RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393033.8

GIPC1-203, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GIPC1, Length 1,926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-203ENST00000393033 OR52B6Q8NGF0 335 aa25.96■■□□□ 1.75
GIPC1-203ENST00000393033 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
GIPC1-203ENST00000393033 BRINP2Q9C0B6 783 aa25.96■■□□□ 1.75
GIPC1-203ENST00000393033 EBF3Q9H4W6 596 aa25.96■■□□□ 1.75
GIPC1-203ENST00000393033 TMEM45AQ9NWC5 275 aa25.96■■□□□ 1.75
GIPC1-203ENST00000393033 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
GIPC1-203ENST00000393033 HIDE1A8MVS5 230 aa25.95■■□□□ 1.74
GIPC1-203ENST00000393033 ANGPT2O15123 496 aa25.95■■□□□ 1.74
GIPC1-203ENST00000393033 MOSPD3O75425 235 aa25.95■■□□□ 1.74
GIPC1-203ENST00000393033 POP4O95707 220 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
GIPC1-203ENST00000393033 CAPNS1P04632 268 aa25.95■■□□□ 1.74
GIPC1-203ENST00000393033 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
GIPC1-203ENST00000393033 AQP4P55087 323 aa25.95■■□□□ 1.74
GIPC1-203ENST00000393033 NME5P56597 212 aa25.95■■□□□ 1.74
GIPC1-203ENST00000393033 LRRC66Q68CR7 880 aa25.95■■□□□ 1.74
GIPC1-203ENST00000393033 TMEM154Q6P9G4 183 aa25.95■■□□□ 1.74
GIPC1-203ENST00000393033 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa25.95■■□□□ 1.74
GIPC1-203ENST00000393033 SPATA24Q86W54 205 aa25.95■■□□□ 1.74
GIPC1-203ENST00000393033 MINDY1Q8N5J2 469 aa25.95■■□□□ 1.74
GIPC1-203ENST00000393033 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
GIPC1-203ENST00000393033 MIEF2Q96C03 454 aa25.95■■□□□ 1.74
GIPC1-203ENST00000393033 TCEAL4Q96EI5 215 aa25.95■■□□□ 1.74
GIPC1-203ENST00000393033 LRGUKQ96M69 825 aa25.95■■□□□ 1.74
GIPC1-203ENST00000393033 BTBD9Q96Q07 612 aa25.95■■□□□ 1.74
GIPC1-203ENST00000393033 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
GIPC1-203ENST00000393033 ABCD2Q9UBJ2 740 aa25.95■■□□□ 1.74
GIPC1-203ENST00000393033 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
GIPC1-203ENST00000393033 TRIM16O95361 564 aa25.94■■□□□ 1.74
GIPC1-203ENST00000393033 ITGB6P18564 788 aa25.94■■□□□ 1.74
GIPC1-203ENST00000393033 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
GIPC1-203ENST00000393033 DIO3P55073 304 aa25.94■■□□□ 1.74
GIPC1-203ENST00000393033 ERVK-8P63133 956 aa25.94■■□□□ 1.74
GIPC1-203ENST00000393033 VPS26BQ4G0F5 336 aa25.94■■□□□ 1.74
GIPC1-203ENST00000393033 LETMD1Q6P1Q0 360 aa25.94■■□□□ 1.74
GIPC1-203ENST00000393033 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
GIPC1-203ENST00000393033 OR2T11Q8NH01 316 aa25.94■■□□□ 1.74
GIPC1-203ENST00000393033 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
GIPC1-203ENST00000393033 ACOX2Q99424 681 aa25.94■■□□□ 1.74
GIPC1-203ENST00000393033 VCXQ9H320 206 aa25.94■■□□□ 1.74
GIPC1-203ENST00000393033 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
GIPC1-203ENST00000393033 KLHL42Q9P2K6 505 aa25.94■■□□□ 1.74
GIPC1-203ENST00000393033 A0A1W2PQ67 120 aa25.94■■□□□ 1.74
GIPC1-203ENST00000393033 SOBPA7XYQ1 873 aa25.94■■□□□ 1.74
GIPC1-203ENST00000393033 A8MX80 341 aa25.94■■□□□ 1.74
GIPC1-203ENST00000393033 UQCRBP14927 111 aa25.94■■□□□ 1.74
GIPC1-203ENST00000393033 NSG1P42857 185 aa25.94■■□□□ 1.74
GIPC1-203ENST00000393033 SLC7A2P52569 658 aa25.94■■□□□ 1.74
GIPC1-203ENST00000393033 RALGDSQ12967 914 aa25.94■■□□□ 1.74
GIPC1-203ENST00000393033 GTF2H2Q13888 395 aa25.94■■□□□ 1.74
GIPC1-203ENST00000393033 TEAD2Q15562 447 aa25.94■■□□□ 1.74
GIPC1-203ENST00000393033 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
GIPC1-203ENST00000393033 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
GIPC1-203ENST00000393033 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa25.94■■□□□ 1.74
GIPC1-203ENST00000393033 NECAB2Q7Z6G3 386 aa25.94■■□□□ 1.74
GIPC1-203ENST00000393033 CDYL2Q8N8U2 506 aa25.94■■□□□ 1.74
GIPC1-203ENST00000393033 CATSPER1Q8NEC5 780 aa25.94■■□□□ 1.74
GIPC1-203ENST00000393033 PCDHAC1Q9H158 963 aa25.94■■□□□ 1.74
GIPC1-203ENST00000393033 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa25.94■■□□□ 1.74
GIPC1-203ENST00000393033 DTNAQ9Y4J8 743 aa25.94■■□□□ 1.74
GIPC1-203ENST00000393033 OR7A17O14581 309 aa25.93■■□□□ 1.74
GIPC1-203ENST00000393033 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
GIPC1-203ENST00000393033 PTPN2P17706 415 aa25.93■■□□□ 1.74
GIPC1-203ENST00000393033 RHDQ02161 417 aa25.93■■□□□ 1.74
GIPC1-203ENST00000393033 PTSQ03393 145 aa25.93■■□□□ 1.74
GIPC1-203ENST00000393033 FOXM1Q08050 763 aa25.93■■□□□ 1.74
GIPC1-203ENST00000393033 DMC1Q14565 340 aa25.93■■□□□ 1.74
GIPC1-203ENST00000393033 GRAMD1BQ3KR37 738 aa25.93■■□□□ 1.74
GIPC1-203ENST00000393033 C6orf10Q5SRN2 563 aa25.93■■□□□ 1.74
GIPC1-203ENST00000393033 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa25.93■■□□□ 1.74
GIPC1-203ENST00000393033 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa25.93■■□□□ 1.74
GIPC1-203ENST00000393033 LILRA2Q8N149 483 aa25.93■■□□□ 1.74
GIPC1-203ENST00000393033 NAT14Q8WUY8 206 aa25.93■■□□□ 1.74
GIPC1-203ENST00000393033 ASIC4Q96FT7 647 aa25.93■■□□□ 1.74
GIPC1-203ENST00000393033 GID8Q9NWU2 228 aa25.93■■□□□ 1.74
GIPC1-203ENST00000393033 SCOCQ9UIL1 159 aa25.93■■□□□ 1.74
GIPC1-203ENST00000393033 FGBP02675 491 aa25.92■■□□□ 1.74
GIPC1-203ENST00000393033 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
GIPC1-203ENST00000393033 RCAN2Q14206 197 aa25.92■■□□□ 1.74
GIPC1-203ENST00000393033 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
GIPC1-203ENST00000393033 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa25.92■■□□□ 1.74
GIPC1-203ENST00000393033 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
GIPC1-203ENST00000393033 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
GIPC1-203ENST00000393033 TICAM1Q8IUC6 712 aa25.92■■□□□ 1.74
GIPC1-203ENST00000393033 ADCY4Q8NFM4 1077 aa25.92■■□□□ 1.74
GIPC1-203ENST00000393033 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
GIPC1-203ENST00000393033 IRF7Q92985 503 aa25.92■■□□□ 1.74
GIPC1-203ENST00000393033 BBS2Q9BXC9 721 aa25.92■■□□□ 1.74
GIPC1-203ENST00000393033 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
GIPC1-203ENST00000393033 TDP1Q9NUW8 608 aa25.92■■□□□ 1.74
GIPC1-203ENST00000393033 NOTCH4Q99466 2003 aa25.92■■□□□ 1.74
GIPC1-203ENST00000393033 A0A1W2PP18 115 aa25.92■■□□□ 1.74
GIPC1-203ENST00000393033 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa25.92■■□□□ 1.74
GIPC1-203ENST00000393033 FXYD1O00168 92 aa25.92■■□□□ 1.74
GIPC1-203ENST00000393033 TAPBPO15533 448 aa25.92■■□□□ 1.74
GIPC1-203ENST00000393033 OTCP00480 354 aa25.92■■□□□ 1.74
GIPC1-203ENST00000393033 LHCGRP22888 699 aa25.92■■□□□ 1.74
GIPC1-203ENST00000393033 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
GIPC1-203ENST00000393033 TTLL9Q3SXZ7 439 aa25.92■■□□□ 1.74
GIPC1-203ENST00000393033 SPATS1Q496A3 300 aa25.92■■□□□ 1.74
GIPC1-203ENST00000393033 C6orf136Q5SQH8 315 aa25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.7 ms