RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583667.1

GGA3-217, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene GGA3, Length 531 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-217ENST00000583667 ENGP17813 658 aa12.01□□□□□ -0.49
GGA3-217ENST00000583667 CSKP41240 450 aa12.01□□□□□ -0.49
GGA3-217ENST00000583667 CD86P42081 329 aa12.01□□□□□ -0.49
GGA3-217ENST00000583667 DSC2Q02487 901 aa12.01□□□□□ -0.49
GGA3-217ENST00000583667 CDK18Q07002 472 aa12.01□□□□□ -0.49
GGA3-217ENST00000583667 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP12.01□□□□□ -0.49
GGA3-217ENST00000583667 TERF2Q15554 542 aa12.01□□□□□ -0.49
GGA3-217ENST00000583667 SLC1A5Q15758 541 aa12.01□□□□□ -0.49
GGA3-217ENST00000583667 TRIM61Q5EBN2 209 aa12.01□□□□□ -0.49
GGA3-217ENST00000583667 TIFABQ6ZNK6 161 aa12.01□□□□□ -0.49
GGA3-217ENST00000583667 TMEM25Q86YD3 366 aa12.01□□□□□ -0.49
GGA3-217ENST00000583667 PLPP6Q8IY26 295 aa12.01□□□□□ -0.49
GGA3-217ENST00000583667 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP12.01□□□□□ -0.49
GGA3-217ENST00000583667 IPMKQ8NFU5 416 aa12.01□□□□□ -0.49
GGA3-217ENST00000583667 CDKL2Q92772 493 aa12.01□□□□□ -0.49
GGA3-217ENST00000583667 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP12.01□□□□□ -0.49
GGA3-217ENST00000583667 CERS2Q96G23 380 aa12.01□□□□□ -0.49
GGA3-217ENST00000583667 CFAP36Q96G28 342 aa12.01□□□□□ -0.49
GGA3-217ENST00000583667 ZFYVE19Q96K21 471 aa12.01□□□□□ -0.49
GGA3-217ENST00000583667 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP12.01□□□□□ -0.49
GGA3-217ENST00000583667 LRRC3BQ96PB8 259 aa12.01□□□□□ -0.49
GGA3-217ENST00000583667 TRIB3Q96RU7 358 aa12.01□□□□□ -0.49
GGA3-217ENST00000583667 C19orf43Q9BQ61 176 aa12.01□□□□□ -0.49
GGA3-217ENST00000583667 FICDQ9BVA6 458 aa12.01□□□□□ -0.49
GGA3-217ENST00000583667 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP12.01□□□□□ -0.49
GGA3-217ENST00000583667 FSD1LQ9BXM9 530 aa12.01□□□□□ -0.49
GGA3-217ENST00000583667 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP12.01□□□□□ -0.49
GGA3-217ENST00000583667 SMYD2Q9NRG4 433 aa12.01□□□□□ -0.49
GGA3-217ENST00000583667 VPS51Q9UID3 782 aa12.01□□□□□ -0.49
GGA3-217ENST00000583667 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP12.01□□□□□ -0.49
GGA3-217ENST00000583667 VPS28Q9UK41 221 aa12.01□□□□□ -0.49
GGA3-217ENST00000583667 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa12□□□□□ -0.49
GGA3-217ENST00000583667 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
GGA3-217ENST00000583667 F5H423 210 aaPredicted RBP12□□□□□ -0.49
GGA3-217ENST00000583667 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP12□□□□□ -0.49
GGA3-217ENST00000583667 SIN3BO75182 1162 aa12□□□□□ -0.49
GGA3-217ENST00000583667 NDST3O95803 873 aa12□□□□□ -0.49
GGA3-217ENST00000583667 FGF1P05230 155 aa12□□□□□ -0.49
GGA3-217ENST00000583667 INHBAP08476 426 aa12□□□□□ -0.49
GGA3-217ENST00000583667 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
GGA3-217ENST00000583667 GLDCP23378 1020 aa12□□□□□ -0.49
GGA3-217ENST00000583667 MDH1P40925 334 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
GGA3-217ENST00000583667 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
GGA3-217ENST00000583667 MAXP61244 160 aa12□□□□□ -0.49
GGA3-217ENST00000583667 ACVR1Q04771 509 aa12□□□□□ -0.49
GGA3-217ENST00000583667 SULT2A1Q06520 285 aa12□□□□□ -0.49
GGA3-217ENST00000583667 ITKQ08881 620 aa12□□□□□ -0.49
GGA3-217ENST00000583667 MTM1Q13496 603 aa12□□□□□ -0.49
GGA3-217ENST00000583667 PLEKHG6Q3KR16 790 aa12□□□□□ -0.49
GGA3-217ENST00000583667 FSTL4Q6MZW2 842 aa12□□□□□ -0.49
GGA3-217ENST00000583667 CASC4Q6P4E1 433 aa12□□□□□ -0.49
GGA3-217ENST00000583667 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
GGA3-217ENST00000583667 NCEH1Q6PIU2 408 aa12□□□□□ -0.49
GGA3-217ENST00000583667 SH2D5Q6ZV89 423 aa12□□□□□ -0.49
GGA3-217ENST00000583667 ABCA7Q8IZY2 2146 aa12□□□□□ -0.49
GGA3-217ENST00000583667 PNPLA1Q8N8W4 532 aa12□□□□□ -0.49
GGA3-217ENST00000583667 WFDC5Q8TCV5 224 aa12□□□□□ -0.49
GGA3-217ENST00000583667 OSCP1Q8WVF1 389 aa12□□□□□ -0.49
GGA3-217ENST00000583667 ZBTB9Q96C00 473 aa12□□□□□ -0.49
GGA3-217ENST00000583667 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
GGA3-217ENST00000583667 CHRAC1Q9NRG0 131 aa12□□□□□ -0.49
GGA3-217ENST00000583667 TREX1Q9NSU2 369 aa12□□□□□ -0.49
GGA3-217ENST00000583667 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa12□□□□□ -0.49
GGA3-217ENST00000583667 LHX3Q9UBR4 397 aa12□□□□□ -0.49
GGA3-217ENST00000583667 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa12□□□□□ -0.49
GGA3-217ENST00000583667 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
GGA3-217ENST00000583667 HS3ST2Q9Y278 367 aa12□□□□□ -0.49
GGA3-217ENST00000583667 TCAF1Q9Y4C2 921 aa12□□□□□ -0.49
GGA3-217ENST00000583667 IKBKGQ9Y6K9 419 aa12□□□□□ -0.49
GGA3-217ENST00000583667 HEATR9A2RTY3 570 aa11.99□□□□□ -0.49
GGA3-217ENST00000583667 MROH6A6NGR9 719 aa11.99□□□□□ -0.49
GGA3-217ENST00000583667 SMIM23A6NLE4 172 aa11.99□□□□□ -0.49
GGA3-217ENST00000583667 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
GGA3-217ENST00000583667 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
GGA3-217ENST00000583667 FZD6O60353 706 aa11.99□□□□□ -0.49
GGA3-217ENST00000583667 SNAP91O60641 907 aa11.99□□□□□ -0.49
GGA3-217ENST00000583667 KRT38O76015 456 aa11.99□□□□□ -0.49
GGA3-217ENST00000583667 TMCC1O94876 653 aa11.99□□□□□ -0.49
GGA3-217ENST00000583667 APBB3O95704 486 aa11.99□□□□□ -0.49
GGA3-217ENST00000583667 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
GGA3-217ENST00000583667 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
GGA3-217ENST00000583667 GYS2P54840 703 aa11.99□□□□□ -0.49
GGA3-217ENST00000583667 RPL26P61254 145 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
GGA3-217ENST00000583667 AP1S1P61966 158 aa11.99□□□□□ -0.49
GGA3-217ENST00000583667 CRADDP78560 199 aa11.99□□□□□ -0.49
GGA3-217ENST00000583667 SLC18A2Q05940 514 aa11.99□□□□□ -0.49
GGA3-217ENST00000583667 OLIG2Q13516 323 aa11.99□□□□□ -0.49
GGA3-217ENST00000583667 TMEM196Q5HYL7 178 aa11.99□□□□□ -0.49
GGA3-217ENST00000583667 SIRPB2Q5JXA9 342 aa11.99□□□□□ -0.49
GGA3-217ENST00000583667 GRTP1Q5TC63 336 aa11.99□□□□□ -0.49
GGA3-217ENST00000583667 PDPK2PQ6A1A2 396 aa11.99□□□□□ -0.49
GGA3-217ENST00000583667 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
GGA3-217ENST00000583667 CAPN12Q6ZSI9 719 aa11.99□□□□□ -0.49
GGA3-217ENST00000583667 C11orf74Q86VG3 221 aa11.99□□□□□ -0.49
GGA3-217ENST00000583667 CNTN4Q8IWV2 1026 aa11.99□□□□□ -0.49
GGA3-217ENST00000583667 LMNTD2Q8IXW0 634 aa11.99□□□□□ -0.49
GGA3-217ENST00000583667 APCDD1Q8J025 514 aa11.99□□□□□ -0.49
GGA3-217ENST00000583667 PPM1NQ8N819 430 aa11.99□□□□□ -0.49
GGA3-217ENST00000583667 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
GGA3-217ENST00000583667 APOL2Q9BQE5 337 aa11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.5 ms