RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428120.5

FAAP20-209, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene FAAP20, Length 2,313 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-209ENST00000428120 CNDP1Q96KN2 507 aa23.1■■□□□ 1.29
FAAP20-209ENST00000428120 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa23.1■■□□□ 1.29
FAAP20-209ENST00000428120 POPDC3Q9HBV1 291 aa23.1■■□□□ 1.29
FAAP20-209ENST00000428120 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa23.1■■□□□ 1.29
FAAP20-209ENST00000428120 WNT6Q9Y6F9 365 aa23.1■■□□□ 1.29
FAAP20-209ENST00000428120 ANKRD12Q6UB98 2062 aa23.1■■□□□ 1.29
FAAP20-209ENST00000428120 GOLGA8CPA6NN73 597 aa23.09■■□□□ 1.29
FAAP20-209ENST00000428120 UBXN8O00124 270 aa23.09■■□□□ 1.29
FAAP20-209ENST00000428120 CLDN7O95471 211 aa23.09■■□□□ 1.29
FAAP20-209ENST00000428120 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
FAAP20-209ENST00000428120 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
FAAP20-209ENST00000428120 AGAP11Q8TF27 550 aa23.09■■□□□ 1.29
FAAP20-209ENST00000428120 HECAQ9UBI9 543 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
FAAP20-209ENST00000428120 IKZF3Q9UKT9 509 aa23.09■■□□□ 1.29
FAAP20-209ENST00000428120 IQCF5A8MTL0 148 aa23.09■■□□□ 1.29
FAAP20-209ENST00000428120 H7C0S8 307 aa23.09■■□□□ 1.29
FAAP20-209ENST00000428120 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
FAAP20-209ENST00000428120 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
FAAP20-209ENST00000428120 PKMP14618 531 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
FAAP20-209ENST00000428120 TYRP14679 529 aa23.09■■□□□ 1.29
FAAP20-209ENST00000428120 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP23.09■■□□□ 1.297e-8■■■□□ 17.2
FAAP20-209ENST00000428120 MXRA7P84157 204 aa23.09■■□□□ 1.29
FAAP20-209ENST00000428120 NXNQ6DKJ4 435 aa23.09■■□□□ 1.29
FAAP20-209ENST00000428120 SLC22A9Q8IVM8 553 aa23.09■■□□□ 1.29
FAAP20-209ENST00000428120 NAT16Q8N8M0 369 aa23.09■■□□□ 1.29
FAAP20-209ENST00000428120 IRF7Q92985 503 aa23.09■■□□□ 1.29
FAAP20-209ENST00000428120 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
FAAP20-209ENST00000428120 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa23.09■■□□□ 1.29
FAAP20-209ENST00000428120 LOC100653049A0A140TA62 436 aa23.08■■□□□ 1.29
FAAP20-209ENST00000428120 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
FAAP20-209ENST00000428120 KRT34O76011 436 aa23.08■■□□□ 1.29
FAAP20-209ENST00000428120 SUPT7LO94864 414 aa23.08■■□□□ 1.29
FAAP20-209ENST00000428120 PENKP01210 267 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
FAAP20-209ENST00000428120 GM2AP17900 193 aa23.08■■□□□ 1.29
FAAP20-209ENST00000428120 CA5AP35218 305 aa23.08■■□□□ 1.29
FAAP20-209ENST00000428120 SULT2A1Q06520 285 aa23.08■■□□□ 1.29
FAAP20-209ENST00000428120 LY6G5CQ5SRR4 150 aa23.08■■□□□ 1.29
FAAP20-209ENST00000428120 VOPP1Q96AW1 172 aa23.08■■□□□ 1.29
FAAP20-209ENST00000428120 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
FAAP20-209ENST00000428120 LRRC14BA6NHZ5 514 aa23.08■■□□□ 1.28
FAAP20-209ENST00000428120 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.28
FAAP20-209ENST00000428120 PRAMEF1O95521 474 aa23.08■■□□□ 1.28
FAAP20-209ENST00000428120 FGF19O95750 216 aa23.08■■□□□ 1.28
FAAP20-209ENST00000428120 CD1EP15812 388 aa23.08■■□□□ 1.28
FAAP20-209ENST00000428120 SERPINA4P29622 427 aa23.08■■□□□ 1.28
FAAP20-209ENST00000428120 MAPK8P45983 427 aa23.08■■□□□ 1.28
FAAP20-209ENST00000428120 C1QTNF8P60827 252 aa23.08■■□□□ 1.28
FAAP20-209ENST00000428120 FBXO48Q5FWF7 155 aa23.08■■□□□ 1.28
FAAP20-209ENST00000428120 TMEM198Q66K66 360 aa23.08■■□□□ 1.28
FAAP20-209ENST00000428120 C22orf39Q6P5X5 142 aa23.08■■□□□ 1.28
FAAP20-209ENST00000428120 FRMD7Q6ZUT3 714 aa23.08■■□□□ 1.28
FAAP20-209ENST00000428120 TSPAN33Q86UF1 283 aa23.08■■□□□ 1.28
FAAP20-209ENST00000428120 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.28
FAAP20-209ENST00000428120 GSTO2Q9H4Y5 243 aa23.08■■□□□ 1.28
FAAP20-209ENST00000428120 CDYLQ9Y232 598 aa23.08■■□□□ 1.28
FAAP20-209ENST00000428120 HS3ST2Q9Y278 367 aa23.08■■□□□ 1.28
FAAP20-209ENST00000428120 L3MBTL1Q9Y468 752 aa23.08■■□□□ 1.28
FAAP20-209ENST00000428120 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.28
FAAP20-209ENST00000428120 GBF1Q92538 1859 aa23.08■■□□□ 1.28
FAAP20-209ENST00000428120 F8W8V4 182 aa23.07■■□□□ 1.28
FAAP20-209ENST00000428120 SOCS5O75159 536 aa23.07■■□□□ 1.28
FAAP20-209ENST00000428120 XYLBO75191 536 aa23.07■■□□□ 1.28
FAAP20-209ENST00000428120 SMIM24O75264 130 aa23.07■■□□□ 1.28
FAAP20-209ENST00000428120 CA3P07451 260 aa23.07■■□□□ 1.28
FAAP20-209ENST00000428120 CEBPBP17676 345 aa23.07■■□□□ 1.28
FAAP20-209ENST00000428120 IMPDH1P20839 514 aa23.07■■□□□ 1.28
FAAP20-209ENST00000428120 CSNK1DP48730 415 aa23.07■■□□□ 1.28
FAAP20-209ENST00000428120 MNAT1P51948 309 aa23.07■■□□□ 1.28
FAAP20-209ENST00000428120 CDH13P55290 713 aa23.07■■□□□ 1.28
FAAP20-209ENST00000428120 SLC20A2Q08357 652 aa23.07■■□□□ 1.28
FAAP20-209ENST00000428120 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF77Q15935 545 aa23.07■■□□□ 1.28
FAAP20-209ENST00000428120 PFKFB4Q16877 469 aa23.07■■□□□ 1.28
FAAP20-209ENST00000428120 PRSS36Q5K4E3 855 aa23.07■■□□□ 1.28
FAAP20-209ENST00000428120 CUZD1Q86UP6 607 aa23.07■■□□□ 1.28
FAAP20-209ENST00000428120 TMPRSS6Q8IU80 811 aa23.07■■□□□ 1.28
FAAP20-209ENST00000428120 GIMAP7Q8NHV1 300 aa23.07■■□□□ 1.28
FAAP20-209ENST00000428120 MARK4Q96L34 752 aa23.07■■□□□ 1.28
FAAP20-209ENST00000428120 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa23.07■■□□□ 1.28
FAAP20-209ENST00000428120 SYTL2Q9HCH5 934 aa23.07■■□□□ 1.28
FAAP20-209ENST00000428120 SPHK2Q9NRA0 654 aa23.07■■□□□ 1.28
FAAP20-209ENST00000428120 VTI1BQ9UEU0 232 aa23.07■■□□□ 1.28
FAAP20-209ENST00000428120 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa23.07■■□□□ 1.28
FAAP20-209ENST00000428120 UNC80Q8N2C7 3258 aa23.07■■□□□ 1.28
FAAP20-209ENST00000428120 REV3LO60673 3130 aa23.07■■□□□ 1.28
FAAP20-209ENST00000428120 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
FAAP20-209ENST00000428120 ENTPD5O75356 428 aa23.07■■□□□ 1.28
FAAP20-209ENST00000428120 CHRM3P20309 590 aa23.07■■□□□ 1.28
FAAP20-209ENST00000428120 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
FAAP20-209ENST00000428120 UBE3AQ05086 875 aa23.07■■□□□ 1.28
FAAP20-209ENST00000428120 CACNG1Q06432 222 aa23.07■■□□□ 1.28
FAAP20-209ENST00000428120 RAD51Q06609 339 aa23.07■■□□□ 1.28
FAAP20-209ENST00000428120 TSNQ15631 228 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
FAAP20-209ENST00000428120 LRRC73Q5JTD7 316 aa23.07■■□□□ 1.28
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF678Q5SXM1 525 aa23.07■■□□□ 1.28
FAAP20-209ENST00000428120 RWDD3Q9Y3V2 267 aa23.07■■□□□ 1.28
FAAP20-209ENST00000428120 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
FAAP20-209ENST00000428120 CDC7O00311 574 aa23.06■■□□□ 1.28
FAAP20-209ENST00000428120 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
FAAP20-209ENST00000428120 PFDN6O15212 129 aa23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.8 ms