RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000518916.5

MSC-AS1-204, MSC antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene MSC-AS1, Length 864 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSC-AS1-204ENST00000518916 GPR22Q99680 433 aa14.67□□□□□ -0.06
MSC-AS1-204ENST00000518916 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa14.67□□□□□ -0.06
MSC-AS1-204ENST00000518916 FAM96AQ9H5X1 160 aa14.67□□□□□ -0.06
MSC-AS1-204ENST00000518916 PREBQ9HCU5 417 aa14.67□□□□□ -0.06
MSC-AS1-204ENST00000518916 SERGEFQ9UGK8 458 aa14.67□□□□□ -0.06
MSC-AS1-204ENST00000518916 CD84Q9UIB8 345 aa14.67□□□□□ -0.06
MSC-AS1-204ENST00000518916 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
MSC-AS1-204ENST00000518916 ACTL7BQ9Y614 415 aa14.67□□□□□ -0.06
MSC-AS1-204ENST00000518916 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa14.66□□□□□ -0.06
MSC-AS1-204ENST00000518916 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa14.66□□□□□ -0.06
MSC-AS1-204ENST00000518916 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
MSC-AS1-204ENST00000518916 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
MSC-AS1-204ENST00000518916 MMP20O60882 483 aa14.66□□□□□ -0.06
MSC-AS1-204ENST00000518916 TM7SF2O76062 418 aa14.66□□□□□ -0.06
MSC-AS1-204ENST00000518916 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
MSC-AS1-204ENST00000518916 S1PR4O95977 384 aa14.66□□□□□ -0.06
MSC-AS1-204ENST00000518916 AHSGP02765 367 aa14.66□□□□□ -0.06
MSC-AS1-204ENST00000518916 AVPR2P30518 371 aa14.66□□□□□ -0.06
MSC-AS1-204ENST00000518916 HPDP32754 393 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
MSC-AS1-204ENST00000518916 ABCG1P45844 678 aa14.66□□□□□ -0.06
MSC-AS1-204ENST00000518916 POLD2P49005 469 aa14.66□□□□□ -0.06
MSC-AS1-204ENST00000518916 ADPRHP54922 357 aa14.66□□□□□ -0.06
MSC-AS1-204ENST00000518916 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
MSC-AS1-204ENST00000518916 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa14.66□□□□□ -0.06
MSC-AS1-204ENST00000518916 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa14.66□□□□□ -0.06
MSC-AS1-204ENST00000518916 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa14.66□□□□□ -0.06
MSC-AS1-204ENST00000518916 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
MSC-AS1-204ENST00000518916 RBFAQ8N0V3 343 aa14.66□□□□□ -0.06
MSC-AS1-204ENST00000518916 TRAM1L1Q8N609 369 aa14.66□□□□□ -0.06
MSC-AS1-204ENST00000518916 DTX3LQ8TDB6 740 aa14.66□□□□□ -0.06
MSC-AS1-204ENST00000518916 FAM131CQ96AQ9 280 aa14.66□□□□□ -0.06
MSC-AS1-204ENST00000518916 AP2M1Q96CW1 435 aa14.66□□□□□ -0.06
MSC-AS1-204ENST00000518916 TSPAN17Q96FV3 270 aa14.66□□□□□ -0.06
MSC-AS1-204ENST00000518916 SELENOSQ9BQE4 189 aa14.66□□□□□ -0.06
MSC-AS1-204ENST00000518916 IER2Q9BTL4 223 aa14.66□□□□□ -0.06
MSC-AS1-204ENST00000518916 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa14.66□□□□□ -0.06
MSC-AS1-204ENST00000518916 CHRDQ9H2X0 955 aa14.66□□□□□ -0.06
MSC-AS1-204ENST00000518916 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa14.66□□□□□ -0.06
MSC-AS1-204ENST00000518916 COQ6Q9Y2Z9 468 aa14.66□□□□□ -0.06
MSC-AS1-204ENST00000518916 TPP1O14773 563 aa14.65□□□□□ -0.06
MSC-AS1-204ENST00000518916 HAUS5O94927 633 aa14.65□□□□□ -0.06
MSC-AS1-204ENST00000518916 F7P08709 466 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
MSC-AS1-204ENST00000518916 PRSS56P0CW18 603 aa14.65□□□□□ -0.06
MSC-AS1-204ENST00000518916 C7P10643 843 aa14.65□□□□□ -0.06
MSC-AS1-204ENST00000518916 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
MSC-AS1-204ENST00000518916 NR1D1P20393 614 aa14.65□□□□□ -0.06
MSC-AS1-204ENST00000518916 ACRV1P26436 265 aa14.65□□□□□ -0.06
MSC-AS1-204ENST00000518916 PTGER3P43115 390 aa14.65□□□□□ -0.06
MSC-AS1-204ENST00000518916 RPS9P46781 194 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
MSC-AS1-204ENST00000518916 TAS2R38P59533 333 aa14.65□□□□□ -0.06
MSC-AS1-204ENST00000518916 RPS21P63220 83 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
MSC-AS1-204ENST00000518916 SEMA3AQ14563 771 aa14.65□□□□□ -0.06
MSC-AS1-204ENST00000518916 ITIH4Q14624 930 aa14.65□□□□□ -0.06
MSC-AS1-204ENST00000518916 USP10Q14694 798 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
MSC-AS1-204ENST00000518916 DBN1Q16643 649 aa14.65□□□□□ -0.06
MSC-AS1-204ENST00000518916 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
MSC-AS1-204ENST00000518916 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
MSC-AS1-204ENST00000518916 ANO7Q6IWH7 933 aa14.65□□□□□ -0.06
MSC-AS1-204ENST00000518916 FAM45BPQ6NSW5 357 aa14.65□□□□□ -0.06
MSC-AS1-204ENST00000518916 NEK5Q6P3R8 708 aa14.65□□□□□ -0.06
MSC-AS1-204ENST00000518916 CNSTQ6PJW8 725 aa14.65□□□□□ -0.06
MSC-AS1-204ENST00000518916 TIFABQ6ZNK6 161 aa14.65□□□□□ -0.06
MSC-AS1-204ENST00000518916 RFLNAQ6ZTI6 216 aa14.65□□□□□ -0.06
MSC-AS1-204ENST00000518916 MICALCLQ6ZW33 695 aa14.65□□□□□ -0.06
MSC-AS1-204ENST00000518916 FAM124AQ86V42 546 aa14.65□□□□□ -0.06
MSC-AS1-204ENST00000518916 SERPINA9Q86WD7 417 aa14.65□□□□□ -0.06
MSC-AS1-204ENST00000518916 PIANPQ8IYJ0 282 aa14.65□□□□□ -0.06
MSC-AS1-204ENST00000518916 NXPE1Q8N323 547 aa14.65□□□□□ -0.06
MSC-AS1-204ENST00000518916 DCLK2Q8N568 766 aa14.65□□□□□ -0.06
MSC-AS1-204ENST00000518916 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa14.65□□□□□ -0.06
MSC-AS1-204ENST00000518916 FAM76AQ8TAV0 307 aa14.65□□□□□ -0.06
MSC-AS1-204ENST00000518916 FAM45AQ8TCE6 357 aa14.65□□□□□ -0.06
MSC-AS1-204ENST00000518916 ACMSDQ8TDX5 336 aa14.65□□□□□ -0.06
MSC-AS1-204ENST00000518916 MZB1Q8WU39 189 aa14.65□□□□□ -0.06
MSC-AS1-204ENST00000518916 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
MSC-AS1-204ENST00000518916 CABS1Q96KC9 395 aa14.65□□□□□ -0.06
MSC-AS1-204ENST00000518916 HHIPQ96QV1 700 aa14.65□□□□□ -0.06
MSC-AS1-204ENST00000518916 MCMBPQ9BTE3 642 aa14.65□□□□□ -0.06
MSC-AS1-204ENST00000518916 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
MSC-AS1-204ENST00000518916 ABCG8Q9H221 673 aa14.65□□□□□ -0.06
MSC-AS1-204ENST00000518916 KDM4CQ9H3R0 1056 aa14.65□□□□□ -0.06
MSC-AS1-204ENST00000518916 SMOXQ9NWM0 555 aa14.65□□□□□ -0.06
MSC-AS1-204ENST00000518916 FAM53CQ9NYF3 392 aa14.65□□□□□ -0.06
MSC-AS1-204ENST00000518916 OGFRQ9NZT2 677 aa14.65□□□□□ -0.06
MSC-AS1-204ENST00000518916 SLC39A10Q9ULF5 831 aa14.65□□□□□ -0.06
MSC-AS1-204ENST00000518916 CRYL1Q9Y2S2 319 aa14.65□□□□□ -0.06
MSC-AS1-204ENST00000518916 SIT1Q9Y3P8 196 aa14.65□□□□□ -0.06
MSC-AS1-204ENST00000518916 COMMD10Q9Y6G5 202 aa14.65□□□□□ -0.06
MSC-AS1-204ENST00000518916 LRRK1Q38SD2 2015 aa14.65□□□□□ -0.06
MSC-AS1-204ENST00000518916 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa14.64□□□□□ -0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 PRR23AA6NEV1 266 aa14.64□□□□□ -0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 LRRC72A6NJI9 287 aa14.64□□□□□ -0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 CFAP99D6REC4 459 aa14.64□□□□□ -0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 F8W8V4 182 aa14.64□□□□□ -0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 GPR39O43194 453 aa14.64□□□□□ -0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 APBB3O95704 486 aa14.64□□□□□ -0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 PYGLP06737 847 aa14.64□□□□□ -0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 BRAFP15056 766 aa14.64□□□□□ -0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 STMN1P16949 149 aa14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28 ms