RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482597.5

PTPRVP-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type V, pseudogene, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRVP, Length 3,999 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRVP-201ENST00000482597 ANO2Q9NQ90 1003 aa11.87□□□□□ -0.51
PTPRVP-201ENST00000482597 NPHP3Q7Z494 1330 aa11.87□□□□□ -0.51
PTPRVP-201ENST00000482597 FLT4P35916 1363 aa11.87□□□□□ -0.51
PTPRVP-201ENST00000482597 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa11.87□□□□□ -0.51
PTPRVP-201ENST00000482597 FLIIQ13045 1269 aa11.87□□□□□ -0.51
PTPRVP-201ENST00000482597 CCDC27Q2M243 656 aa11.87□□□□□ -0.51
PTPRVP-201ENST00000482597 NBPF6Q5VWK0 638 aa11.87□□□□□ -0.51
PTPRVP-201ENST00000482597 NBPF4Q96M43 638 aa11.87□□□□□ -0.51
PTPRVP-201ENST00000482597 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
PTPRVP-201ENST00000482597 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa11.87□□□□□ -0.51
PTPRVP-201ENST00000482597 KIF1BO60333 1816 aa11.87□□□□□ -0.51
PTPRVP-201ENST00000482597 ALDH1L2Q3SY69 923 aa11.86□□□□□ -0.51
PTPRVP-201ENST00000482597 CHD1LQ86WJ1 897 aa11.86□□□□□ -0.51
PTPRVP-201ENST00000482597 GPATCH3Q96I76 525 aa11.86□□□□□ -0.51
PTPRVP-201ENST00000482597 LGR6Q9HBX8 967 aa11.86□□□□□ -0.51
PTPRVP-201ENST00000482597 CEP152O94986 1710 aa11.86□□□□□ -0.51
PTPRVP-201ENST00000482597 C22orf23Q9BZE7 217 aa11.86□□□□□ -0.51
PTPRVP-201ENST00000482597 PI4KAP2A4QPH2 592 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRVP-201ENST00000482597 GOLGA6L22H0YM25 854 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRVP-201ENST00000482597 CCT4P50991 539 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
PTPRVP-201ENST00000482597 AMOTQ4VCS5 1084 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRVP-201ENST00000482597 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRVP-201ENST00000482597 MEIS3Q99687 375 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRVP-201ENST00000482597 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRVP-201ENST00000482597 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa11.84□□□□□ -0.51
PTPRVP-201ENST00000482597 RNF123Q5XPI4 1314 aa11.84□□□□□ -0.51
PTPRVP-201ENST00000482597 IP6K1Q92551 441 aa11.84□□□□□ -0.51
PTPRVP-201ENST00000482597 TSHZ3Q63HK5 1081 aa11.84□□□□□ -0.51
PTPRVP-201ENST00000482597 G2E3Q7L622 706 aa11.84□□□□□ -0.51
PTPRVP-201ENST00000482597 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa11.84□□□□□ -0.51
PTPRVP-201ENST00000482597 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
PTPRVP-201ENST00000482597 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa11.84□□□□□ -0.51
PTPRVP-201ENST00000482597 AAMPQ13685 434 aa11.83□□□□□ -0.52
PTPRVP-201ENST00000482597 CHPF2Q9P2E5 772 aa11.83□□□□□ -0.52
PTPRVP-201ENST00000482597 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
PTPRVP-201ENST00000482597 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa11.83□□□□□ -0.52
PTPRVP-201ENST00000482597 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa11.83□□□□□ -0.52
PTPRVP-201ENST00000482597 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
PTPRVP-201ENST00000482597 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa11.83□□□□□ -0.52
PTPRVP-201ENST00000482597 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
PTPRVP-201ENST00000482597 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa11.83□□□□□ -0.52
PTPRVP-201ENST00000482597 ABCA6Q8N139 1617 aa11.83□□□□□ -0.52
PTPRVP-201ENST00000482597 IL16Q14005 1332 aa11.83□□□□□ -0.52
PTPRVP-201ENST00000482597 NUTM1Q86Y26 1132 aa11.82□□□□□ -0.52
PTPRVP-201ENST00000482597 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
PTPRVP-201ENST00000482597 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
PTPRVP-201ENST00000482597 GCC1Q96CN9 775 aa11.82□□□□□ -0.52
PTPRVP-201ENST00000482597 IFNL2Q8IZJ0 200 aa11.82□□□□□ -0.52
PTPRVP-201ENST00000482597 SIRT1Q96EB6 747 aa11.82□□□□□ -0.52
PTPRVP-201ENST00000482597 NGLY1Q96IV0 654 aa11.82□□□□□ -0.52
PTPRVP-201ENST00000482597 ZBTB3Q9H5J0 574 aa11.81□□□□□ -0.52
PTPRVP-201ENST00000482597 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP11.81□□□□□ -0.52
PTPRVP-201ENST00000482597 TMEM94Q12767 1356 aa11.81□□□□□ -0.52
PTPRVP-201ENST00000482597 MYD88Q99836 296 aa11.81□□□□□ -0.52
PTPRVP-201ENST00000482597 SLAIN2Q9P270 581 aa11.81□□□□□ -0.52
PTPRVP-201ENST00000482597 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP11.81□□□□□ -0.52
PTPRVP-201ENST00000482597 PLEKHF1Q96S99 279 aa11.81□□□□□ -0.52
PTPRVP-201ENST00000482597 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
PTPRVP-201ENST00000482597 MADDQ8WXG6 1647 aa11.8□□□□□ -0.52
PTPRVP-201ENST00000482597 UBAP1LF5GYI3 381 aa11.8□□□□□ -0.52
PTPRVP-201ENST00000482597 LRRCC1Q9C099 1032 aa11.8□□□□□ -0.52
PTPRVP-201ENST00000482597 DNAAF4Q8WXU2 420 aa11.8□□□□□ -0.52
PTPRVP-201ENST00000482597 TMOD3Q9NYL9 352 aa11.8□□□□□ -0.52
PTPRVP-201ENST00000482597 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa11.8□□□□□ -0.52
PTPRVP-201ENST00000482597 KCNQ3O43525 872 aa11.79□□□□□ -0.52
PTPRVP-201ENST00000482597 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP11.79□□□□□ -0.52
PTPRVP-201ENST00000482597 ZFYVE9O95405 1425 aa11.79□□□□□ -0.52
PTPRVP-201ENST00000482597 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP11.79□□□□□ -0.52
PTPRVP-201ENST00000482597 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP11.79□□□□□ -0.52
PTPRVP-201ENST00000482597 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP11.79□□□□□ -0.52
PTPRVP-201ENST00000482597 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP11.79□□□□□ -0.52
PTPRVP-201ENST00000482597 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP11.79□□□□□ -0.52
PTPRVP-201ENST00000482597 ACSBG1Q96GR2 724 aa11.79□□□□□ -0.52
PTPRVP-201ENST00000482597 NLRP1Q9C000 1473 aa11.79□□□□□ -0.52
PTPRVP-201ENST00000482597 CDC45O75419 566 aa11.78□□□□□ -0.52
PTPRVP-201ENST00000482597 BICDL1Q6ZP65 573 aa11.78□□□□□ -0.52
PTPRVP-201ENST00000482597 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
PTPRVP-201ENST00000482597 TOMM22Q9NS69 142 aa11.78□□□□□ -0.52
PTPRVP-201ENST00000482597 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
PTPRVP-201ENST00000482597 BRPF3Q9ULD4 1205 aa11.78□□□□□ -0.52
PTPRVP-201ENST00000482597 SBNO1A3KN83 1393 aa11.78□□□□□ -0.52
PTPRVP-201ENST00000482597 REC8O95072 547 aa11.78□□□□□ -0.52
PTPRVP-201ENST00000482597 GPTP24298 496 aa11.78□□□□□ -0.52
PTPRVP-201ENST00000482597 IL17REQ8NFR9 667 aa11.78□□□□□ -0.52
PTPRVP-201ENST00000482597 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
PTPRVP-201ENST00000482597 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP11.78□□□□□ -0.52
PTPRVP-201ENST00000482597 ADGRB3O60242 1522 aa11.78□□□□□ -0.52
PTPRVP-201ENST00000482597 EXOC5O00471 708 aa11.77□□□□□ -0.52
PTPRVP-201ENST00000482597 AKAP4Q5JQC9 854 aa11.77□□□□□ -0.52
PTPRVP-201ENST00000482597 BTG4Q9NY30 223 aa11.77□□□□□ -0.52
PTPRVP-201ENST00000482597 ST18O60284 1047 aa11.77□□□□□ -0.52
PTPRVP-201ENST00000482597 COPS6Q7L5N1 327 aa11.77□□□□□ -0.52
PTPRVP-201ENST00000482597 ALKQ9UM73 1620 aa11.77□□□□□ -0.53
PTPRVP-201ENST00000482597 CHL1O00533 1208 aa11.77□□□□□ -0.53
PTPRVP-201ENST00000482597 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa11.77□□□□□ -0.53
PTPRVP-201ENST00000482597 ZNF521Q96K83 1311 aa11.76□□□□□ -0.53
PTPRVP-201ENST00000482597 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
PTPRVP-201ENST00000482597 KIF6Q6ZMV9 814 aa11.76□□□□□ -0.53
PTPRVP-201ENST00000482597 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
PTPRVP-201ENST00000482597 AACSQ86V21 672 aa11.76□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 170.1 ms