RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490813.5

CEP170-216, Transcript of centrosomal protein 170, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene CEP170, Length 1,070 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CEP170-216	ENST00000490813	SQSTM1	Q13501	440 aa		5.7	□□□□□ -1.5
CEP170-216	ENST00000490813	MAP7	Q14244	749 aa		5.7	□□□□□ -1.5
CEP170-216	ENST00000490813	C16orf72	Q14CZ0	275 aa		5.7	□□□□□ -1.5
CEP170-216	ENST00000490813	CNGA2	Q16280	664 aa		5.7	□□□□□ -1.5
CEP170-216	ENST00000490813	NFIL3	Q16649	462 aa		5.7	□□□□□ -1.5
CEP170-216	ENST00000490813	C14orf28	Q4W4Y0	310 aa		5.7	□□□□□ -1.5
CEP170-216	ENST00000490813	RAP1GAP2	Q684P5	730 aa		5.7	□□□□□ -1.5
CEP170-216	ENST00000490813	LCLAT1	Q6UWP7	414 aa		5.7	□□□□□ -1.5
CEP170-216	ENST00000490813	ZNF783	Q6ZMS7	281 aa		5.7	□□□□□ -1.5
CEP170-216	ENST00000490813	RD3	Q7Z3Z2	195 aa		5.7	□□□□□ -1.5
CEP170-216	ENST00000490813	KDELC2	Q7Z4H8	507 aa		5.7	□□□□□ -1.5
CEP170-216	ENST00000490813	SETD3	Q86TU7	594 aa	Predicted RBP	5.7	□□□□□ -1.5
CEP170-216	ENST00000490813	HID1	Q8IV36	788 aa		5.7	□□□□□ -1.5
CEP170-216	ENST00000490813	PDILT	Q8N807	584 aa		5.7	□□□□□ -1.5
CEP170-216	ENST00000490813		Q8N9G6	341 aa	Predicted RBP	5.7	□□□□□ -1.5
CEP170-216	ENST00000490813	DCAF4L2	Q8NA75	395 aa		5.7	□□□□□ -1.5
CEP170-216	ENST00000490813	KY	Q8NBH2	561 aa		5.7	□□□□□ -1.5
CEP170-216	ENST00000490813	FBXL13	Q8NEE6	735 aa		5.7	□□□□□ -1.5
CEP170-216	ENST00000490813	DQX1	Q8TE96	717 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
CEP170-216	ENST00000490813	SLC35F5	Q8WV83	523 aa		5.7	□□□□□ -1.5
CEP170-216	ENST00000490813	JPH3	Q8WXH2	748 aa	Predicted RBP	5.7	□□□□□ -1.5
CEP170-216	ENST00000490813	STARD8	Q92502	1023 aa		5.7	□□□□□ -1.5
CEP170-216	ENST00000490813	NDRG1	Q92597	394 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
CEP170-216	ENST00000490813	FAM149B1	Q96BN6	582 aa		5.7	□□□□□ -1.5
CEP170-216	ENST00000490813	CENPT	Q96BT3	561 aa		5.7	□□□□□ -1.5
CEP170-216	ENST00000490813	ALG14	Q96F25	216 aa		5.7	□□□□□ -1.5
CEP170-216	ENST00000490813	C5orf34	Q96MH7	638 aa		5.7	□□□□□ -1.5
CEP170-216	ENST00000490813	RPRD1A	Q96P16	312 aa	Predicted RBP	5.7	□□□□□ -1.5
CEP170-216	ENST00000490813	MED15	Q96RN5	788 aa		5.7	□□□□□ -1.5
CEP170-216	ENST00000490813	OSBPL1A	Q9BXW6	950 aa		5.7	□□□□□ -1.5
CEP170-216	ENST00000490813	PANK2	Q9BZ23	570 aa		5.7	□□□□□ -1.5
CEP170-216	ENST00000490813	APOBEC3G	Q9HC16	384 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
CEP170-216	ENST00000490813	CYP4F12	Q9HCS2	524 aa		5.7	□□□□□ -1.5
CEP170-216	ENST00000490813	CASS4	Q9NQ75	786 aa		5.7	□□□□□ -1.5
CEP170-216	ENST00000490813	SIRPG	Q9P1W8	387 aa		5.7	□□□□□ -1.5
CEP170-216	ENST00000490813	KCND3	Q9UK17	655 aa		5.7	□□□□□ -1.5
CEP170-216	ENST00000490813	PILRA	Q9UKJ1	303 aa		5.7	□□□□□ -1.5
CEP170-216	ENST00000490813	G3BP2	Q9UN86	482 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
CEP170-216	ENST00000490813	SMC3	Q9UQE7	1217 aa		5.7	□□□□□ -1.5
CEP170-216	ENST00000490813	SLC5A6	Q9Y289	635 aa		5.7	□□□□□ -1.5
CEP170-216	ENST00000490813	TBC1D30	Q9Y2I9	924 aa		5.7	□□□□□ -1.5
CEP170-216	ENST00000490813	KCNMB2	Q9Y691	235 aa		5.7	□□□□□ -1.5
CEP170-216	ENST00000490813	DGKB	Q9Y6T7	804 aa		5.7	□□□□□ -1.5
CEP170-216	ENST00000490813	SHANK1	Q9Y566	2161 aa		5.7	□□□□□ -1.5
CEP170-216	ENST00000490813	SPEN	Q96T58	3664 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
CEP170-216	ENST00000490813	IGLON5	A6NGN9	336 aa		5.69	□□□□□ -1.5
CEP170-216	ENST00000490813	RHPN2P1	A8MT19	583 aa		5.69	□□□□□ -1.5
CEP170-216	ENST00000490813		O00370	1275 aa		5.69	□□□□□ -1.5
CEP170-216	ENST00000490813	TNFRSF10C	O14798	259 aa		5.69	□□□□□ -1.5
CEP170-216	ENST00000490813	RAD51B	O15315	384 aa		5.69	□□□□□ -1.5
CEP170-216	ENST00000490813	LDLR	P01130	860 aa		5.69	□□□□□ -1.5
CEP170-216	ENST00000490813	NR3C1	P04150	777 aa		5.69	□□□□□ -1.5
CEP170-216	ENST00000490813	RHOC	P08134	193 aa		5.69	□□□□□ -1.5
CEP170-216	ENST00000490813	H2AFB1	P0C5Y9	115 aa		5.69	□□□□□ -1.5
CEP170-216	ENST00000490813	H2AFB2	P0C5Z0	115 aa		5.69	□□□□□ -1.5
CEP170-216	ENST00000490813	PRKAR1A	P10644	381 aa		5.69	□□□□□ -1.5
CEP170-216	ENST00000490813	FGF3	P11487	239 aa	Predicted RBP	5.69	□□□□□ -1.5
CEP170-216	ENST00000490813	PSMC2	P35998	433 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
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CEP170-216	ENST00000490813	GCLM	P48507	274 aa		5.69	□□□□□ -1.5
CEP170-216	ENST00000490813	SRP54	P61011	504 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
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CEP170-216	ENST00000490813	CDK17	Q00537	523 aa		5.69	□□□□□ -1.5
CEP170-216	ENST00000490813	NRG1	Q02297	640 aa	Predicted RBP	5.69	□□□□□ -1.5
CEP170-216	ENST00000490813	RAD51	Q06609	339 aa		5.69	□□□□□ -1.5
CEP170-216	ENST00000490813	ELP6	Q0PNE2	266 aa		5.69	□□□□□ -1.5
CEP170-216	ENST00000490813	RAPGEF1	Q13905	1077 aa		5.69	□□□□□ -1.5
CEP170-216	ENST00000490813	ELOA	Q14241	798 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
CEP170-216	ENST00000490813	NFATC4	Q14934	902 aa		5.69	□□□□□ -1.5
CEP170-216	ENST00000490813	NR1D2	Q14995	579 aa		5.69	□□□□□ -1.5
CEP170-216	ENST00000490813	SLC39A14	Q15043	492 aa		5.69	□□□□□ -1.5
CEP170-216	ENST00000490813	POLD3	Q15054	466 aa	Predicted RBP	5.69	□□□□□ -1.5
CEP170-216	ENST00000490813	ZNF805	Q5CZA5	627 aa		5.69	□□□□□ -1.5
CEP170-216	ENST00000490813	CARD16	Q5EG05	197 aa		5.69	□□□□□ -1.5
CEP170-216	ENST00000490813	CXorf57	Q6NSI4	855 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
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CEP170-216	ENST00000490813	TAF8	Q7Z7C8	310 aa		5.69	□□□□□ -1.5
CEP170-216	ENST00000490813	APLF	Q8IW19	511 aa	Predicted RBP	5.69	□□□□□ -1.5
CEP170-216	ENST00000490813	DMRTC2	Q8IXT2	367 aa	Predicted RBP	5.69	□□□□□ -1.5
CEP170-216	ENST00000490813	NRSN1	Q8IZ57	195 aa		5.69	□□□□□ -1.5
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CEP170-216	ENST00000490813	FAM46D	Q8NEK8	389 aa		5.69	□□□□□ -1.5
CEP170-216	ENST00000490813	OR4D9	Q8NGE8	314 aa		5.69	□□□□□ -1.5
CEP170-216	ENST00000490813	TAS1R2	Q8TE23	839 aa		5.69	□□□□□ -1.5
CEP170-216	ENST00000490813	CXorf40A	Q8TE69	158 aa		5.69	□□□□□ -1.5
CEP170-216	ENST00000490813	ART4	Q93070	314 aa		5.69	□□□□□ -1.5
CEP170-216	ENST00000490813	CCDC47	Q96A33	483 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
CEP170-216	ENST00000490813	TP53INP1	Q96A56	240 aa		5.69	□□□□□ -1.5
CEP170-216	ENST00000490813	ISG20	Q96AZ6	181 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
CEP170-216	ENST00000490813	CLIC6	Q96NY7	704 aa		5.69	□□□□□ -1.5
CEP170-216	ENST00000490813	RBM15	Q96T37	977 aa	Known RBP eCLIP	5.69	□□□□□ -1.5
CEP170-216	ENST00000490813	SSBP4	Q9BWG4	385 aa	Predicted RBP	5.69	□□□□□ -1.5
CEP170-216	ENST00000490813	TCEAL2	Q9H3H9	227 aa	Predicted RBP	5.69	□□□□□ -1.5
CEP170-216	ENST00000490813	DPEP2	Q9H4A9	486 aa		5.69	□□□□□ -1.5
CEP170-216	ENST00000490813	POPDC2	Q9HBU9	364 aa		5.69	□□□□□ -1.5
CEP170-216	ENST00000490813	SLC39A2	Q9NP94	309 aa		5.69	□□□□□ -1.5
CEP170-216	ENST00000490813	RAB20	Q9NX57	234 aa		5.69	□□□□□ -1.5
CEP170-216	ENST00000490813	TMEM63C	Q9P1W3	806 aa		5.69	□□□□□ -1.5
CEP170-216	ENST00000490813	KL	Q9UEF7	1012 aa		5.69	□□□□□ -1.5
CEP170-216	ENST00000490813	ENTPD4	Q9Y227	616 aa		5.69	□□□□□ -1.5

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