RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490476.1

SSX2IP-208, Transcript of SSX family member 2 interacting protein, human

TSL 3

Gene SSX2IP, Length 716 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SSX2IP-208	ENST00000490476	MRPL15	Q9P015	296 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	FBXL17	Q9UF56	701 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	KLK13	Q9UKR3	277 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	BARX2	Q9UMQ3	279 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	SLC4A4	Q9Y6R1	1079 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	MGA	Q8IWI9	3026 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	PLXNB3	Q9ULL4	1909 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	FAM90A8P	A6NJQ4	464 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	KCNU1	A8MYU2	1149 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476		A8MZ25	164 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	ENTPD3	O75355	529 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	CLDN7	O95471	211 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	ADRB2	P07550	413 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	DCN	P07585	359 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	FAM90A13P	P0C7W8	464 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	FAM90A24P	P0C7X0	464 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	CTSA	P10619	480 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	ZNF182	P17025	639 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	ACVRL1	P37023	503 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	CAMP	P49913	170 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	ID2	Q02363	134 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	COL10A1	Q03692	680 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	PRPF4B	Q13523	1007 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	LPIN1	Q14693	890 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	NAB2	Q15742	525 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	TMEM266	Q2M3C6	531 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	SOWAHA	Q2M3V2	549 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	PIK3CD-AS1	Q5SR53	167 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	STPG1	Q5TH74	334 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	ARMC3	Q5W041	872 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	HEPHL1	Q6MZM0	1159 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	TMEM71	Q6P5X7	295 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	GLDN	Q6ZMI3	551 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	QSOX2	Q6ZRP7	698 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	RD3	Q7Z3Z2	195 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	LINC00346	Q8IVM7	164 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	DENND6A	Q8IWF6	608 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	ZDHHC23	Q8IYP9	409 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	ZBTB2	Q8N680	514 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	POC5	Q8NA72	575 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	MCPH1	Q8NEM0	835 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	OR14L1P	Q8NHC6	308 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	HUS1B	Q8NHY5	278 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	WIPF2	Q8TF74	440 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	ARHGEF26	Q96DR7	871 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	CHFR	Q96EP1	664 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	TMEM68	Q96MH6	324 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	ZNF570	Q96NI8	536 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	C1QTNF5	Q9BXJ0	243 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	TXLNGY	Q9BZA5	131 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	NPFFR1	Q9GZQ6	430 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	SETD4	Q9NVD3	440 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	MSRB1	Q9NZV6	116 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	MAGED1	Q9Y5V3	778 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	CEPT1	Q9Y6K0	416 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	CSMD1	Q96PZ7	3565 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	ASCC3	Q8N3C0	2202 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	C2CD4D	B7Z1M9	353 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	SLC28A2	O43868	658 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	HS6ST1	O60243	411 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	KLK8	O60259	260 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	MTA2	O94776	668 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	TPPP	O94811	219 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	CSPG5	O95196	566 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	TUBB	P07437	444 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	MMP3	P08254	477 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	HOXB5	P09067	269 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	ENO3	P13929	434 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	TMEM11	P17152	192 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	HOXD9	P28356	352 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	AVPR1A	P37288	418 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	SLC15A1	P46059	708 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	PPP3CC	P48454	512 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	NRIP1	P48552	1158 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	CDH12	P55289	794 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	SPP2	Q13103	211 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	AIMP2	Q13155	320 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	LY6D	Q14210	128 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	RASA2	Q15283	850 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	CCDC96	Q2M329	555 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	ASTE1	Q2TB18	679 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	CCDC152	Q4G0S7	254 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	PAPD7	Q5XG87	772 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	NAA16	Q6N069	864 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	SLC18B1	Q6NT16	456 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	YTHDF3	Q7Z739	585 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	ANKRD13B	Q86YJ7	626 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	CAMK1D	Q8IU85	385 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	SLC35F3	Q8IY50	421 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	TMEM174	Q8WUU8	243 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	FAM151A	Q8WW52	585 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	IGFBPL1	Q8WX77	278 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	FBXL8	Q96CD0	374 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	PGAM5	Q96HS1	289 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	RADIL	Q96JH8	1075 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	WDR83	Q9BRX9	315 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	APOL6	Q9BWW8	343 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	POLDIP3	Q9BY77	421 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	SIL1	Q9H173	461 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	TRPV6	Q9H1D0	765 aa		4.91	□□□□□ -1.62

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