RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519975.1

PCMTD1-204, Transcript of protein-L-isoaspartate (D-aspartate) O-methyltransferase domain containing 1, human

TSL 2

Gene PCMTD1, Length 995 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PCMTD1-204	ENST00000519975	KIAA1456	Q9P272	454 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PCMTD1-204	ENST00000519975	CRNN	Q9UBG3	495 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PCMTD1-204	ENST00000519975	HAO1	Q9UJM8	370 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PCMTD1-204	ENST00000519975	A4GNT	Q9UNA3	340 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PCMTD1-204	ENST00000519975	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PCMTD1-204	ENST00000519975	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PCMTD1-204	ENST00000519975		A0A1W2PRV1	198 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PCMTD1-204	ENST00000519975	ENO4	A6NNW6	628 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PCMTD1-204	ENST00000519975	AHRR	A9YTQ3	701 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PCMTD1-204	ENST00000519975		F5H697	171 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PCMTD1-204	ENST00000519975	TRIAP1	O43715	76 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PCMTD1-204	ENST00000519975	HBP1	O60381	514 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PCMTD1-204	ENST00000519975	RTN2	O75298	545 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PCMTD1-204	ENST00000519975	PENK	P01210	267 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PCMTD1-204	ENST00000519975	SRPRA	P08240	638 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PCMTD1-204	ENST00000519975	ZFX	P17010	805 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PCMTD1-204	ENST00000519975	TFEB	P19484	476 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PCMTD1-204	ENST00000519975	ADRA1D	P25100	572 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PCMTD1-204	ENST00000519975	PRKCI	P41743	596 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PCMTD1-204	ENST00000519975	BMX	P51813	675 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PCMTD1-204	ENST00000519975	CAPZA1	P52907	286 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PCMTD1-204	ENST00000519975	FAM189B	P81408	668 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PCMTD1-204	ENST00000519975	CYP4A11	Q02928	519 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PCMTD1-204	ENST00000519975	DEUP1	Q05D60	604 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PCMTD1-204	ENST00000519975	KLHL30	Q0D2K2	578 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PCMTD1-204	ENST00000519975	DYRK1A	Q13627	763 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PCMTD1-204	ENST00000519975	RCN2	Q14257	317 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PCMTD1-204	ENST00000519975	ZNF273	Q14593	569 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PCMTD1-204	ENST00000519975	KBTBD12	Q3ZCT8	623 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PCMTD1-204	ENST00000519975	FAM102A	Q5T9C2	384 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PCMTD1-204	ENST00000519975	PMS2CL	Q68D20	193 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PCMTD1-204	ENST00000519975	TMEM88	Q6PEY1	159 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PCMTD1-204	ENST00000519975	RABEPK	Q7Z6M1	372 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PCMTD1-204	ENST00000519975	CLNK	Q7Z7G1	428 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PCMTD1-204	ENST00000519975	AACS	Q86V21	672 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PCMTD1-204	ENST00000519975	FAM160B2	Q86V87	743 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PCMTD1-204	ENST00000519975	ADGRG5	Q8IZF4	528 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PCMTD1-204	ENST00000519975	VPS52	Q8N1B4	723 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PCMTD1-204	ENST00000519975	LCORL	Q8N3X6	602 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PCMTD1-204	ENST00000519975	SIRT6	Q8N6T7	355 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PCMTD1-204	ENST00000519975	CAMKV	Q8NCB2	501 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PCMTD1-204	ENST00000519975	ZBTB44	Q8NCP5	570 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PCMTD1-204	ENST00000519975	IPMK	Q8NFU5	416 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PCMTD1-204	ENST00000519975	PTER	Q96BW5	349 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PCMTD1-204	ENST00000519975	CTHRC1	Q96CG8	243 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PCMTD1-204	ENST00000519975	VPS50	Q96JG6	964 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PCMTD1-204	ENST00000519975	C16orf45	Q96MC5	204 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PCMTD1-204	ENST00000519975	MGME1	Q9BQP7	344 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PCMTD1-204	ENST00000519975	REXO4	Q9GZR2	422 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PCMTD1-204	ENST00000519975	MCM9	Q9NXL9	1143 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PCMTD1-204	ENST00000519975	PSD3	Q9NYI0	1048 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PCMTD1-204	ENST00000519975	GDE1	Q9NZC3	331 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PCMTD1-204	ENST00000519975	INSL6	Q9Y581	213 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PCMTD1-204	ENST00000519975	PCDHGA5	Q9Y5G8	931 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PCMTD1-204	ENST00000519975	PCDHGA1	Q9Y5H4	931 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PCMTD1-204	ENST00000519975	LIPG	Q9Y5X9	500 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PCMTD1-204	ENST00000519975	PRAMEF33	A0A0G2JMD5	474 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PCMTD1-204	ENST00000519975		A0A1W2PR77	199 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PCMTD1-204	ENST00000519975		A0A1W2PS29	197 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PCMTD1-204	ENST00000519975	HCRTR2	O43614	444 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PCMTD1-204	ENST00000519975	CCNT1	O60563	726 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PCMTD1-204	ENST00000519975	TLR2	O60603	784 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PCMTD1-204	ENST00000519975	PRAMEF10	O60809	474 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PCMTD1-204	ENST00000519975	NDUFS3	O75489	264 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PCMTD1-204	ENST00000519975	BCAS2	O75934	225 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PCMTD1-204	ENST00000519975	HEXA	P06865	529 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PCMTD1-204	ENST00000519975	CYP2A6	P11509	494 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PCMTD1-204	ENST00000519975	EEF2	P13639	858 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PCMTD1-204	ENST00000519975	MATN1	P21941	496 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PCMTD1-204	ENST00000519975	IL10	P22301	178 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PCMTD1-204	ENST00000519975	HOXA11	P31270	313 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PCMTD1-204	ENST00000519975	PTPN9	P43378	593 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PCMTD1-204	ENST00000519975	PTH2R	P49190	550 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PCMTD1-204	ENST00000519975	NT5C2	P49902	561 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PCMTD1-204	ENST00000519975	GNAQ	P50148	359 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PCMTD1-204	ENST00000519975	HSD11B2	P80365	405 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PCMTD1-204	ENST00000519975	OLIG2	Q13516	323 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PCMTD1-204	ENST00000519975	GPR162	Q16538	588 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PCMTD1-204	ENST00000519975	ZSCAN23	Q3MJ62	389 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PCMTD1-204	ENST00000519975	LEXM	Q3ZCV2	418 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PCMTD1-204	ENST00000519975	CD300E	Q496F6	205 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PCMTD1-204	ENST00000519975	PREPL	Q4J6C6	727 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PCMTD1-204	ENST00000519975	ANKRD20A4	Q4UJ75	823 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PCMTD1-204	ENST00000519975	SLC39A12	Q504Y0	691 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PCMTD1-204	ENST00000519975	ANKRD20A8P	Q5CZ79	823 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PCMTD1-204	ENST00000519975	IGSF11	Q5DX21	431 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PCMTD1-204	ENST00000519975	ANKRD20A2	Q5SQ80	823 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PCMTD1-204	ENST00000519975	ANKRD20A1	Q5TYW2	823 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PCMTD1-204	ENST00000519975	ANKRD20A3	Q5VUR7	823 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PCMTD1-204	ENST00000519975	SP5	Q6BEB4	398 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PCMTD1-204	ENST00000519975	MICALCL	Q6ZW33	695 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PCMTD1-204	ENST00000519975	RNF144B	Q7Z419	303 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PCMTD1-204	ENST00000519975	SPATA19	Q7Z5L4	167 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PCMTD1-204	ENST00000519975	CAMKMT	Q7Z624	323 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PCMTD1-204	ENST00000519975	CAND1	Q86VP6	1230 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PCMTD1-204	ENST00000519975	ANKRD13B	Q86YJ7	626 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PCMTD1-204	ENST00000519975	PEX5L	Q8IYB4	626 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PCMTD1-204	ENST00000519975	IQUB	Q8NA54	791 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PCMTD1-204	ENST00000519975	ATAD1	Q8NBU5	361 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PCMTD1-204	ENST00000519975	PTPMT1	Q8WUK0	201 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62

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