RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522045.5

SGCE-211, Transcript of sarcoglycan epsilon, humanhuman

TSL 3

Gene SGCE, Length 408 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCE-211ENST00000522045 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa4.88□□□□□ -1.63
SGCE-211ENST00000522045 VDAC3Q9Y277 283 aa4.88□□□□□ -1.63
SGCE-211ENST00000522045 SNX9Q9Y5X1 595 aa4.88□□□□□ -1.63
SGCE-211ENST00000522045 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa4.88□□□□□ -1.63
SGCE-211ENST00000522045 ZFYVE9O95405 1425 aa4.88□□□□□ -1.63
SGCE-211ENST00000522045 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa4.87□□□□□ -1.63
SGCE-211ENST00000522045 HMX3A6NHT5 357 aa4.87□□□□□ -1.63
SGCE-211ENST00000522045 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa4.87□□□□□ -1.63
SGCE-211ENST00000522045 FGF17O60258 216 aa4.87□□□□□ -1.63
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SGCE-211ENST00000522045 CLDN14O95500 239 aa4.87□□□□□ -1.63
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SGCE-211ENST00000522045 CFC1P0CG37 223 aa4.87□□□□□ -1.63
SGCE-211ENST00000522045 TNNT1P13805 278 aa4.87□□□□□ -1.63
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SGCE-211ENST00000522045 TANGO2Q6ICL3 276 aa4.87□□□□□ -1.63
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SGCE-211ENST00000522045 SHFQ7M4L6 423 aa4.87□□□□□ -1.63
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SGCE-211ENST00000522045 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
SGCE-211ENST00000522045 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
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SGCE-211ENST00000522045 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
SGCE-211ENST00000522045 G6PC2Q9NQR9 355 aa4.87□□□□□ -1.63
SGCE-211ENST00000522045 HDAC6Q9UBN7 1215 aa4.87□□□□□ -1.63
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SGCE-211ENST00000522045 CNPY2Q9Y2B0 182 aa4.87□□□□□ -1.63
SGCE-211ENST00000522045 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa4.87□□□□□ -1.63
SGCE-211ENST00000522045 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa4.87□□□□□ -1.63
SGCE-211ENST00000522045 ABCC11Q96J66 1382 aa4.87□□□□□ -1.63
SGCE-211ENST00000522045 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa4.87□□□□□ -1.63
SGCE-211ENST00000522045 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa4.87□□□□□ -1.63
SGCE-211ENST00000522045 ZG16O60844 167 aa4.86□□□□□ -1.63
SGCE-211ENST00000522045 TIPRLO75663 272 aa4.86□□□□□ -1.63
SGCE-211ENST00000522045 ADAP00813 363 aa4.86□□□□□ -1.63
SGCE-211ENST00000522045 IGHDP01880 384 aa4.86□□□□□ -1.63
SGCE-211ENST00000522045 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
SGCE-211ENST00000522045 LINC00271P0C7V0 271 aa4.86□□□□□ -1.63
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SGCE-211ENST00000522045 RARSP54136 660 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
SGCE-211ENST00000522045 BECN1Q14457 450 aa4.86□□□□□ -1.63
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SGCE-211ENST00000522045 ANTXRLA6NF34 631 aa4.85□□□□□ -1.63
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SGCE-211ENST00000522045 CETPP11597 493 aa4.85□□□□□ -1.63
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SGCE-211ENST00000522045 SYT16Q17RD7 645 aa4.85□□□□□ -1.63
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SGCE-211ENST00000522045 FAM72DQ6L9T8 149 aa4.85□□□□□ -1.63
SGCE-211ENST00000522045 FAM122CQ6P4D5 195 aa4.85□□□□□ -1.63
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SGCE-211ENST00000522045 FAM72BQ86X60 149 aa4.85□□□□□ -1.63
SGCE-211ENST00000522045 AFAP1Q8N556 730 aa4.85□□□□□ -1.63
SGCE-211ENST00000522045 WDSUB1Q8N9V3 476 aa4.85□□□□□ -1.63
SGCE-211ENST00000522045 KCNH5Q8NCM2 988 aa4.85□□□□□ -1.63
SGCE-211ENST00000522045 TMEM170AQ8WVE7 144 aa4.85□□□□□ -1.63
SGCE-211ENST00000522045 FIG4Q92562 907 aa4.85□□□□□ -1.63
SGCE-211ENST00000522045 C3orf30Q96M34 536 aa4.85□□□□□ -1.63
SGCE-211ENST00000522045 TCF19Q9Y242 345 aa4.85□□□□□ -1.63
SGCE-211ENST00000522045 IL16Q14005 1332 aa4.85□□□□□ -1.63
SGCE-211ENST00000522045 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa4.85□□□□□ -1.63
SGCE-211ENST00000522045 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa4.84□□□□□ -1.63
SGCE-211ENST00000522045 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa4.84□□□□□ -1.63
SGCE-211ENST00000522045 NEO1Q92859 1461 aa4.84□□□□□ -1.63
SGCE-211ENST00000522045 CD109Q6YHK3 1445 aa4.84□□□□□ -1.63
SGCE-211ENST00000522045 PIK3R4Q99570 1358 aa4.84□□□□□ -1.63
SGCE-211ENST00000522045 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
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SGCE-211ENST00000522045 EDIL3O43854 480 aa4.84□□□□□ -1.63
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SGCE-211ENST00000522045 ERVK11-1P61568 191 aa4.84□□□□□ -1.63
SGCE-211ENST00000522045 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
SGCE-211ENST00000522045 OASLQ15646 514 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
SGCE-211ENST00000522045 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa4.84□□□□□ -1.63
SGCE-211ENST00000522045 SH2D4BQ5SQS7 431 aa4.84□□□□□ -1.63
SGCE-211ENST00000522045 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa4.84□□□□□ -1.63
SGCE-211ENST00000522045 KBTBD3Q8NAB2 608 aa4.84□□□□□ -1.63
SGCE-211ENST00000522045 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
SGCE-211ENST00000522045 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
SGCE-211ENST00000522045 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP4.84□□□□□ -1.63
SGCE-211ENST00000522045 TANKQ92844 425 aa4.84□□□□□ -1.63
SGCE-211ENST00000522045 CSF3RQ99062 836 aa4.84□□□□□ -1.63
SGCE-211ENST00000522045 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa4.84□□□□□ -1.63
SGCE-211ENST00000522045 MYH16Q9H6N6 1097 aa4.84□□□□□ -1.63
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