX04 203 aa22■■□□□ 1.11
PTPRM-201ENST00000332175 ACTR1BP42025 376 aa22■■□□□ 1.11
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PTPRM-201ENST00000332175 ACTR1AP61163 376 aa22■■□□□ 1.11
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PTPRM-201ENST00000332175 SLC25A36Q96CQ1 311 aa22■■□□□ 1.11
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PTPRM-201ENST00000332175 TLR6Q9Y2C9 796 aa22■■□□□ 1.11
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PTPRM-201ENST00000332175 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa22■■□□□ 1.11
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PTPRM-201ENST00000332175 RNF121Q9H920 327 aa22■■□□□ 1.11
PTPRM-201ENST00000332175 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
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PTPRM-201ENST00000332175 FSHRP23945 695 aa22■■□□□ 1.11
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PTPRM-201ENST00000332175 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
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PTPRM-201ENST00000332175 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa22■■□□□ 1.11
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PTPRM-201ENST00000332175 A8MU76 341 aa21.99■■□□□ 1.11
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF432O94892 652 aa21.99■■□□□ 1.11
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PTPRM-201ENST00000332175 ALPPP05187 535 aa21.99■■□□□ 1.11
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PTPRM-201ENST00000332175 ARMCX6Q7L4S7 300 aa21.99■■□□□ 1.11
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PTPRM-201ENST00000332175 TRPV1Q8NER1 839 aa21.99■■□□□ 1.11
PTPRM-201ENST00000332175 HM13Q8TCT9 377 aa21.99■■□□□ 1.11
PTPRM-201ENST00000332175 TVP23BQ9NYZ1 205 aa21.99■■□□□ 1.11
PTPRM-201ENST00000332175 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
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PTPRM-201ENST00000332175 SLC30A4O14863 429 aa21.99■■□□□ 1.11
PTPRM-201ENST00000332175 GNSP15586 552 aa21.99■■□□□ 1.11
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PTPRM-201ENST00000332175 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
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PTPRM-201ENST00000332175 HLA-DQB2P05538 268 aa21.98■■□□□ 1.11
PTPRM-201ENST00000332175 FUT4P22083 530 aa21.98■■□□□ 1.11
PTPRM-201ENST00000332175 XIAPP98170 497 aa21.98■■□□□ 1.11
PTPRM-201ENST00000332175 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
PTPRM-201ENST00000332175 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
PTPRM-201ENST00000332175 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
PTPRM-201ENST00000332175 A0A1W2PRG6 482 aa21.98■■□□□ 1.11
PTPRM-201ENST00000332175 FAM172BPA6NC97 362 aa21.98■■□□□ 1.11
PTPRM-201ENST00000332175 HYAL2Q12891 473 aa21.98■■□□□ 1.11
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