RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602290.1

HCG18-241, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HCG18, Length 821 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-241ENST00000602290 ZNF232Q9UNY5 417 aa11.58□□□□□ -0.56
HCG18-241ENST00000602290 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP11.58□□□□□ -0.56
HCG18-241ENST00000602290 TMEM63AO94886 807 aa11.57□□□□□ -0.56
HCG18-241ENST00000602290 FBXO21O94952 628 aa11.57□□□□□ -0.56
HCG18-241ENST00000602290 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP11.57□□□□□ -0.56
HCG18-241ENST00000602290 BMP15O95972 392 aa11.57□□□□□ -0.56
HCG18-241ENST00000602290 PCCBP05166 539 aa11.57□□□□□ -0.56
HCG18-241ENST00000602290 UGT2B4P06133 528 aa11.57□□□□□ -0.56
HCG18-241ENST00000602290 RHOCP08134 193 aa11.57□□□□□ -0.56
HCG18-241ENST00000602290 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP11.57□□□□□ -0.56
HCG18-241ENST00000602290 IDO1P14902 403 aa11.57□□□□□ -0.56
HCG18-241ENST00000602290 AK4P27144 223 aaPredicted RBP11.57□□□□□ -0.56
HCG18-241ENST00000602290 ADRA1BP35368 520 aa11.57□□□□□ -0.56
HCG18-241ENST00000602290 KRT9P35527 623 aa11.57□□□□□ -0.56
HCG18-241ENST00000602290 KIR3DL1P43629 444 aa11.57□□□□□ -0.56
HCG18-241ENST00000602290 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP11.57□□□□□ -0.56
HCG18-241ENST00000602290 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP11.57□□□□□ -0.56
HCG18-241ENST00000602290 ARF5P84085 180 aa11.57□□□□□ -0.56
HCG18-241ENST00000602290 ATP11AP98196 1134 aa11.57□□□□□ -0.56
HCG18-241ENST00000602290 CUL1Q13616 776 aa11.57□□□□□ -0.56
HCG18-241ENST00000602290 TAF11Q15544 211 aa11.57□□□□□ -0.56
HCG18-241ENST00000602290 ALFQ53S48 1182 aa11.57□□□□□ -0.56
HCG18-241ENST00000602290 C8orf74Q6P047 294 aa11.57□□□□□ -0.56
HCG18-241ENST00000602290 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP11.57□□□□□ -0.56
HCG18-241ENST00000602290 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP11.57□□□□□ -0.56
HCG18-241ENST00000602290 OR10G6Q8NH81 332 aa11.57□□□□□ -0.56
HCG18-241ENST00000602290 RAPGEF5Q92565 580 aa11.57□□□□□ -0.56
HCG18-241ENST00000602290 ARSGQ96EG1 525 aa11.57□□□□□ -0.56
HCG18-241ENST00000602290 EEF2KMTQ96G04 330 aa11.57□□□□□ -0.56
HCG18-241ENST00000602290 AGAP3Q96P47 875 aa11.57□□□□□ -0.56
HCG18-241ENST00000602290 LRRC1Q9BTT6 524 aa11.57□□□□□ -0.56
HCG18-241ENST00000602290 GSDMCQ9BYG8 508 aa11.57□□□□□ -0.56
HCG18-241ENST00000602290 FAM129AQ9BZQ8 928 aa11.57□□□□□ -0.56
HCG18-241ENST00000602290 TM6SF2Q9BZW4 377 aa11.57□□□□□ -0.56
HCG18-241ENST00000602290 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP11.57□□□□□ -0.56
HCG18-241ENST00000602290 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP11.57□□□□□ -0.56
HCG18-241ENST00000602290 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa11.57□□□□□ -0.56
HCG18-241ENST00000602290 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP11.57□□□□□ -0.56
HCG18-241ENST00000602290 CAPN11Q9UMQ6 739 aa11.57□□□□□ -0.56
HCG18-241ENST00000602290 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP11.57□□□□□ -0.56
HCG18-241ENST00000602290 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa11.57□□□□□ -0.56
HCG18-241ENST00000602290 ACTL7AQ9Y615 435 aa11.57□□□□□ -0.56
HCG18-241ENST00000602290 CUBNO60494 3623 aa11.57□□□□□ -0.56
HCG18-241ENST00000602290 CACNA1CQ13936 2221 aa11.56□□□□□ -0.56
HCG18-241ENST00000602290 A0A0U1RQJ8 604 aa11.56□□□□□ -0.56
HCG18-241ENST00000602290 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP11.56□□□□□ -0.56
HCG18-241ENST00000602290 ZNF185O15231 689 aa11.56□□□□□ -0.56
HCG18-241ENST00000602290 TIAF1O95411 115 aa11.56□□□□□ -0.56
HCG18-241ENST00000602290 MYL1P05976 194 aa11.56□□□□□ -0.56
HCG18-241ENST00000602290 DESP17661 470 aa11.56□□□□□ -0.56
HCG18-241ENST00000602290 KLC1Q07866 573 aa11.56□□□□□ -0.56
HCG18-241ENST00000602290 C2orf54Q08AI8 447 aa11.56□□□□□ -0.56
HCG18-241ENST00000602290 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP11.56□□□□□ -0.562e-7■■■■□ 19.7
HCG18-241ENST00000602290 GALNTL6Q49A17 601 aa11.56□□□□□ -0.56
HCG18-241ENST00000602290 FIGNQ5HY92 759 aa11.56□□□□□ -0.56
HCG18-241ENST00000602290 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP11.56□□□□□ -0.56
HCG18-241ENST00000602290 ARTNQ5T4W7 220 aa11.56□□□□□ -0.56
HCG18-241ENST00000602290 ERMARDQ5T6L9 678 aa11.56□□□□□ -0.56
HCG18-241ENST00000602290 RPTNQ6XPR3 784 aa11.56□□□□□ -0.56
HCG18-241ENST00000602290 CPLX4Q7Z7G2 160 aa11.56□□□□□ -0.56
HCG18-241ENST00000602290 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP11.56□□□□□ -0.56
HCG18-241ENST00000602290 SLC9A9Q8IVB4 645 aa11.56□□□□□ -0.56
HCG18-241ENST00000602290 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP11.56□□□□□ -0.56
HCG18-241ENST00000602290 ZNF683Q8IZ20 524 aa11.56□□□□□ -0.56
HCG18-241ENST00000602290 KIRREL3Q8IZU9 778 aa11.56□□□□□ -0.56
HCG18-241ENST00000602290 CHTF18Q8WVB6 975 aa11.56□□□□□ -0.56
HCG18-241ENST00000602290 KLHL32Q96NJ5 620 aa11.56□□□□□ -0.56
HCG18-241ENST00000602290 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP11.56□□□□□ -0.56
HCG18-241ENST00000602290 MED15Q96RN5 788 aa11.56□□□□□ -0.56
HCG18-241ENST00000602290 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP11.56□□□□□ -0.56
HCG18-241ENST00000602290 LGR4Q9BXB1 951 aa11.56□□□□□ -0.56
HCG18-241ENST00000602290 RAB17Q9H0T7 212 aa11.56□□□□□ -0.56
HCG18-241ENST00000602290 RABEP2Q9H5N1 569 aa11.56□□□□□ -0.56
HCG18-241ENST00000602290 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP11.56□□□□□ -0.56
HCG18-241ENST00000602290 FGF21Q9NSA1 209 aa11.56□□□□□ -0.56
HCG18-241ENST00000602290 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa11.56□□□□□ -0.56
HCG18-241ENST00000602290 HS3ST4Q9Y661 456 aa11.56□□□□□ -0.56
HCG18-241ENST00000602290 FER1L5A0AVI2 2057 aa11.55□□□□□ -0.56
HCG18-241ENST00000602290 DPPA5A6NC42 116 aa11.55□□□□□ -0.56
HCG18-241ENST00000602290 F5H423 210 aaPredicted RBP11.55□□□□□ -0.56
HCG18-241ENST00000602290 ATP5HO75947 161 aa11.55□□□□□ -0.56
HCG18-241ENST00000602290 MT-ND3P03897 115 aa11.55□□□□□ -0.56
HCG18-241ENST00000602290 FUCA1P04066 466 aa11.55□□□□□ -0.56
HCG18-241ENST00000602290 CCNYL3P0C7X3 344 aa11.55□□□□□ -0.56
HCG18-241ENST00000602290 FGF5P12034 268 aa11.55□□□□□ -0.56
HCG18-241ENST00000602290 KELP23276 732 aa11.55□□□□□ -0.56
HCG18-241ENST00000602290 TRIM23P36406 574 aa11.55□□□□□ -0.56
HCG18-241ENST00000602290 RPL34P49207 117 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
HCG18-241ENST00000602290 SH3BP2P78314 561 aa11.55□□□□□ -0.56
HCG18-241ENST00000602290 PTK2Q05397 1052 aa11.55□□□□□ -0.56
HCG18-241ENST00000602290 PPP3CAQ08209 521 aa11.55□□□□□ -0.56
HCG18-241ENST00000602290 IL11RAQ14626 422 aa11.55□□□□□ -0.56
HCG18-241ENST00000602290 MYBPC3Q14896 1274 aa11.55□□□□□ -0.56
HCG18-241ENST00000602290 PARP6Q2NL67 630 aa11.55□□□□□ -0.56
HCG18-241ENST00000602290 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa11.55□□□□□ -0.56
HCG18-241ENST00000602290 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa11.55□□□□□ -0.56
HCG18-241ENST00000602290 LCLAT1Q6UWP7 414 aa11.55□□□□□ -0.56
HCG18-241ENST00000602290 ZNF765Q7L2R6 523 aa11.55□□□□□ -0.56
HCG18-241ENST00000602290 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa11.55□□□□□ -0.56
HCG18-241ENST00000602290 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.6 ms