RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495293.5

RBM39-240, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 2

Gene RBM39, Length 759 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-240ENST00000495293 CCDC149Q6ZUS6 474 aa4.76□□□□□ -1.65
RBM39-240ENST00000495293 BRSK2Q8IWQ3 736 aa4.76□□□□□ -1.65
RBM39-240ENST00000495293 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa4.76□□□□□ -1.65
RBM39-240ENST00000495293 AOPEPQ8N6M6 819 aa4.76□□□□□ -1.65
RBM39-240ENST00000495293 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
RBM39-240ENST00000495293 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
RBM39-240ENST00000495293 HDAC7Q8WUI4 952 aa4.76□□□□□ -1.65
RBM39-240ENST00000495293 SCFD1Q8WVM8 642 aa4.76□□□□□ -1.65
RBM39-240ENST00000495293 KAT5Q92993 513 aa4.76□□□□□ -1.65
RBM39-240ENST00000495293 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
RBM39-240ENST00000495293 TTC17Q96AE7 1141 aa4.76□□□□□ -1.65
RBM39-240ENST00000495293 CCDC127Q96BQ5 260 aa4.76□□□□□ -1.65
RBM39-240ENST00000495293 LRGUKQ96M69 825 aa4.76□□□□□ -1.65
RBM39-240ENST00000495293 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
RBM39-240ENST00000495293 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
RBM39-240ENST00000495293 PAAF1Q9BRP4 392 aa4.76□□□□□ -1.65
RBM39-240ENST00000495293 CBWD1Q9BRT8 395 aa4.76□□□□□ -1.65
RBM39-240ENST00000495293 APOL5Q9BWW9 433 aa4.76□□□□□ -1.65
RBM39-240ENST00000495293 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa4.76□□□□□ -1.65
RBM39-240ENST00000495293 DNAI2Q9GZS0 605 aa4.76□□□□□ -1.65
RBM39-240ENST00000495293 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa4.76□□□□□ -1.65
RBM39-240ENST00000495293 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa4.76□□□□□ -1.65
RBM39-240ENST00000495293 SFXN1Q9H9B4 322 aa4.76□□□□□ -1.65
RBM39-240ENST00000495293 MAN1C1Q9NR34 630 aa4.76□□□□□ -1.65
RBM39-240ENST00000495293 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa4.76□□□□□ -1.65
RBM39-240ENST00000495293 TMEM140Q9NV12 185 aa4.76□□□□□ -1.65
RBM39-240ENST00000495293 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
RBM39-240ENST00000495293 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa4.76□□□□□ -1.65
RBM39-240ENST00000495293 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
RBM39-240ENST00000495293 MRFAP1Q9Y605 127 aa4.76□□□□□ -1.65
RBM39-240ENST00000495293 TRIP11Q15643 1979 aa4.75□□□□□ -1.65
RBM39-240ENST00000495293 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa4.75□□□□□ -1.65
RBM39-240ENST00000495293 CDHR4A6H8M9 788 aa4.75□□□□□ -1.65
RBM39-240ENST00000495293 LRRC3CA6NJW4 275 aa4.75□□□□□ -1.65
RBM39-240ENST00000495293 FAM171A2A8MVW0 826 aa4.75□□□□□ -1.65
RBM39-240ENST00000495293 KPNA7A9QM74 516 aa4.75□□□□□ -1.65
RBM39-240ENST00000495293 F8W810 466 aa4.75□□□□□ -1.65
RBM39-240ENST00000495293 I3L4J1 428 aa4.75□□□□□ -1.65
RBM39-240ENST00000495293 PIRO00625 290 aa4.75□□□□□ -1.65
RBM39-240ENST00000495293 CYB561D2O14569 222 aa4.75□□□□□ -1.65
RBM39-240ENST00000495293 PRRG1O14668 218 aa4.75□□□□□ -1.65
RBM39-240ENST00000495293 PSMA7O14818 248 aa4.75□□□□□ -1.65
RBM39-240ENST00000495293 CETN3O15182 167 aa4.75□□□□□ -1.65
RBM39-240ENST00000495293 TGFB1I1O43294 461 aa4.75□□□□□ -1.65
RBM39-240ENST00000495293 ZSCAN12O43309 604 aa4.75□□□□□ -1.65
RBM39-240ENST00000495293 KLRC4O43908 158 aa4.75□□□□□ -1.65
RBM39-240ENST00000495293 FAM189A1O60320 539 aa4.75□□□□□ -1.65
RBM39-240ENST00000495293 STX10O60499 249 aa4.75□□□□□ -1.65
RBM39-240ENST00000495293 HUS1O60921 280 aa4.75□□□□□ -1.65
RBM39-240ENST00000495293 TBX10O75333 385 aa4.75□□□□□ -1.65
RBM39-240ENST00000495293 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
RBM39-240ENST00000495293 IL33O95760 270 aa4.75□□□□□ -1.65
RBM39-240ENST00000495293 NR3C1P04150 777 aa4.75□□□□□ -1.65
RBM39-240ENST00000495293 ADRB2P07550 413 aa4.75□□□□□ -1.65
RBM39-240ENST00000495293 DLATP10515 647 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
RBM39-240ENST00000495293 IL9P15248 144 aa4.75□□□□□ -1.65
RBM39-240ENST00000495293 EPCAMP16422 314 aa4.75□□□□□ -1.65
RBM39-240ENST00000495293 RPL17P18621 184 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
RBM39-240ENST00000495293 FDXRP22570 491 aa4.75□□□□□ -1.65
RBM39-240ENST00000495293 TKTP29401 623 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
RBM39-240ENST00000495293 OR1D2P34982 312 aa4.75□□□□□ -1.65
RBM39-240ENST00000495293 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
RBM39-240ENST00000495293 LILRA4P59901 499 aa4.75□□□□□ -1.65
RBM39-240ENST00000495293 KRTAP10-9P60411 292 aa4.75□□□□□ -1.65
RBM39-240ENST00000495293 HSD11B2P80365 405 aa4.75□□□□□ -1.65
RBM39-240ENST00000495293 MYL7Q01449 175 aa4.75□□□□□ -1.65
RBM39-240ENST00000495293 ZBTB6Q15916 424 aa4.75□□□□□ -1.65
RBM39-240ENST00000495293 PPM1LQ5SGD2 360 aa4.75□□□□□ -1.65
RBM39-240ENST00000495293 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
RBM39-240ENST00000495293 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
RBM39-240ENST00000495293 C9orf57Q5W0N0 161 aa4.75□□□□□ -1.65
RBM39-240ENST00000495293 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
RBM39-240ENST00000495293 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
RBM39-240ENST00000495293 FAM180AQ6UWF9 173 aa4.75□□□□□ -1.65
RBM39-240ENST00000495293 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
RBM39-240ENST00000495293 CYP26C1Q6V0L0 522 aa4.75□□□□□ -1.65
RBM39-240ENST00000495293 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa4.75□□□□□ -1.65
RBM39-240ENST00000495293 RTL10Q7L3V2 364 aa4.75□□□□□ -1.65
RBM39-240ENST00000495293 WDR49Q8IV35 697 aa4.75□□□□□ -1.65
RBM39-240ENST00000495293 C12orf56Q8IXR9 622 aa4.75□□□□□ -1.65
RBM39-240ENST00000495293 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
RBM39-240ENST00000495293 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
RBM39-240ENST00000495293 ELMOD1Q8N336 334 aa4.75□□□□□ -1.65
RBM39-240ENST00000495293 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
RBM39-240ENST00000495293 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
RBM39-240ENST00000495293 MNS1Q8NEH6 495 aa4.75□□□□□ -1.65
RBM39-240ENST00000495293 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa4.75□□□□□ -1.65
RBM39-240ENST00000495293 ENGASEQ8NFI3 743 aa4.75□□□□□ -1.65
RBM39-240ENST00000495293 ZNF461Q8TAF7 563 aa4.75□□□□□ -1.65
RBM39-240ENST00000495293 SLC22A17Q8WUG5 538 aa4.75□□□□□ -1.65
RBM39-240ENST00000495293 MSLNLQ96KJ4 702 aa4.75□□□□□ -1.65
RBM39-240ENST00000495293 B3GALT6Q96L58 329 aa4.75□□□□□ -1.65
RBM39-240ENST00000495293 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
RBM39-240ENST00000495293 BPIFA3Q9BQP9 254 aa4.75□□□□□ -1.65
RBM39-240ENST00000495293 VN1R3Q9BXE9 311 aa4.75□□□□□ -1.65
RBM39-240ENST00000495293 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa4.75□□□□□ -1.65
RBM39-240ENST00000495293 CXCL16Q9H2A7 254 aa4.75□□□□□ -1.65
RBM39-240ENST00000495293 PPCSQ9HAB8 311 aa4.75□□□□□ -1.65
RBM39-240ENST00000495293 PDE11AQ9HCR9 933 aa4.75□□□□□ -1.65
RBM39-240ENST00000495293 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa4.75□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.2 ms