RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473406.5

RABGGTB-209, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 721 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-209ENST00000473406 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
RABGGTB-209ENST00000473406 ATP6V0A1Q93050 837 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGGTB-209ENST00000473406 ERO1AQ96HE7 468 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGGTB-209ENST00000473406 ATP6V0BQ99437 205 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGGTB-209ENST00000473406 MACROD1Q9BQ69 325 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGGTB-209ENST00000473406 PCED1AQ9H1Q7 454 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGGTB-209ENST00000473406 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
RABGGTB-209ENST00000473406 MAGEE1Q9HCI5 957 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGGTB-209ENST00000473406 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
RABGGTB-209ENST00000473406 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGGTB-209ENST00000473406 ABCB8Q9NUT2 735 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGGTB-209ENST00000473406 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGGTB-209ENST00000473406 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
RABGGTB-209ENST00000473406 KCNK7Q9Y2U2 307 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGGTB-209ENST00000473406 CEPT1Q9Y6K0 416 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGGTB-209ENST00000473406 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGGTB-209ENST00000473406 LRRD1A4D1F6 860 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGGTB-209ENST00000473406 JRKO75564 520 aa6.13□□□□□ -1.43
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RABGGTB-209ENST00000473406 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
RABGGTB-209ENST00000473406 HPDP32754 393 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
RABGGTB-209ENST00000473406 HSPA4P34932 840 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGGTB-209ENST00000473406 MTHFRP42898 656 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGGTB-209ENST00000473406 CCT8P50990 548 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGGTB-209ENST00000473406 CLCN5P51795 746 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGGTB-209ENST00000473406 IL1RL1Q01638 556 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGGTB-209ENST00000473406 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP6.13□□□□□ -1.43
RABGGTB-209ENST00000473406 ABHD17BQ5VST6 288 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGGTB-209ENST00000473406 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
RABGGTB-209ENST00000473406 BTN2A1Q7KYR7 527 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGGTB-209ENST00000473406 DSG4Q86SJ6 1040 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGGTB-209ENST00000473406 HOOK3Q86VS8 718 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGGTB-209ENST00000473406 CCDC25Q86WR0 208 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGGTB-209ENST00000473406 ATAD1Q8NBU5 361 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGGTB-209ENST00000473406 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
RABGGTB-209ENST00000473406 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
RABGGTB-209ENST00000473406 GJC3Q8NFK1 279 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGGTB-209ENST00000473406 OR10S1Q8NGN2 331 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGGTB-209ENST00000473406 HUS1BQ8NHY5 278 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGGTB-209ENST00000473406 KAT2BQ92831 832 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGGTB-209ENST00000473406 ARSGQ96EG1 525 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGGTB-209ENST00000473406 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
RABGGTB-209ENST00000473406 CCDC17Q96LX7 622 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGGTB-209ENST00000473406 HARBI1Q96MB7 349 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGGTB-209ENST00000473406 SLITRK1Q96PX8 696 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGGTB-209ENST00000473406 FSD1Q9BTV5 496 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGGTB-209ENST00000473406 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF341Q9BYN7 854 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGGTB-209ENST00000473406 RTN4RQ9BZR6 473 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGGTB-209ENST00000473406 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGGTB-209ENST00000473406 THAP9Q9H5L6 903 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGGTB-209ENST00000473406 COPG2Q9UBF2 871 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGGTB-209ENST00000473406 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
RABGGTB-209ENST00000473406 C1orf226A1L170 272 aa6.12□□□□□ -1.43
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RABGGTB-209ENST00000473406 ANXA2P2A6NMY6 339 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGGTB-209ENST00000473406 BTBD19C9JJ37 291 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGGTB-209ENST00000473406 RRHO14718 337 aa6.12□□□□□ -1.43
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RABGGTB-209ENST00000473406 TMCC1O94876 653 aa6.12□□□□□ -1.43
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RABGGTB-209ENST00000473406 ELFN1P0C7U0 828 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGGTB-209ENST00000473406 ETFAP13804 333 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGGTB-209ENST00000473406 DESP17661 470 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGGTB-209ENST00000473406 SRD5A1P18405 259 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGGTB-209ENST00000473406 KIF5BP33176 963 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGGTB-209ENST00000473406 GRIA3P42263 894 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGGTB-209ENST00000473406 GPR143P51810 404 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGGTB-209ENST00000473406 ADAMTS20P59510 1910 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGGTB-209ENST00000473406 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
RABGGTB-209ENST00000473406 SORDQ00796 357 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGGTB-209ENST00000473406 RPA4Q13156 261 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGGTB-209ENST00000473406 ITGA7Q13683 1181 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGGTB-209ENST00000473406 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
RABGGTB-209ENST00000473406 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGGTB-209ENST00000473406 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
RABGGTB-209ENST00000473406 AWAT1Q58HT5 328 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGGTB-209ENST00000473406 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGGTB-209ENST00000473406 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGGTB-209ENST00000473406 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGGTB-209ENST00000473406 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGGTB-209ENST00000473406 KRT39Q6A163 491 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGGTB-209ENST00000473406 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGGTB-209ENST00000473406 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGGTB-209ENST00000473406 TMEM211Q6ICI0 200 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGGTB-209ENST00000473406 CES5AQ6NT32 575 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGGTB-209ENST00000473406 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
RABGGTB-209ENST00000473406 FAM217AQ8IXS0 508 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC35F3Q8IY50 421 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGGTB-209ENST00000473406 OR8K5Q8NH50 307 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGGTB-209ENST00000473406 TRPC4APQ8TEL6 797 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGGTB-209ENST00000473406 FBXL8Q96CD0 374 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGGTB-209ENST00000473406 TEPSINQ96N21 525 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGGTB-209ENST00000473406 TMEM237Q96Q45 408 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGGTB-209ENST00000473406 NUDCD1Q96RS6 583 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGGTB-209ENST00000473406 INTS14Q96SY0 518 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGGTB-209ENST00000473406 SPATC1LQ9H0A9 340 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGGTB-209ENST00000473406 ABCG4Q9H172 646 aa6.12□□□□□ -1.43
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