RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295874.14

PTPRG-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type G, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRG, Length 4,650 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Dendrite, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRG-201ENST00000295874 CHMP4CQ96CF2 233 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRG-201ENST00000295874 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
PTPRG-201ENST00000295874 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
PTPRG-201ENST00000295874 DCTN1Q14203 1278 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRG-201ENST00000295874 NASPP49321 788 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
PTPRG-201ENST00000295874 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRG-201ENST00000295874 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRG-201ENST00000295874 TRIM35Q9UPQ4 493 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRG-201ENST00000295874 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRG-201ENST00000295874 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
PTPRG-201ENST00000295874 NEK4P51957 841 aa14.81□□□□□ -0.04
PTPRG-201ENST00000295874 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa14.81□□□□□ -0.04
PTPRG-201ENST00000295874 CLASP1Q7Z460 1538 aa14.81□□□□□ -0.04
PTPRG-201ENST00000295874 VAMP4O75379 141 aa14.8□□□□□ -0.04
PTPRG-201ENST00000295874 SNX21Q969T3 373 aa14.8□□□□□ -0.04
PTPRG-201ENST00000295874 LRRCC1Q9C099 1032 aa14.8□□□□□ -0.04
PTPRG-201ENST00000295874 PTPRCP08575 1304 aa14.8□□□□□ -0.04
PTPRG-201ENST00000295874 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
PTPRG-201ENST00000295874 TPM1P09493 284 aa14.8□□□□□ -0.04
PTPRG-201ENST00000295874 CDR1P51861 262 aa14.8□□□□□ -0.04
PTPRG-201ENST00000295874 EFCAB6Q5THR3 1501 aa14.8□□□□□ -0.04
PTPRG-201ENST00000295874 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
PTPRG-201ENST00000295874 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
PTPRG-201ENST00000295874 MCM10Q7L590 875 aa14.79□□□□□ -0.04
PTPRG-201ENST00000295874 MBD3O95983 291 aa14.79□□□□□ -0.04
PTPRG-201ENST00000295874 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
PTPRG-201ENST00000295874 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
PTPRG-201ENST00000295874 FBLN1P23142 703 aa14.79□□□□□ -0.04
PTPRG-201ENST00000295874 E9PCH4 1651 aa14.79□□□□□ -0.04
PTPRG-201ENST00000295874 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRG-201ENST00000295874 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRG-201ENST00000295874 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
PTPRG-201ENST00000295874 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
PTPRG-201ENST00000295874 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
PTPRG-201ENST00000295874 MLH3Q9UHC1 1453 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRG-201ENST00000295874 DDX58O95786 925 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
PTPRG-201ENST00000295874 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
PTPRG-201ENST00000295874 CREBRFQ8IUR6 639 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRG-201ENST00000295874 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
PTPRG-201ENST00000295874 CCDC173Q0VFZ6 552 aa14.77□□□□□ -0.04
PTPRG-201ENST00000295874 NLRP2Q9NX02 1062 aa14.77□□□□□ -0.04
PTPRG-201ENST00000295874 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa14.77□□□□□ -0.04
PTPRG-201ENST00000295874 CFAP74Q9C0B2 1584 aa14.77□□□□□ -0.04
PTPRG-201ENST00000295874 NEO1Q92859 1461 aa14.77□□□□□ -0.04
PTPRG-201ENST00000295874 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.04
PTPRG-201ENST00000295874 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.04
PTPRG-201ENST00000295874 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.04
PTPRG-201ENST00000295874 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa14.77□□□□□ -0.04
PTPRG-201ENST00000295874 RIMS2Q9UQ26 1411 aa14.77□□□□□ -0.04
PTPRG-201ENST00000295874 SURF6O75683 361 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
PTPRG-201ENST00000295874 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
PTPRG-201ENST00000295874 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
PTPRG-201ENST00000295874 TEX35Q5T0J7 233 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRG-201ENST00000295874 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRG-201ENST00000295874 ABTB2Q8N961 1025 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRG-201ENST00000295874 PHACTR3Q96KR7 559 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRG-201ENST00000295874 FAM83GA6ND36 823 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRG-201ENST00000295874 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
PTPRG-201ENST00000295874 SLC26A8Q96RN1 970 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRG-201ENST00000295874 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
PTPRG-201ENST00000295874 NUTM2GQ5VZR2 741 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRG-201ENST00000295874 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
PTPRG-201ENST00000295874 CNTROBQ8N137 903 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRG-201ENST00000295874 C8orf58Q8NAV2 365 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRG-201ENST00000295874 TTC22Q5TAA0 569 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRG-201ENST00000295874 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
PTPRG-201ENST00000295874 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
PTPRG-201ENST00000295874 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
PTPRG-201ENST00000295874 TSPYL6Q8N831 410 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRG-201ENST00000295874 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
PTPRG-201ENST00000295874 TPM2P07951 284 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRG-201ENST00000295874 ANKRD44Q8N8A2 993 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRG-201ENST00000295874 SMC3Q9UQE7 1217 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRG-201ENST00000295874 RBM25P49756 843 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
PTPRG-201ENST00000295874 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
PTPRG-201ENST00000295874 PES1O00541 588 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
PTPRG-201ENST00000295874 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
PTPRG-201ENST00000295874 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
PTPRG-201ENST00000295874 CCDC191Q8NCU4 936 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRG-201ENST00000295874 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
PTPRG-201ENST00000295874 GNAT3A8MTJ3 354 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRG-201ENST00000295874 PLEKHF1Q96S99 279 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRG-201ENST00000295874 ESPNB1AK53 854 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRG-201ENST00000295874 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
PTPRG-201ENST00000295874 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP14.72□□□□□ -0.05
PTPRG-201ENST00000295874 VSIG10Q8N0Z9 540 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRG-201ENST00000295874 MIS18AQ9NYP9 233 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRG-201ENST00000295874 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRG-201ENST00000295874 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
PTPRG-201ENST00000295874 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
PTPRG-201ENST00000295874 DCTPP1Q9H773 170 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRG-201ENST00000295874 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
PTPRG-201ENST00000295874 ACEP12821 1306 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRG-201ENST00000295874 SSFA2P28290 1259 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRG-201ENST00000295874 RNF20Q5VTR2 975 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRG-201ENST00000295874 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
PTPRG-201ENST00000295874 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
PTPRG-201ENST00000295874 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
PTPRG-201ENST00000295874 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
PTPRG-201ENST00000295874 MX1P20591 662 aa14.71□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 94.2 ms