RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000300057.4

MESP1-201, Transcript of mesoderm posterior bHLH transcription factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MESP1, Length 2,369 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1-201ENST00000300057 SOX12O15370 315 aa27.57■■■□□ 2
MESP1-201ENST00000300057 NFE2L2Q16236 605 aa27.57■■■□□ 2
MESP1-201ENST00000300057 ADAMTSL3P82987 1691 aa27.57■■■□□ 2
MESP1-201ENST00000300057 ANKLE2Q86XL3 938 aa27.57■■■□□ 2
MESP1-201ENST00000300057 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP27.56■■■□□ 2
MESP1-201ENST00000300057 PIK3R4Q99570 1358 aa27.56■■■□□ 2
MESP1-201ENST00000300057 SSH2Q76I76 1423 aa27.56■■■□□ 2
MESP1-201ENST00000300057 NALCNQ8IZF0 1738 aa27.55■■■□□ 2
MESP1-201ENST00000300057 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP27.55■■■□□ 2
MESP1-201ENST00000300057 RLBP1P12271 317 aa27.53■■■□□ 2
MESP1-201ENST00000300057 CLUAP1Q96AJ1 413 aa27.53■■■□□ 2
MESP1-201ENST00000300057 MS4A1P11836 297 aa27.52■■■□□ 2
MESP1-201ENST00000300057 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP27.52■■■□□ 2
MESP1-201ENST00000300057 SMC4Q9NTJ3 1288 aa27.52■■■□□ 2
MESP1-201ENST00000300057 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP27.52■■■□□ 2
MESP1-201ENST00000300057 TTC21AQ8NDW8 1320 aa27.52■■■□□ 2
MESP1-201ENST00000300057 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP27.51■■□□□ 1.99
MESP1-201ENST00000300057 PEAK1Q9H792 1746 aa27.5■■□□□ 1.99
MESP1-201ENST00000300057 USP31Q70CQ4 1352 aa27.5■■□□□ 1.99
MESP1-201ENST00000300057 ANKARQ7Z5J8 1434 aa27.49■■□□□ 1.99
MESP1-201ENST00000300057 PDE4AP27815 886 aa27.49■■□□□ 1.99
MESP1-201ENST00000300057 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP27.49■■□□□ 1.99
MESP1-201ENST00000300057 FMN2Q9NZ56 1722 aa27.49■■□□□ 1.99
MESP1-201ENST00000300057 SSH1Q8WYL5 1049 aa27.48■■□□□ 1.99
MESP1-201ENST00000300057 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa27.48■■□□□ 1.99
MESP1-201ENST00000300057 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa27.48■■□□□ 1.99
MESP1-201ENST00000300057 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP27.47■■□□□ 1.99
MESP1-201ENST00000300057 AEBP1Q8IUX7 1158 aa27.47■■□□□ 1.99
MESP1-201ENST00000300057 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP27.47■■□□□ 1.99
MESP1-201ENST00000300057 IGHDP01880 384 aa27.46■■□□□ 1.99
MESP1-201ENST00000300057 DLG5Q8TDM6 1919 aa27.46■■□□□ 1.99
MESP1-201ENST00000300057 SULT6B1Q6IMI4 303 aa27.45■■□□□ 1.99
MESP1-201ENST00000300057 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP27.45■■□□□ 1.98
MESP1-201ENST00000300057 PIK3C2AO00443 1686 aa27.45■■□□□ 1.98
MESP1-201ENST00000300057 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP27.44■■□□□ 1.98
MESP1-201ENST00000300057 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP27.43■■□□□ 1.98
MESP1-201ENST00000300057 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP27.43■■□□□ 1.98
MESP1-201ENST00000300057 MAP3K19Q56UN5 1328 aa27.43■■□□□ 1.98
MESP1-201ENST00000300057 BACH2Q9BYV9 841 aa27.43■■□□□ 1.98
MESP1-201ENST00000300057 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP27.42■■□□□ 1.98
MESP1-201ENST00000300057 FAM83GA6ND36 823 aa27.41■■□□□ 1.98
MESP1-201ENST00000300057 LMOD3Q0VAK6 560 aa27.41■■□□□ 1.98
MESP1-201ENST00000300057 MVPQ14764 893 aaKnown RBP27.4■■□□□ 1.98
MESP1-201ENST00000300057 NUTM2GQ5VZR2 741 aa27.4■■□□□ 1.98
MESP1-201ENST00000300057 TRIM27P14373 513 aa27.4■■□□□ 1.98
MESP1-201ENST00000300057 RGS3P49796 1198 aa27.4■■□□□ 1.98
MESP1-201ENST00000300057 NLRP6P59044 892 aa27.4■■□□□ 1.98
MESP1-201ENST00000300057 GNAI1P63096 354 aa27.39■■□□□ 1.98
MESP1-201ENST00000300057 IFT57Q9NWB7 429 aa27.39■■□□□ 1.98
MESP1-201ENST00000300057 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP27.39■■□□□ 1.98
MESP1-201ENST00000300057 DCTN1Q14203 1278 aa27.38■■□□□ 1.97
MESP1-201ENST00000300057 RGPD1P0DJD0 1748 aa27.38■■□□□ 1.97
MESP1-201ENST00000300057 AAMPQ13685 434 aa27.37■■□□□ 1.97
MESP1-201ENST00000300057 MBIPQ9NS73 344 aa27.37■■□□□ 1.97
MESP1-201ENST00000300057 SBNO1A3KN83 1393 aa27.37■■□□□ 1.97
MESP1-201ENST00000300057 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa27.37■■□□□ 1.97
MESP1-201ENST00000300057 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa27.37■■□□□ 1.97
MESP1-201ENST00000300057 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP27.36■■□□□ 1.97
MESP1-201ENST00000300057 FLT4P35916 1363 aa27.36■■□□□ 1.97
MESP1-201ENST00000300057 AMPHP49418 695 aa27.36■■□□□ 1.97
MESP1-201ENST00000300057 ZNF853P0CG23 659 aa27.35■■□□□ 1.97
MESP1-201ENST00000300057 KIF16BQ96L93 1317 aa27.35■■□□□ 1.97
MESP1-201ENST00000300057 GSE1Q14687 1217 aa27.35■■□□□ 1.97
MESP1-201ENST00000300057 ALDH1L2Q3SY69 923 aa27.34■■□□□ 1.97
MESP1-201ENST00000300057 PHF8Q9UPP1 1060 aa27.34■■□□□ 1.97
MESP1-201ENST00000300057 ABTB2Q8N961 1025 aa27.34■■□□□ 1.97
MESP1-201ENST00000300057 DDRGK1Q96HY6 314 aa27.34■■□□□ 1.97
MESP1-201ENST00000300057 C14orf37Q86TY3 774 aa27.33■■□□□ 1.97
MESP1-201ENST00000300057 TSPYL6Q8N831 410 aa27.33■■□□□ 1.97
MESP1-201ENST00000300057 ITPRIPQ8IWB1 547 aa27.33■■□□□ 1.96
MESP1-201ENST00000300057 CFAP44Q96MT7 982 aa27.33■■□□□ 1.96
MESP1-201ENST00000300057 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP27.32■■□□□ 1.96
MESP1-201ENST00000300057 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
MESP1-201ENST00000300057 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa27.32■■□□□ 1.96
MESP1-201ENST00000300057 ARHGEF10O15013 1369 aa27.31■■□□□ 1.96
MESP1-201ENST00000300057 VAMP4O75379 141 aa27.31■■□□□ 1.96
MESP1-201ENST00000300057 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
MESP1-201ENST00000300057 ZNF428Q96B54 188 aa27.29■■□□□ 1.96
MESP1-201ENST00000300057 BRPF3Q9ULD4 1205 aa27.29■■□□□ 1.96
MESP1-201ENST00000300057 TMEM57Q8N5G2 664 aa27.28■■□□□ 1.96
MESP1-201ENST00000300057 ESCO1Q5FWF5 840 aa27.28■■□□□ 1.96
MESP1-201ENST00000300057 MCM10Q7L590 875 aa27.28■■□□□ 1.96
MESP1-201ENST00000300057 DDX19BQ9UMR2 479 aa27.27■■□□□ 1.96
MESP1-201ENST00000300057 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP27.27■■□□□ 1.96
MESP1-201ENST00000300057 C8orf58Q8NAV2 365 aa27.26■■□□□ 1.95
MESP1-201ENST00000300057 EYA1Q99502 592 aa27.26■■□□□ 1.95
MESP1-201ENST00000300057 USP54Q70EL1 1684 aa27.25■■□□□ 1.95
MESP1-201ENST00000300057 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP27.25■■□□□ 1.95
MESP1-201ENST00000300057 FAM161AQ3B820 660 aa27.24■■□□□ 1.95
MESP1-201ENST00000300057 HOXC9P31274 260 aa27.24■■□□□ 1.95
MESP1-201ENST00000300057 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP27.24■■□□□ 1.95
MESP1-201ENST00000300057 IGSF1Q8N6C5 1336 aa27.23■■□□□ 1.95
MESP1-201ENST00000300057 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP27.22■■□□□ 1.95
MESP1-201ENST00000300057 C8orf34Q49A92 452 aa27.22■■□□□ 1.95
MESP1-201ENST00000300057 FOXO3O43524 673 aa27.22■■□□□ 1.95
MESP1-201ENST00000300057 PSME1Q06323 249 aa27.22■■□□□ 1.95
MESP1-201ENST00000300057 KDRP35968 1356 aa27.21■■□□□ 1.95
MESP1-201ENST00000300057 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP27.21■■□□□ 1.95
MESP1-201ENST00000300057 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP27.2■■□□□ 1.95
MESP1-201ENST00000300057 KIF24Q5T7B8 1368 aa27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.3 ms