RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319942.7

RABGGTB-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTB, Length 1,496 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-201ENST00000319942 DIAPH2O60879 1101 aa9.95□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 UBOX5O94941 541 aa9.95□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 PCDH8O95206 1070 aa9.95□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 SERPINA6P08185 405 aa9.95□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 MTHFD2P13995 350 aa9.95□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 AOAHP28039 575 aa9.95□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 SERPINB3P29508 390 aa9.95□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 ARRB2P32121 409 aa9.95□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 CA5AP35218 305 aa9.95□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 P2RY2P41231 377 aa9.95□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 GPR1P46091 355 aa9.95□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 SEC13P55735 322 aa9.95□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 CORO7P57737 925 aa9.95□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 DPTQ07507 201 aa9.95□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 BNIP1Q12981 228 aa9.95□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 TBCCQ15814 346 aa9.95□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 FBXO43Q4G163 708 aa9.95□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 TMEM196Q5HYL7 178 aa9.95□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa9.95□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF678Q5SXM1 525 aa9.95□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 EPGNQ6UW88 154 aa9.95□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 HOMEZQ8IX15 550 aa9.95□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF781Q8N8C0 355 aa9.95□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 OR2T3Q8NH03 318 aa9.95□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 GIMAP7Q8NHV1 300 aa9.95□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 GANCQ8TET4 914 aa9.95□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 ASZ1Q8WWH4 475 aa9.95□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 EXT2Q93063 718 aa9.95□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 NUS1Q96E22 293 aa9.95□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 TMEM237Q96Q45 408 aa9.95□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 GABRG3Q99928 467 aa9.95□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 MYLK2Q9H1R3 596 aa9.95□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 EPHX3Q9H6B9 360 aa9.95□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 COG4Q9H9E3 785 aa9.95□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 PFDN4Q9NQP4 134 aa9.95□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 TRIM33Q9UPN9 1127 aa9.95□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 FADS3Q9Y5Q0 445 aa9.95□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 PIAS3Q9Y6X2 628 aa9.95□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa9.94□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 MID1O15344 667 aa9.94□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 MBTPS2O43462 519 aa9.94□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 TM7SF2O76062 418 aa9.94□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 CDK14O94921 469 aa9.94□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 MLYCDO95822 493 aa9.94□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 CHRNGP07510 517 aa9.94□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 C6P13671 934 aa9.94□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 SCTRP47872 440 aa9.94□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 IDH3AP50213 366 aa9.94□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 METAP1P53582 386 aa9.94□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 B4GALNT1Q00973 533 aa9.94□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 HSPA14Q0VDF9 509 aa9.94□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 PON2Q15165 354 aa9.94□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 TGFBIQ15582 683 aa9.94□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 UNC50Q53HI1 259 aa9.94□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 ACSBG2Q5FVE4 666 aa9.94□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 CDKL4Q5MAI5 379 aa9.94□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 TTC23LQ6PF05 361 aa9.94□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 FRMD7Q6ZUT3 714 aa9.94□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 ACAD11Q709F0 780 aa9.94□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 CLNKQ7Z7G1 428 aa9.94□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa9.94□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 CLYBLQ8N0X4 340 aa9.94□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 LSMEM2Q8N112 164 aa9.94□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 HDDC3Q8N4P3 179 aa9.94□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 STON2Q8WXE9 905 aa9.94□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 MSANTD3Q96H12 275 aa9.94□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM161BQ96MY7 647 aa9.94□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 ZFP64Q9NPA5 681 aa9.94□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa9.94□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 HEBP1Q9NRV9 189 aa9.94□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 NUDT4Q9NZJ9 180 aa9.94□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa9.94□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa9.94□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 SCML1Q9UN30 329 aa9.94□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 ITM2BQ9Y287 266 aa9.94□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 TRAF6Q9Y4K3 522 aa9.94□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 FADS2P1A8MWK0 482 aa9.93□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 PLK4O00444 970 aa9.93□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 FCHO1O14526 889 aa9.93□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF195O14628 629 aa9.93□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 ATG13O75143 517 aa9.93□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 DNTTP04053 509 aa9.93□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 C8GP07360 202 aa9.93□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 FGF4P08620 206 aa9.93□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 GSTM1P09488 218 aa9.93□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.8 ms