RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 PTSQ03393 145 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 BCL2L1Q07817 233 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 CDC16Q13042 620 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 CCNIQ14094 377 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 GPR33Q49SQ1 333 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 ACCSLQ4AC99 568 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 CARD16Q5EG05 197 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 LY6G5CQ5SRR4 150 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
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PTPRC-210ENST00000462363 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 RNF111Q6ZNA4 994 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 TPRG1Q6ZUI0 275 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 TSPAN33Q86UF1 283 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 SERPINA9Q86WD7 417 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 FUNDC1Q8IVP5 155 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 SCUBE1Q8IWY4 988 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 RBFAQ8N0V3 343 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 STK40Q8N2I9 435 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 NXPE1Q8N323 547 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 ELMOD1Q8N336 334 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 CCNYL1Q8N7R7 359 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
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PTPRC-210ENST00000462363 GPR26Q8NDV2 337 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 VN1R2Q8NFZ6 395 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 OR2A12Q8NGT7 310 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 CEP70Q8NHQ1 597 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 STAG3L4Q8TBR4 150 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 UBTD2Q8WUN7 234 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 NRG4Q8WWG1 115 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 DLG3Q92796 817 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 CMTM5Q96DZ9 223 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 ASIC4Q96FT7 647 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 CLPTM1LQ96KA5 538 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 GCNAQ96QF7 691 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 BOCQ9BWV1 1114 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 TNKS2Q9H2K2 1166 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 DCLRE1BQ9H816 532 aa5.59□□□□□ -1.51
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PTPRC-210ENST00000462363 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 BPIFA1Q9NP55 256 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 SPHK2Q9NRA0 654 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 TBC1D14Q9P2M4 693 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 CDYLQ9Y232 598 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 FAM50BQ9Y247 325 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 C15orf41Q9Y2V0 281 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 LRRC42Q9Y546 428 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 A0A1W2PQ67 120 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 H3BNX3 289 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 FXYD1O00168 92 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 E2F3O00716 465 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 FBP2O00757 339 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 TRIM24O15164 1050 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 TAPBPO15533 448 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 SMIM24O75264 130 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 TBX10O75333 385 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 VPS26AO75436 327 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 KRT36O76013 467 aa5.58□□□□□ -1.52
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PTPRC-210ENST00000462363 PSMG1O95456 288 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 CLDN7O95471 211 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 POP4O95707 220 aaKnown RBP5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 ESRRBO95718 433 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 LMNAP02545 664 aaKnown RBP5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 CAPNS1P04632 268 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 CYBBP04839 570 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 PYGLP06737 847 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 CTSLP07711 333 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 THRAP10827 490 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 TYRP14679 529 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 MYOGP15173 224 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 GPX3P22352 226 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 FCARP24071 287 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 PMLP29590 882 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 SPAM1P38567 509 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 RGS19P49795 217 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 CDH13P55290 713 aa5.58□□□□□ -1.52
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