RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF559-ZNF177	A0A0A6YYI6	481 aa	Predicted RBP	18.23	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	NCF1B	A6NI72	391 aa	Predicted RBP	18.23	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	NCF1C	A8MVU1	366 aa	Predicted RBP	18.23	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	ANKRD66	B4E2M5	251 aa		18.23	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	STX7	O15400	261 aa	Known RBP	18.23	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	CA12	O43570	354 aa		18.23	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	TBC1D4	O60343	1298 aa		18.23	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	ESR1	P03372	595 aa		18.23	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	RHOC	P08134	193 aa		18.23	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	PRKAR2A	P13861	404 aa	Known RBP	18.23	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	NCF1	P14598	390 aa	Predicted RBP	18.23	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	PTGER3	P43115	390 aa		18.23	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	AGTR2	P50052	363 aa		18.23	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	ACLY	P53396	1101 aa		18.23	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF177	Q13360	481 aa	Predicted RBP	18.23	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	ATP6AP1L	Q52LC2	224 aa		18.23	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	TTC33	Q6PID6	262 aa	Predicted RBP	18.23	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	EPHX4	Q8IUS5	362 aa		18.23	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	CMTR2	Q8IYT2	770 aa	Known RBP	18.23	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	CHCHD4	Q8N4Q1	142 aa		18.23	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	PDZD8	Q8NEN9	1154 aa		18.23	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	GIPC2	Q8TF65	315 aa		18.23	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	SEPT8	Q92599	483 aa		18.23	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	LINGO1	Q96FE5	620 aa		18.23	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	B3GALT6	Q96L58	329 aa		18.23	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	ELAC1	Q9H777	363 aa	Known RBP	18.23	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	DDX18	Q9NVP1	670 aa	Known RBP	18.23	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	GALP	Q9UBC7	116 aa		18.23	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	ACTL7A	Q9Y615	435 aa		18.23	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559		A0A1B0GTW7	788 aa		18.23	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	TRIM64C	A6NLI5	447 aa		18.23	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559		E5RI56	91 aa		18.23	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559		H7C0S8	307 aa		18.23	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	VNN2	O95498	520 aa		18.23	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	ENO2	P09104	434 aa	Predicted RBP	18.23	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	HTR1E	P28566	365 aa		18.23	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	UFM1	P61960	85 aa		18.23	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	PRKG2	Q13237	762 aa		18.23	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	SLC36A3	Q495N2	470 aa		18.23	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	ANKS3	Q6ZW76	656 aa		18.23	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	PIANP	Q8IYJ0	282 aa		18.23	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	SIDT2	Q8NBJ9	832 aa	Known RBP	18.23	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	CD200R1	Q8TD46	325 aa		18.23	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	DIS3L	Q8TF46	1054 aa	Known RBP	18.23	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	EXOC2	Q96KP1	924 aa		18.23	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	NUDT4	Q9NZJ9	180 aa		18.23	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	FKBPL	Q9UIM3	349 aa		18.23	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF225	Q9UK10	706 aa		18.23	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	TNPO3	Q9Y5L0	923 aa	Known RBP	18.23	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	KLHL33	A6NCF5	533 aa		18.22	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	ASPDH	A6ND91	283 aa		18.22	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	IFRD1	O00458	451 aa	Predicted RBP	18.22	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	E2F3	O00716	465 aa		18.22	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	DLGAP1	O14490	977 aa		18.22	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	TPST1	O60507	370 aa		18.22	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	SNAP91	O60641	907 aa		18.22	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	NIPSNAP2	O75323	286 aa		18.22	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	PRDX3	P30048	256 aa	Known RBP	18.22	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	OXTR	P30559	389 aa		18.22	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	RFC2	P35250	354 aa		18.22	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	ZFP36L2	P47974	494 aa	Known RBP	18.22	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	RPS24	P62847	133 aa	Known RBP	18.22	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	PRKCZ	Q05513	592 aa		18.22	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	LRRC23	Q53EV4	343 aa	Predicted RBP	18.22	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	RABL3	Q5HYI8	236 aa		18.22	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	C6orf136	Q5SQH8	315 aa		18.22	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	PSAPL1	Q6NUJ1	521 aa		18.22	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	FUT10	Q6P4F1	479 aa		18.22	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	LPCAT2	Q7L5N7	544 aa		18.22	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	SAPCD2	Q86UD0	394 aa		18.22	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	IFNE	Q86WN2	208 aa		18.22	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	ADAMTS16	Q8TE57	1224 aa		18.22	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	EEF1AKMT1	Q8WVE0	214 aa		18.22	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	OSCP1	Q8WVF1	389 aa		18.22	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	OVCA2	Q8WZ82	227 aa		18.22	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	GFM2	Q969S9	779 aa	Known RBP	18.22	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	PLD4	Q96BZ4	506 aa		18.22	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	TEX37	Q96LM6	180 aa		18.22	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF512	Q96ME7	567 aa	Predicted RBP	18.22	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	NSMCE3	Q96MG7	304 aa		18.22	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	GLT1D1	Q96MS3	346 aa		18.22	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	OAZ3	Q9UMX2	235 aa		18.22	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559		A0A1B0GVM2	712 aa		18.22	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	TCRBV5S2	A0A599	114 aa		18.22	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	FAM149A	A5PLN7	773 aa		18.22	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	PLOD2	O00469	737 aa		18.22	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	SYNCRIP	O60506	623 aa	Known RBP	18.22	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	NELFE	P18615	380 aa	Known RBP	18.22	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	CDKN1C	P49918	316 aa	Predicted RBP	18.22	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	BIRC2	Q13490	618 aa		18.22	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	FXN	Q16595	210 aa		18.22	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	ZRANB3	Q5FWF4	1079 aa		18.22	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	FBXO48	Q5FWF7	155 aa		18.22	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	PAGE3	Q5JUK9	113 aa		18.22	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	CTSL3P	Q5NE16	218 aa		18.22	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	RSPO2	Q6UXX9	243 aa	Predicted RBP	18.22	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	DENND1C	Q8IV53	801 aa		18.22	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	DPP10	Q8N608	796 aa		18.22	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	FNDC5	Q8NAU1	212 aa		18.22	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	FAM110B	Q8TC76	370 aa		18.22	■□□□□ 0.51

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