RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541295.5

LMO3-225, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

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Gene LMO3, Length 3,498 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-225ENST00000541295 PTGIRP43119 386 aa6.12□□□□□ -1.43
LMO3-225ENST00000541295 NR4A2P43354 598 aa6.12□□□□□ -1.43
LMO3-225ENST00000541295 FHITP49789 147 aa6.12□□□□□ -1.43
LMO3-225ENST00000541295 CLCNKBP51801 687 aa6.12□□□□□ -1.43
LMO3-225ENST00000541295 RAC3P60763 192 aa6.12□□□□□ -1.43
LMO3-225ENST00000541295 RPL26P61254 145 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
LMO3-225ENST00000541295 ESRRGP62508 458 aa6.12□□□□□ -1.43
LMO3-225ENST00000541295 MERTKQ12866 999 aa6.12□□□□□ -1.43
LMO3-225ENST00000541295 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
LMO3-225ENST00000541295 PDK1Q15118 436 aa6.12□□□□□ -1.43
LMO3-225ENST00000541295 SURF1Q15526 300 aa6.12□□□□□ -1.43
LMO3-225ENST00000541295 QPCTQ16769 361 aa6.12□□□□□ -1.43
LMO3-225ENST00000541295 HSDL1Q3SXM5 330 aa6.12□□□□□ -1.43
LMO3-225ENST00000541295 PRAMEF20Q5VT98 475 aa6.12□□□□□ -1.43
LMO3-225ENST00000541295 FBXO42Q6P3S6 717 aa6.12□□□□□ -1.43
LMO3-225ENST00000541295 SLCO6A1Q86UG4 719 aa6.12□□□□□ -1.43
LMO3-225ENST00000541295 RASGRP3Q8IV61 690 aa6.12□□□□□ -1.43
LMO3-225ENST00000541295 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
LMO3-225ENST00000541295 OR5T2Q8NGG2 359 aa6.12□□□□□ -1.43
LMO3-225ENST00000541295 OR8K5Q8NH50 307 aa6.12□□□□□ -1.43
LMO3-225ENST00000541295 CD300LFQ8TDQ1 290 aa6.12□□□□□ -1.43
LMO3-225ENST00000541295 GLG1Q92896 1179 aa6.12□□□□□ -1.43
LMO3-225ENST00000541295 NTAN1Q96AB6 310 aa6.12□□□□□ -1.43
LMO3-225ENST00000541295 AP2M1Q96CW1 435 aa6.12□□□□□ -1.43
LMO3-225ENST00000541295 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
LMO3-225ENST00000541295 SIPA1Q96FS4 1042 aa6.12□□□□□ -1.43
LMO3-225ENST00000541295 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
LMO3-225ENST00000541295 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
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LMO3-225ENST00000541295 BIN3Q9NQY0 253 aa6.12□□□□□ -1.43
LMO3-225ENST00000541295 DUSP22Q9NRW4 184 aa6.12□□□□□ -1.43
LMO3-225ENST00000541295 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
LMO3-225ENST00000541295 TBC1D13Q9NVG8 400 aa6.12□□□□□ -1.43
LMO3-225ENST00000541295 GLTPQ9NZD2 209 aa6.12□□□□□ -1.43
LMO3-225ENST00000541295 RNF181Q9P0P0 153 aa6.12□□□□□ -1.43
LMO3-225ENST00000541295 ABCD2Q9UBJ2 740 aa6.12□□□□□ -1.43
LMO3-225ENST00000541295 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
LMO3-225ENST00000541295 A8MU76 341 aa6.12□□□□□ -1.43
LMO3-225ENST00000541295 O00370 1275 aa6.12□□□□□ -1.43
LMO3-225ENST00000541295 PLD2O14939 933 aa6.12□□□□□ -1.43
LMO3-225ENST00000541295 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
LMO3-225ENST00000541295 PSMD3O43242 534 aa6.12□□□□□ -1.43
LMO3-225ENST00000541295 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
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LMO3-225ENST00000541295 JUPP14923 745 aa6.12□□□□□ -1.43
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LMO3-225ENST00000541295 CDKN2CP42773 168 aa6.12□□□□□ -1.43
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LMO3-225ENST00000541295 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
LMO3-225ENST00000541295 ARHGAP17Q68EM7 881 aa6.12□□□□□ -1.43
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LMO3-225ENST00000541295 MTFR2Q6P444 385 aa6.12□□□□□ -1.43
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LMO3-225ENST00000541295 ZNF596Q8TC21 504 aa6.12□□□□□ -1.43
LMO3-225ENST00000541295 EEF2KMTQ96G04 330 aa6.12□□□□□ -1.43
LMO3-225ENST00000541295 KRT12Q99456 494 aa6.12□□□□□ -1.43
LMO3-225ENST00000541295 FAM118BQ9BPY3 351 aa6.12□□□□□ -1.43
LMO3-225ENST00000541295 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa6.12□□□□□ -1.43
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LMO3-225ENST00000541295 MINDY3Q9H8M7 445 aa6.12□□□□□ -1.43
LMO3-225ENST00000541295 KCNK12Q9HB15 430 aa6.12□□□□□ -1.43
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LMO3-225ENST00000541295 TDP1Q9NUW8 608 aa6.12□□□□□ -1.43
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LMO3-225ENST00000541295 NPIPA2E9PIF3 369 aa6.11□□□□□ -1.43
LMO3-225ENST00000541295 HS6ST1O60243 411 aa6.11□□□□□ -1.43
LMO3-225ENST00000541295 DDNO94850 711 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
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LMO3-225ENST00000541295 ADH1AP07327 375 aa6.11□□□□□ -1.43
LMO3-225ENST00000541295 CD3GP09693 182 aa6.11□□□□□ -1.43
LMO3-225ENST00000541295 PSKH1P11801 424 aa6.11□□□□□ -1.43
LMO3-225ENST00000541295 MAGP20916 626 aa6.11□□□□□ -1.43
LMO3-225ENST00000541295 RPS12P25398 132 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
LMO3-225ENST00000541295 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
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LMO3-225ENST00000541295 THPOP40225 353 aa6.11□□□□□ -1.43
LMO3-225ENST00000541295 EHHADHQ08426 723 aa6.11□□□□□ -1.43
LMO3-225ENST00000541295 SPP2Q13103 211 aa6.11□□□□□ -1.43
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