RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497210.5

CTPS1-211, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 463 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-211ENST00000497210 NSD3Q9BZ95 1437 aa13.26□□□□□ -0.29
CTPS1-211ENST00000497210 CD163L1Q9NR16 1453 aa13.26□□□□□ -0.29
CTPS1-211ENST00000497210 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP13.25□□□□□ -0.29
CTPS1-211ENST00000497210 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP13.25□□□□□ -0.29
CTPS1-211ENST00000497210 NUTM2FA1L443 756 aa13.25□□□□□ -0.29
CTPS1-211ENST00000497210 PANK3Q9H999 370 aa13.25□□□□□ -0.29
CTPS1-211ENST00000497210 CABP1Q9NZU7 370 aa13.25□□□□□ -0.29
CTPS1-211ENST00000497210 KNSTRNQ9Y448 316 aa13.25□□□□□ -0.29
CTPS1-211ENST00000497210 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa13.25□□□□□ -0.29
CTPS1-211ENST00000497210 USP6P35125 1406 aa13.24□□□□□ -0.29
CTPS1-211ENST00000497210 CGNL1Q0VF96 1302 aa13.24□□□□□ -0.29
CTPS1-211ENST00000497210 PLEKHG3A1L390 1219 aa13.24□□□□□ -0.29
CTPS1-211ENST00000497210 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP13.24□□□□□ -0.29
CTPS1-211ENST00000497210 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa13.24□□□□□ -0.29
CTPS1-211ENST00000497210 ESCO1Q5FWF5 840 aa13.23□□□□□ -0.29
CTPS1-211ENST00000497210 EPAS1Q99814 870 aa13.23□□□□□ -0.29
CTPS1-211ENST00000497210 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa13.23□□□□□ -0.29
CTPS1-211ENST00000497210 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa13.23□□□□□ -0.29
CTPS1-211ENST00000497210 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa13.22□□□□□ -0.29
CTPS1-211ENST00000497210 NHSL1Q5SYE7 1610 aa13.22□□□□□ -0.29
CTPS1-211ENST00000497210 RIMBP2O15034 1052 aa13.22□□□□□ -0.29
CTPS1-211ENST00000497210 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP13.22□□□□□ -0.29
CTPS1-211ENST00000497210 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa13.21□□□□□ -0.29
CTPS1-211ENST00000497210 ACEP12821 1306 aa13.21□□□□□ -0.29
CTPS1-211ENST00000497210 NPHP3Q7Z494 1330 aa13.21□□□□□ -0.29
CTPS1-211ENST00000497210 ANP32CO43423 234 aa13.21□□□□□ -0.29
CTPS1-211ENST00000497210 ARSIQ5FYB1 569 aa13.21□□□□□ -0.29
CTPS1-211ENST00000497210 GPR153Q6NV75 609 aa13.21□□□□□ -0.29
CTPS1-211ENST00000497210 TTC21AQ8NDW8 1320 aa13.2□□□□□ -0.3
CTPS1-211ENST00000497210 NUDT7P0C024 238 aa13.2□□□□□ -0.3
CTPS1-211ENST00000497210 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP13.2□□□□□ -0.3
CTPS1-211ENST00000497210 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP13.2□□□□□ -0.3
CTPS1-211ENST00000497210 USP54Q70EL1 1684 aa13.2□□□□□ -0.3
CTPS1-211ENST00000497210 TOM1O60784 492 aa13.19□□□□□ -0.3
CTPS1-211ENST00000497210 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa13.19□□□□□ -0.3
CTPS1-211ENST00000497210 SLAIN2Q9P270 581 aa13.19□□□□□ -0.3
CTPS1-211ENST00000497210 PCDH10Q9P2E7 1040 aa13.19□□□□□ -0.3
CTPS1-211ENST00000497210 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP13.19□□□□□ -0.3
CTPS1-211ENST00000497210 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP13.19□□□□□ -0.3
CTPS1-211ENST00000497210 FCHSD2O94868 740 aa13.18□□□□□ -0.3
CTPS1-211ENST00000497210 PTGDRQ13258 359 aa13.18□□□□□ -0.3
CTPS1-211ENST00000497210 HIC1Q14526 733 aa13.18□□□□□ -0.3
CTPS1-211ENST00000497210 AK7Q96M32 723 aa13.18□□□□□ -0.3
CTPS1-211ENST00000497210 PIK3C2AO00443 1686 aa13.18□□□□□ -0.3
CTPS1-211ENST00000497210 GNPATO15228 680 aa13.17□□□□□ -0.3
CTPS1-211ENST00000497210 FOSBP53539 338 aa13.17□□□□□ -0.3
CTPS1-211ENST00000497210 TYW1BQ6NUM6 668 aa13.17□□□□□ -0.3
CTPS1-211ENST00000497210 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP13.17□□□□□ -0.3
CTPS1-211ENST00000497210 SSH2Q76I76 1423 aa13.16□□□□□ -0.3
CTPS1-211ENST00000497210 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP13.16□□□□□ -0.3
CTPS1-211ENST00000497210 PSME1Q06323 249 aa13.16□□□□□ -0.3
CTPS1-211ENST00000497210 BRINP3Q76B58 766 aa13.16□□□□□ -0.3
CTPS1-211ENST00000497210 ZNF710Q8N1W2 664 aa13.16□□□□□ -0.3
CTPS1-211ENST00000497210 FBXW7Q969H0 707 aa13.16□□□□□ -0.3
CTPS1-211ENST00000497210 ORAI2Q96SN7 254 aa13.16□□□□□ -0.3
CTPS1-211ENST00000497210 CDHR5Q9HBB8 845 aa13.16□□□□□ -0.3
CTPS1-211ENST00000497210 PXDNQ92626 1479 aa13.16□□□□□ -0.3
CTPS1-211ENST00000497210 TNS3Q68CZ2 1445 aa13.15□□□□□ -0.3
CTPS1-211ENST00000497210 MAP3K7O43318 606 aa13.15□□□□□ -0.3
CTPS1-211ENST00000497210 RALBP1Q15311 655 aa13.15□□□□□ -0.3
CTPS1-211ENST00000497210 CERKQ8TCT0 537 aa13.15□□□□□ -0.3
CTPS1-211ENST00000497210 CARD14Q9BXL6 1004 aa13.15□□□□□ -0.3
CTPS1-211ENST00000497210 SBNO1A3KN83 1393 aa13.15□□□□□ -0.3
CTPS1-211ENST00000497210 PARD3Q8TEW0 1356 aa13.15□□□□□ -0.3
CTPS1-211ENST00000497210 ALS2Q96Q42 1657 aa13.15□□□□□ -0.31
CTPS1-211ENST00000497210 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa13.14□□□□□ -0.31
CTPS1-211ENST00000497210 MAP2K5Q13163 448 aa13.14□□□□□ -0.31
CTPS1-211ENST00000497210 ARHGEF10O15013 1369 aa13.14□□□□□ -0.31
CTPS1-211ENST00000497210 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
CTPS1-211ENST00000497210 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa13.13□□□□□ -0.31
CTPS1-211ENST00000497210 OVOS2Q6IE36 1432 aa13.13□□□□□ -0.31
CTPS1-211ENST00000497210 PHLPP1O60346 1717 aa13.13□□□□□ -0.31
CTPS1-211ENST00000497210 UBAP1LF5GYI3 381 aa13.13□□□□□ -0.31
CTPS1-211ENST00000497210 FOXO3O43524 673 aa13.13□□□□□ -0.31
CTPS1-211ENST00000497210 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
CTPS1-211ENST00000497210 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP13.13□□□□□ -0.31
CTPS1-211ENST00000497210 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
CTPS1-211ENST00000497210 SNPHO15079 494 aa13.12□□□□□ -0.31
CTPS1-211ENST00000497210 FECHP22830 423 aa13.12□□□□□ -0.31
CTPS1-211ENST00000497210 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
CTPS1-211ENST00000497210 ZNF454Q8N9F8 522 aa13.12□□□□□ -0.31
CTPS1-211ENST00000497210 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
CTPS1-211ENST00000497210 COG3Q96JB2 828 aa13.12□□□□□ -0.31
CTPS1-211ENST00000497210 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
CTPS1-211ENST00000497210 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
CTPS1-211ENST00000497210 USP31Q70CQ4 1352 aa13.11□□□□□ -0.31
CTPS1-211ENST00000497210 NEUROD2Q15784 382 aa13.11□□□□□ -0.31
CTPS1-211ENST00000497210 KRT28Q7Z3Y7 464 aa13.11□□□□□ -0.31
CTPS1-211ENST00000497210 MORC1Q86VD1 984 aa13.11□□□□□ -0.31
CTPS1-211ENST00000497210 ZDHHC16Q969W1 377 aa13.1□□□□□ -0.31
CTPS1-211ENST00000497210 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
CTPS1-211ENST00000497210 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
CTPS1-211ENST00000497210 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
CTPS1-211ENST00000497210 SLIT3O75094 1523 aa13.09□□□□□ -0.31
CTPS1-211ENST00000497210 TRIM66O15016 1216 aa13.09□□□□□ -0.31
CTPS1-211ENST00000497210 FYB1O15117 783 aa13.09□□□□□ -0.31
CTPS1-211ENST00000497210 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
CTPS1-211ENST00000497210 NME9Q86XW9 330 aa13.09□□□□□ -0.31
CTPS1-211ENST00000497210 ABTB2Q8N961 1025 aa13.09□□□□□ -0.31
CTPS1-211ENST00000497210 CCDC102AQ96A19 550 aa13.09□□□□□ -0.31
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