RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366554.2

OPN3-201, Transcript of opsin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene OPN3, Length 2,620 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN3-201ENST00000366554 PYCARDQ9ULZ3 195 aa26.33■■□□□ 1.8
OPN3-201ENST00000366554 ERC2O15083 957 aa26.32■■□□□ 1.8
OPN3-201ENST00000366554 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP26.32■■□□□ 1.8
OPN3-201ENST00000366554 CCDC183Q5T5S1 534 aa26.32■■□□□ 1.8
OPN3-201ENST00000366554 KNDC1Q76NI1 1749 aa26.32■■□□□ 1.8
OPN3-201ENST00000366554 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP26.31■■□□□ 1.8
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OPN3-201ENST00000366554 VWDEQ8N2E2 1590 aa26.29■■□□□ 1.8
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OPN3-201ENST00000366554 ATAD2Q6PL18 1390 aa26.28■■□□□ 1.8
OPN3-201ENST00000366554 TPM3P06753 285 aa26.28■■□□□ 1.8
OPN3-201ENST00000366554 SLFN14P0C7P3 912 aa26.27■■□□□ 1.8
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OPN3-201ENST00000366554 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa26.27■■□□□ 1.8
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OPN3-201ENST00000366554 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
OPN3-201ENST00000366554 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
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OPN3-201ENST00000366554 ATP10DQ9P241 1426 aa26.23■■□□□ 1.79
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OPN3-201ENST00000366554 TULP4Q9NRJ4 1543 aa26.2■■□□□ 1.78
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OPN3-201ENST00000366554 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP26.2■■□□□ 1.78
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OPN3-201ENST00000366554 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP26.19■■□□□ 1.78
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OPN3-201ENST00000366554 A0A1W2PP64 1363 aa26.18■■□□□ 1.78
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OPN3-201ENST00000366554 ZNF853P0CG23 659 aa26.17■■□□□ 1.78
OPN3-201ENST00000366554 ANAPC15P60006 121 aa26.17■■□□□ 1.78
OPN3-201ENST00000366554 TERF2Q15554 542 aa26.17■■□□□ 1.78
OPN3-201ENST00000366554 CEP85Q6P2H3 762 aa26.17■■□□□ 1.78
OPN3-201ENST00000366554 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP26.17■■□□□ 1.78
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OPN3-201ENST00000366554 FAM135BQ49AJ0 1406 aa26.17■■□□□ 1.78
OPN3-201ENST00000366554 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa26.17■■□□□ 1.78
OPN3-201ENST00000366554 GNAI1P63096 354 aa26.17■■□□□ 1.78
OPN3-201ENST00000366554 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP26.17■■□□□ 1.78
OPN3-201ENST00000366554 OSBPL3Q9H4L5 887 aa26.17■■□□□ 1.78
OPN3-201ENST00000366554 RGS12O14924 1447 aa26.16■■□□□ 1.78
OPN3-201ENST00000366554 SMTNL1A8MU46 457 aa26.16■■□□□ 1.78
OPN3-201ENST00000366554 MBIPQ9NS73 344 aa26.16■■□□□ 1.78
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OPN3-201ENST00000366554 AFAP1Q8N556 730 aa26.16■■□□□ 1.78
OPN3-201ENST00000366554 SPC24Q8NBT2 197 aa26.16■■□□□ 1.78
OPN3-201ENST00000366554 IL17RAQ96F46 866 aa26.16■■□□□ 1.78
OPN3-201ENST00000366554 CNPY2Q9Y2B0 182 aa26.16■■□□□ 1.78
OPN3-201ENST00000366554 PRKAR2BP31323 418 aa26.15■■□□□ 1.78
OPN3-201ENST00000366554 CABP2Q9NPB3 220 aa26.15■■□□□ 1.78
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OPN3-201ENST00000366554 KCNJ4P48050 445 aa26.14■■□□□ 1.78
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OPN3-201ENST00000366554 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa26.14■■□□□ 1.77
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OPN3-201ENST00000366554 MCCP23508 829 aa26.12■■□□□ 1.77
OPN3-201ENST00000366554 SLC20A2Q08357 652 aa26.12■■□□□ 1.77
OPN3-201ENST00000366554 FANCAO15360 1455 aa26.11■■□□□ 1.77
OPN3-201ENST00000366554 KIF3BO15066 747 aa26.11■■□□□ 1.77
OPN3-201ENST00000366554 PDE1AP54750 535 aa26.11■■□□□ 1.77
OPN3-201ENST00000366554 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP26.11■■□□□ 1.77
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