RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556787.5

PAPOLA-222, Transcript of poly(A) polymerase alpha, human

TSL 2

Gene PAPOLA, Length 806 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PAPOLA-222	ENST00000556787	DUS1L	Q6P1R4	473 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	PQLC2	Q6ZP29	291 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	CERS3	Q8IU89	383 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	NAGS	Q8N159	534 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	FRMD1	Q8N878	549 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	TEX19	Q8NA77	164 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	UCMA	Q8WVF2	138 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	SECTM1	Q8WVN6	248 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	RND1	Q92730	232 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	CD101	Q93033	1021 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	MPP4	Q96JB8	637 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	MTERF1	Q99551	399 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	PIP5K1A	Q99755	562 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	EVA1A	Q9H8M9	152 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	UBA2	Q9UBT2	640 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	ZNF69	Q9UC07	566 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	MTMR6	Q9Y217	621 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787		A0A1B0GUV1	79 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	NPIPB15	A6NHN6	443 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	JRK	O75564	520 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	NKX2-2	O95096	273 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	MBD4	O95243	580 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	DDX58	O95786	925 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	EGF	P01133	1207 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	CLEC3B	P05452	202 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	F7	P08709	466 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	LINC00271	P0C7V0	271 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	TMEM11	P17152	192 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	PRCP	P42785	496 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	FASLG	P48023	281 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	PRAME	P78395	509 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	ACSM2A	Q08AH3	577 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	TST	Q16762	297 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	EIF2S3L	Q2VIR3	472 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	MYLK3	Q32MK0	819 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	FRG2	Q64ET8	278 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	GDPD4	Q6W3E5	623 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	TMTC3	Q6ZXV5	915 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	GPR180	Q86V85	440 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	CCDC13	Q8IYE1	715 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	ARHGEF2	Q92974	986 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	ORAI1	Q96D31	301 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	QRFPR	Q96P65	431 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	GLIS2	Q9BZE0	524 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	USP44	Q9H0E7	712 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	TKTL2	Q9H0I9	626 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	SLC28A3	Q9HAS3	691 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	MKLN1	Q9UL63	735 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	KCNE2	Q9Y6J6	123 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	SRRM3	A6NNA2	597 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	VCY	O14598	125 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	MID1	O15344	667 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	PAGE4	O60829	102 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	AMD1	P17707	334 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	CDH2	P19022	906 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	UBA1	P22314	1058 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	DGKA	P23743	735 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	MAN1A1	P33908	653 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	PIK3CA	P42336	1068 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	RPS3A	P61247	264 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	MAD2L1	Q13257	205 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	TBCE	Q15813	527 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	ADIPOQ	Q15848	244 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	ZSCAN23	Q3MJ62	389 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	TMEM35A	Q53FP2	167 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	SARM1	Q6SZW1	724 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	LIN28B	Q6ZN17	250 aa	Known RBP eCLIP	4.87	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	QSOX2	Q6ZRP7	698 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	RSRC2	Q7L4I2	434 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	HACE1	Q8IYU2	909 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	RFLNB	Q8N5W9	214 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	TMEM116	Q8NCL8	245 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	ARHGEF26	Q96DR7	871 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	MMAB	Q96EY8	250 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	RRNAD1	Q96FB5	475 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	INPP4A	Q96PE3	977 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	ACSS1	Q9NUB1	689 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	ORC3	Q9UBD5	711 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	PADI1	Q9ULC6	663 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	LAS1L	Q9Y4W2	734 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	CAPN7	Q9Y6W3	813 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787		B4E171	279 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	GPC4	O75487	556 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	RNASEH2A	O75792	299 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	ATP1A1	P05023	1023 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	EIF2S1	P05198	315 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	CETP	P11597	493 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	IL7R	P16871	459 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	TSPAN7	P41732	249 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	MPP1	Q00013	466 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	NIPAL4	Q0D2K0	466 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	MAMLD1	Q13495	774 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	ZNF718	Q3SXZ3	478 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	PAPPA-AS1	Q5QFB9	102 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	C9orf50	Q5SZB4	431 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	TMEM154	Q6P9G4	183 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	KMT5C	Q86Y97	462 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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