RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000300057.4

MESP1-201, Transcript of mesoderm posterior bHLH transcription factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MESP1, Length 2,369 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1-201ENST00000300057 SOX12O15370 315 aa27.57■■■□□ 2
MESP1-201ENST00000300057 NFE2L2Q16236 605 aa27.57■■■□□ 2
MESP1-201ENST00000300057 ADAMTSL3P82987 1691 aa27.57■■■□□ 2
MESP1-201ENST00000300057 ANKLE2Q86XL3 938 aa27.57■■■□□ 2
MESP1-201ENST00000300057 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP27.56■■■□□ 2
MESP1-201ENST00000300057 PIK3R4Q99570 1358 aa27.56■■■□□ 2
MESP1-201ENST00000300057 SSH2Q76I76 1423 aa27.56■■■□□ 2
MESP1-201ENST00000300057 NALCNQ8IZF0 1738 aa27.55■■■□□ 2
MESP1-201ENST00000300057 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP27.55■■■□□ 2
MESP1-201ENST00000300057 RLBP1P12271 317 aa27.53■■■□□ 2
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MESP1-201ENST00000300057 TTC21AQ8NDW8 1320 aa27.52■■■□□ 2
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MESP1-201ENST00000300057 USP31Q70CQ4 1352 aa27.5■■□□□ 1.99
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MESP1-201ENST00000300057 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP27.49■■□□□ 1.99
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MESP1-201ENST00000300057 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa27.48■■□□□ 1.99
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MESP1-201ENST00000300057 DLG5Q8TDM6 1919 aa27.46■■□□□ 1.99
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MESP1-201ENST00000300057 BACH2Q9BYV9 841 aa27.43■■□□□ 1.98
MESP1-201ENST00000300057 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP27.42■■□□□ 1.98
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MESP1-201ENST00000300057 LMOD3Q0VAK6 560 aa27.41■■□□□ 1.98
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MESP1-201ENST00000300057 GNAI1P63096 354 aa27.39■■□□□ 1.98
MESP1-201ENST00000300057 IFT57Q9NWB7 429 aa27.39■■□□□ 1.98
MESP1-201ENST00000300057 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP27.39■■□□□ 1.98
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MESP1-201ENST00000300057 MBIPQ9NS73 344 aa27.37■■□□□ 1.97
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MESP1-201ENST00000300057 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa27.37■■□□□ 1.97
MESP1-201ENST00000300057 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa27.37■■□□□ 1.97
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MESP1-201ENST00000300057 ITPRIPQ8IWB1 547 aa27.33■■□□□ 1.96
MESP1-201ENST00000300057 CFAP44Q96MT7 982 aa27.33■■□□□ 1.96
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MESP1-201ENST00000300057 TMEM57Q8N5G2 664 aa27.28■■□□□ 1.96
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MESP1-201ENST00000300057 MCM10Q7L590 875 aa27.28■■□□□ 1.96
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MESP1-201ENST00000300057 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP27.27■■□□□ 1.96
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MESP1-201ENST00000300057 EYA1Q99502 592 aa27.26■■□□□ 1.95
MESP1-201ENST00000300057 USP54Q70EL1 1684 aa27.25■■□□□ 1.95
MESP1-201ENST00000300057 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP27.25■■□□□ 1.95
MESP1-201ENST00000300057 FAM161AQ3B820 660 aa27.24■■□□□ 1.95
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MESP1-201ENST00000300057 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP27.24■■□□□ 1.95
MESP1-201ENST00000300057 IGSF1Q8N6C5 1336 aa27.23■■□□□ 1.95
MESP1-201ENST00000300057 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP27.22■■□□□ 1.95
MESP1-201ENST00000300057 C8orf34Q49A92 452 aa27.22■■□□□ 1.95
MESP1-201ENST00000300057 FOXO3O43524 673 aa27.22■■□□□ 1.95
MESP1-201ENST00000300057 PSME1Q06323 249 aa27.22■■□□□ 1.95
MESP1-201ENST00000300057 KDRP35968 1356 aa27.21■■□□□ 1.95
MESP1-201ENST00000300057 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP27.21■■□□□ 1.95
MESP1-201ENST00000300057 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP27.2■■□□□ 1.95
MESP1-201ENST00000300057 KIF24Q5T7B8 1368 aa27.18■■□□□ 1.94
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