RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473406.5

RABGGTB-209, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 721 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-209ENST00000473406 EXT2Q93063 718 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 TEKT1Q969V4 418 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF570Q96NI8 536 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 MVB12BQ9H7P6 319 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 ANKRD10Q9NXR5 420 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 ERAP1Q9NZ08 941 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 HEY2Q9UBP5 337 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC24A2Q9UI40 661 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 BLOC1S6Q9UL45 172 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 WNT6Q9Y6F9 365 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 KANSL1LA0AUZ9 987 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC22A23A1A5C7 686 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 DPPA5A6NC42 116 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 MAP2K7O14733 419 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 PRPSAP2O60256 369 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 INHBAP08476 426 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 PTGS2P35354 604 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 NAGLUP54802 743 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 STARD6P59095 220 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 NPRL3Q12980 569 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 SHEQ5VZ18 495 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 NCAPH2Q6IBW4 605 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 RHOUQ7L0Q8 258 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 LCA5Q86VQ0 697 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 C1orf210Q8IVY1 113 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 TIGD4Q8IY51 512 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF595Q8IYB9 648 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 KDM1BQ8NB78 822 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 PSMA8Q8TAA3 256 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 PROKR1Q8TCW9 393 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 ROBO4Q8WZ75 1007 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 OTULINQ96BN8 352 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 PRAM1Q96QH2 718 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 DDOQ99489 341 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 INPP5KQ9BT40 448 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 CACNG6Q9BXT2 260 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 C1orf21Q9H246 121 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 GPR108Q9NPR9 543 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 COG5Q9UP83 839 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 RAP2CQ9Y3L5 183 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 A0A1W2PPM1 405 aa6.03□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC30A4O14863 429 aa6.03□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 TXNL1O43396 289 aa6.03□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 TLR2O60603 784 aa6.03□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 PRAMEF11O60813 436 aa6.03□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 CREG1O75629 220 aa6.03□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 RGS11O94810 467 aa6.03□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 VIMP08670 466 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 HKR1P10072 659 aa6.03□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 CDC25CP30307 473 aa6.03□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC16A2P36021 539 aa6.03□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 SNU13P55769 128 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 PPP2R2BQ00005 443 aa6.03□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 TAZQ16635 292 aa6.03□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa6.03□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa6.03□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 RABEPKQ7Z6M1 372 aa6.03□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 LCORLQ8N3X6 602 aa6.03□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 LRRC57Q8N9N7 239 aa6.03□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 TAS1R2Q8TE23 839 aa6.03□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 HAS1Q92839 578 aa6.03□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 SPSB1Q96BD6 273 aa6.03□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 NLRP4Q96MN2 994 aa6.03□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 TSGA13Q96PP4 275 aa6.03□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 FZD8Q9H461 694 aa6.03□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 TMEM206Q9H813 350 aa6.03□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 ITGA11Q9UKX5 1188 aa6.03□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa6.03□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 FOXO6A8MYZ6 492 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 FAM86B1E9PN63 330 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 RHODO00212 210 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 GUCA1CO95843 209 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 WNT1P04628 370 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 MMP3P08254 477 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 FAM86B2P0C5J1 330 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 NR2F2P24468 414 aa6.02□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.1 ms