RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393537.4

ANKRD39-201, Transcript of ankyrin repeat domain 39, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD39, Length 976 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39-201ENST00000393537 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
ANKRD39-201ENST00000393537 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
ANKRD39-201ENST00000393537 ZNF30P17039 623 aa20.21■□□□□ 0.83
ANKRD39-201ENST00000393537 NR2C2P49116 596 aa20.21■□□□□ 0.83
ANKRD39-201ENST00000393537 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
ANKRD39-201ENST00000393537 ADCY2Q08462 1091 aa20.21■□□□□ 0.83
ANKRD39-201ENST00000393537 RAET1GQ6H3X3 334 aa20.21■□□□□ 0.83
ANKRD39-201ENST00000393537 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
ANKRD39-201ENST00000393537 PROSER1Q86XN7 944 aa20.21■□□□□ 0.83
ANKRD39-201ENST00000393537 ACRBPQ8NEB7 543 aa20.21■□□□□ 0.83
ANKRD39-201ENST00000393537 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
ANKRD39-201ENST00000393537 TEX101Q9BY14 249 aa20.21■□□□□ 0.83
ANKRD39-201ENST00000393537 CD84Q9UIB8 345 aa20.21■□□□□ 0.83
ANKRD39-201ENST00000393537 DUSP10Q9Y6W6 482 aa20.21■□□□□ 0.83
ANKRD39-201ENST00000393537 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
ANKRD39-201ENST00000393537 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa20.2■□□□□ 0.82
ANKRD39-201ENST00000393537 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
ANKRD39-201ENST00000393537 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
ANKRD39-201ENST00000393537 MT-CO3P00414 261 aa20.2■□□□□ 0.82
ANKRD39-201ENST00000393537 TGM2P21980 687 aa20.2■□□□□ 0.82
ANKRD39-201ENST00000393537 RPIAP49247 311 aa20.2■□□□□ 0.82
ANKRD39-201ENST00000393537 CDK3Q00526 305 aa20.2■□□□□ 0.82
ANKRD39-201ENST00000393537 PTSQ03393 145 aa20.2■□□□□ 0.82
ANKRD39-201ENST00000393537 CYP4F3Q08477 520 aa20.2■□□□□ 0.82
ANKRD39-201ENST00000393537 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
ANKRD39-201ENST00000393537 LVRNQ6Q4G3 990 aa20.2■□□□□ 0.82
ANKRD39-201ENST00000393537 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
ANKRD39-201ENST00000393537 NT5DC3Q86UY8 548 aa20.2■□□□□ 0.82
ANKRD39-201ENST00000393537 GKN2Q86XP6 184 aa20.2■□□□□ 0.82
ANKRD39-201ENST00000393537 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa20.2■□□□□ 0.82
ANKRD39-201ENST00000393537 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa20.2■□□□□ 0.82
ANKRD39-201ENST00000393537 EXD1Q8NHP7 514 aa20.2■□□□□ 0.82
ANKRD39-201ENST00000393537 MAPK15Q8TD08 544 aa20.2■□□□□ 0.82
ANKRD39-201ENST00000393537 AP2M1Q96CW1 435 aa20.2■□□□□ 0.82
ANKRD39-201ENST00000393537 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
ANKRD39-201ENST00000393537 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
ANKRD39-201ENST00000393537 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP20.2■□□□□ 0.82
ANKRD39-201ENST00000393537 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
ANKRD39-201ENST00000393537 LACRTQ9GZZ8 138 aa20.2■□□□□ 0.82
ANKRD39-201ENST00000393537 ABCG4Q9H172 646 aa20.2■□□□□ 0.82
ANKRD39-201ENST00000393537 CYP4F12Q9HCS2 524 aa20.2■□□□□ 0.82
ANKRD39-201ENST00000393537 SIRPGQ9P1W8 387 aa20.2■□□□□ 0.82
ANKRD39-201ENST00000393537 GULP1Q9UBP9 304 aa20.2■□□□□ 0.82
ANKRD39-201ENST00000393537 DNPEPQ9ULA0 475 aa20.2■□□□□ 0.82
ANKRD39-201ENST00000393537 CLDN7O95471 211 aa20.19■□□□□ 0.82
ANKRD39-201ENST00000393537 TEAD1P28347 426 aa20.19■□□□□ 0.82
ANKRD39-201ENST00000393537 GPR1P46091 355 aa20.19■□□□□ 0.82
ANKRD39-201ENST00000393537 STC1P52823 247 aa20.19■□□□□ 0.82
ANKRD39-201ENST00000393537 DPTQ07507 201 aa20.19■□□□□ 0.82
ANKRD39-201ENST00000393537 QPCTQ16769 361 aa20.19■□□□□ 0.82
ANKRD39-201ENST00000393537 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa20.19■□□□□ 0.82
ANKRD39-201ENST00000393537 SPC24Q8NBT2 197 aa20.19■□□□□ 0.82
ANKRD39-201ENST00000393537 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
ANKRD39-201ENST00000393537 P3H4Q92791 437 aa20.19■□□□□ 0.82
ANKRD39-201ENST00000393537 HAUS1Q96CS2 278 aa20.19■□□□□ 0.82
ANKRD39-201ENST00000393537 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
ANKRD39-201ENST00000393537 ADGRE3Q9BY15 652 aa20.19■□□□□ 0.82
ANKRD39-201ENST00000393537 SLC25A51Q9H1U9 297 aa20.19■□□□□ 0.82
ANKRD39-201ENST00000393537 ABCG8Q9H221 673 aa20.19■□□□□ 0.82
ANKRD39-201ENST00000393537 GPR34Q9UPC5 381 aa20.19■□□□□ 0.82
ANKRD39-201ENST00000393537 RP1P56715 2156 aa20.19■□□□□ 0.82
ANKRD39-201ENST00000393537 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa20.18■□□□□ 0.82
ANKRD39-201ENST00000393537 PRSS38A1L453 326 aa20.18■□□□□ 0.82
ANKRD39-201ENST00000393537 BTNL10A8MVZ5 291 aa20.18■□□□□ 0.82
ANKRD39-201ENST00000393537 ANKRD66B4E2M5 251 aa20.18■□□□□ 0.82
ANKRD39-201ENST00000393537 PTPN3P26045 913 aa20.18■□□□□ 0.82
ANKRD39-201ENST00000393537 CDC25BP30305 580 aa20.18■□□□□ 0.82
ANKRD39-201ENST00000393537 VAV2P52735 878 aa20.18■□□□□ 0.82
ANKRD39-201ENST00000393537 GALNT3Q14435 633 aa20.18■□□□□ 0.82
ANKRD39-201ENST00000393537 TEX44Q53QW1 395 aa20.18■□□□□ 0.82
ANKRD39-201ENST00000393537 PERM1Q5SV97 790 aa20.18■□□□□ 0.82
ANKRD39-201ENST00000393537 CDCP2Q5VXM1 449 aa20.18■□□□□ 0.82
ANKRD39-201ENST00000393537 TAF8Q7Z7C8 310 aa20.18■□□□□ 0.82
ANKRD39-201ENST00000393537 KIAA1328Q86T90 577 aa20.18■□□□□ 0.82
ANKRD39-201ENST00000393537 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
ANKRD39-201ENST00000393537 TMEM139Q8IV31 216 aa20.18■□□□□ 0.82
ANKRD39-201ENST00000393537 ARL10Q8N8L6 244 aa20.18■□□□□ 0.82
ANKRD39-201ENST00000393537 KYQ8NBH2 561 aa20.18■□□□□ 0.82
ANKRD39-201ENST00000393537 NAT6Q93015 286 aa20.18■□□□□ 0.82
ANKRD39-201ENST00000393537 SCAMP4Q969E2 229 aa20.18■□□□□ 0.82
ANKRD39-201ENST00000393537 NXPE2Q96DL1 559 aa20.18■□□□□ 0.82
ANKRD39-201ENST00000393537 LYSMD1Q96S90 227 aa20.18■□□□□ 0.82
ANKRD39-201ENST00000393537 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
ANKRD39-201ENST00000393537 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
ANKRD39-201ENST00000393537 TMEM168Q9H0V1 697 aa20.18■□□□□ 0.82
ANKRD39-201ENST00000393537 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
ANKRD39-201ENST00000393537 GLOD4Q9HC38 313 aa20.18■□□□□ 0.82
ANKRD39-201ENST00000393537 DKK4Q9UBT3 224 aa20.18■□□□□ 0.82
ANKRD39-201ENST00000393537 PADI4Q9UM07 663 aa20.18■□□□□ 0.82
ANKRD39-201ENST00000393537 PJA2O43164 708 aa20.17■□□□□ 0.82
ANKRD39-201ENST00000393537 SOD1P00441 154 aa20.17■□□□□ 0.82
ANKRD39-201ENST00000393537 CEACAM5P06731 702 aa20.17■□□□□ 0.82
ANKRD39-201ENST00000393537 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
ANKRD39-201ENST00000393537 PPP2R5EQ16537 467 aa20.17■□□□□ 0.82
ANKRD39-201ENST00000393537 PCSK7Q16549 785 aa20.17■□□□□ 0.82
ANKRD39-201ENST00000393537 ZNF765Q7L2R6 523 aa20.17■□□□□ 0.82
ANKRD39-201ENST00000393537 KDELC2Q7Z4H8 507 aa20.17■□□□□ 0.82
ANKRD39-201ENST00000393537 NRSN1Q8IZ57 195 aa20.17■□□□□ 0.82
ANKRD39-201ENST00000393537 KIAA1524Q8TCG1 905 aa20.17■□□□□ 0.82
ANKRD39-201ENST00000393537 TRIB3Q96RU7 358 aa20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.3 ms