RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 IMPDH1P20839 514 aa17.78■□□□□ 0.44
ACTB-201ENST00000331789 RAD51Q06609 339 aa17.78■□□□□ 0.44
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ACTB-201ENST00000331789 PARP9Q8IXQ6 854 aa17.78■□□□□ 0.44
ACTB-201ENST00000331789 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP17.78■□□□□ 0.44
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ACTB-201ENST00000331789 MRGPRX3Q96LB0 322 aa17.78■□□□□ 0.44
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ACTB-201ENST00000331789 TAGLN3Q9UI15 199 aa17.77■□□□□ 0.44
ACTB-201ENST00000331789 E9PBE3 544 aa17.76■□□□□ 0.43
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ACTB-201ENST00000331789 KDSRQ06136 332 aa17.76■□□□□ 0.43
ACTB-201ENST00000331789 CHRNA6Q15825 494 aa17.76■□□□□ 0.43
ACTB-201ENST00000331789 UNC50Q53HI1 259 aa17.76■□□□□ 0.43
ACTB-201ENST00000331789 ZNF678Q5SXM1 525 aa17.76■□□□□ 0.43
ACTB-201ENST00000331789 TPRG1Q6ZUI0 275 aa17.76■□□□□ 0.43
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ACTB-201ENST00000331789 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa17.76■□□□□ 0.43
ACTB-201ENST00000331789 CD200R1Q8TD46 325 aa17.76■□□□□ 0.43
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ACTB-201ENST00000331789 KLHL32Q96NJ5 620 aa17.76■□□□□ 0.43
ACTB-201ENST00000331789 LYSMD1Q96S90 227 aa17.76■□□□□ 0.43
ACTB-201ENST00000331789 BOCQ9BWV1 1114 aa17.76■□□□□ 0.43
ACTB-201ENST00000331789 APOL5Q9BWW9 433 aa17.76■□□□□ 0.43
ACTB-201ENST00000331789 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP17.76■□□□□ 0.43
ACTB-201ENST00000331789 MTG2Q9H4K7 406 aa17.76■□□□□ 0.43
ACTB-201ENST00000331789 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP17.76■□□□□ 0.43
ACTB-201ENST00000331789 VTI1BQ9UEU0 232 aa17.76■□□□□ 0.43
ACTB-201ENST00000331789 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP17.76■□□□□ 0.43
ACTB-201ENST00000331789 FBXO10Q9UK96 956 aa17.76■□□□□ 0.43
ACTB-201ENST00000331789 SORCS3Q9UPU3 1222 aa17.76■□□□□ 0.43
ACTB-201ENST00000331789 PPIL1Q9Y3C6 166 aa17.76■□□□□ 0.43
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ACTB-201ENST00000331789 CERS6Q6ZMG9 384 aa17.76■□□□□ 0.43
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ACTB-201ENST00000331789 C12orf40Q86WS4 652 aa17.76■□□□□ 0.43
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ACTB-201ENST00000331789 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP17.76■□□□□ 0.43
ACTB-201ENST00000331789 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP17.76■□□□□ 0.43
ACTB-201ENST00000331789 GPR26Q8NDV2 337 aa17.76■□□□□ 0.43
ACTB-201ENST00000331789 FBXO27Q8NI29 283 aa17.76■□□□□ 0.43
ACTB-201ENST00000331789 FRS2Q8WU20 508 aa17.76■□□□□ 0.43
ACTB-201ENST00000331789 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa17.76■□□□□ 0.43
ACTB-201ENST00000331789 OSCP1Q8WVF1 389 aa17.76■□□□□ 0.43
ACTB-201ENST00000331789 L3HYPDHQ96EM0 354 aa17.76■□□□□ 0.43
ACTB-201ENST00000331789 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP17.76■□□□□ 0.43
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