RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366687.5

CCSAP-203, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,089 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-203ENST00000366687 TDRPQ86YL5 185 aa20.19■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 ABCG8Q9H221 673 aa20.19■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 EPB41L1Q9H4G0 881 aa20.19■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 EXD2Q9NVH0 621 aa20.19■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 MFN2O95140 757 aa20.19■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 NFATC1O95644 943 aa20.19■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 ANKRD22Q5VYY1 191 aa20.19■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 FAM220AQ7Z4H9 259 aa20.19■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 ZBTB2Q8N680 514 aa20.19■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 SPATA22Q8NHS9 363 aa20.19■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa20.19■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 FAM83DQ9H4H8 585 aa20.19■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 NMUR1Q9HB89 426 aa20.19■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 DIABLOQ9NR28 239 aa20.19■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 LGALS13Q9UHV8 139 aa20.19■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 PMM2O15305 246 aa20.19■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 WFS1O76024 890 aa20.19■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 CHRNB2P17787 502 aa20.19■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 NPY5RQ15761 445 aa20.19■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 GALNT18Q6P9A2 607 aa20.19■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 KLHL17Q6TDP4 642 aa20.19■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 DSELQ8IZU8 1212 aa20.19■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 DPEP3Q9H4B8 488 aa20.19■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 SNPHO15079 494 aa20.18■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 PRNPP04156 253 aa20.18■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 NR2F6P10588 404 aa20.18■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 FOLH1Q04609 750 aa20.18■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 OR10G6Q8NH81 332 aa20.18■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 UBASH3BQ8TF42 649 aa20.18■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 RACGAP1Q9H0H5 632 aa20.18■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 C8orf4Q9NR00 106 aa20.18■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 PTGFRNQ9P2B2 879 aa20.18■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 SLC28A2O43868 658 aa20.18■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 CCNDBP1O95273 360 aa20.18■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 GSTT1P30711 240 aa20.18■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 IL12RB1P42701 662 aa20.18■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 ACAP2Q15057 778 aa20.18■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 PPM1JQ5JR12 505 aa20.18■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 FAM180AQ6UWF9 173 aa20.18■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 ADCY4Q8NFM4 1077 aa20.18■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 ADGRE2Q9UHX3 823 aa20.18■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 PLIN3O60664 434 aa20.18■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 SEC24AO95486 1093 aa20.18■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 RCVRNP35243 200 aa20.18■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 GK5Q6ZS86 529 aa20.18■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa20.18■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 PYROXD2Q8N2H3 581 aa20.18■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 SEMA3GQ9NS98 782 aa20.18■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 MIOSQ9NXC5 875 aa20.18■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 CLIC5Q9NZA1 410 aa20.18■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 RAB23Q9ULC3 237 aa20.18■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 LCP2Q13094 533 aa20.18■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 ZYG11AQ6WRX3 759 aa20.18■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 NPAS4Q8IUM7 802 aa20.18■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 FAM13CQ8NE31 585 aa20.18■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 OR7D4Q8NG98 312 aa20.18■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa20.18■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa20.18■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 STBD1O95210 358 aa20.17■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 PCSK2P16519 638 aa20.17■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 ITGADQ13349 1161 aa20.17■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 TOMM20Q15388 145 aa20.17■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 TSTD2Q5T7W7 516 aa20.17■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 ERICH5Q6P6B1 374 aa20.17■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 OR4A15Q8NGL6 344 aa20.17■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 PPM1MQ96MI6 270 aa20.17■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 BTBD9Q96Q07 612 aa20.17■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 DNAJC28Q9NX36 388 aa20.17■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 NUDT4Q9NZJ9 180 aa20.17■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 PER2O15055 1255 aa20.17■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 PRAMEF1O95521 474 aa20.17■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 C22orf31O95567 290 aa20.17■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 EOMESO95936 686 aa20.17■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 CDK9P50750 372 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 TMPRSS11BQ86T26 416 aa20.17■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 CNTD1Q8N815 330 aa20.17■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 TEX47Q8TBZ9 253 aa20.17■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 TWIST2Q8WVJ9 160 aa20.17■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 IPPKQ9H8X2 491 aa20.17■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 ERN1O75460 977 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 TM7SF2O76062 418 aa20.17■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 APODP05090 189 aa20.17■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 CCR3P51677 355 aa20.17■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 MPP1Q00013 466 aa20.17■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 IL10RBQ08334 325 aa20.17■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 MZT2BQ6NZ67 158 aa20.17■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 PCDH19Q8TAB3 1148 aa20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23 ms