RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509638.5

LIMCH1-211, Transcript of LIM and calponin homology domains 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LIMCH1, Length 1,570 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMCH1-211ENST00000509638 MAGEB16A2A368 324 aa29.41■■■□□ 2.3
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LIMCH1-211ENST00000509638 ELK3P41970 407 aa29.41■■■□□ 2.3
LIMCH1-211ENST00000509638 PRAMEP78395 509 aa29.41■■■□□ 2.3
LIMCH1-211ENST00000509638 NFATC2Q13469 925 aa29.41■■■□□ 2.3
LIMCH1-211ENST00000509638 CUL1Q13616 776 aa29.41■■■□□ 2.3
LIMCH1-211ENST00000509638 ITGA9Q13797 1035 aa29.41■■■□□ 2.3
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LIMCH1-211ENST00000509638 IFT20Q8IY31 132 aa29.41■■■□□ 2.3
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LIMCH1-211ENST00000509638 FSCN3Q9NQT6 498 aa29.41■■■□□ 2.3
LIMCH1-211ENST00000509638 TEX264Q9Y6I9 313 aa29.41■■■□□ 2.3
LIMCH1-211ENST00000509638 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa29.41■■■□□ 2.3
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LIMCH1-211ENST00000509638 KIAA1024LP59773 190 aa29.4■■■□□ 2.3
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LIMCH1-211ENST00000509638 TCEAL6Q6IPX3 200 aa29.4■■■□□ 2.3
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LIMCH1-211ENST00000509638 CCDC25Q86WR0 208 aa29.4■■■□□ 2.3
LIMCH1-211ENST00000509638 TCEAL3Q969E4 200 aa29.4■■■□□ 2.3
LIMCH1-211ENST00000509638 GLYATL1Q969I3 302 aa29.4■■■□□ 2.3
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LIMCH1-211ENST00000509638 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa29.4■■■□□ 2.3
LIMCH1-211ENST00000509638 ZNF292O60281 2723 aa29.4■■■□□ 2.3
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LIMCH1-211ENST00000509638 UGT1A6P19224 532 aa29.39■■■□□ 2.3
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LIMCH1-211ENST00000509638 UGT1A1P22309 533 aa29.39■■■□□ 2.3
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LIMCH1-211ENST00000509638 ANKMY2Q8IV38 441 aa29.39■■■□□ 2.3
LIMCH1-211ENST00000509638 ZBED8Q8IZ13 594 aa29.39■■■□□ 2.3
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LIMCH1-211ENST00000509638 HIC2Q96JB3 615 aa29.39■■■□□ 2.3
LIMCH1-211ENST00000509638 VPS35Q96QK1 796 aa29.39■■■□□ 2.3
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LIMCH1-211ENST00000509638 UGT1A7Q9HAW7 530 aa29.39■■■□□ 2.3
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LIMCH1-211ENST00000509638 UGT1A8Q9HAW9 530 aa29.39■■■□□ 2.3
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LIMCH1-211ENST00000509638 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP29.38■■■□□ 2.29
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LIMCH1-211ENST00000509638 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP29.38■■■□□ 2.29
LIMCH1-211ENST00000509638 V9GYY5 206 aaPredicted RBP29.38■■■□□ 2.29
LIMCH1-211ENST00000509638 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa29.37■■■□□ 2.29
LIMCH1-211ENST00000509638 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP29.37■■■□□ 2.29
LIMCH1-211ENST00000509638 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP29.37■■■□□ 2.29
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