RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000337004.8

PTDSS1-201, Transcript of phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTDSS1, Length 2,366 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1-201ENST00000337004 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
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PTDSS1-201ENST00000337004 PGM3O95394 542 aa21.69■■□□□ 1.06
PTDSS1-201ENST00000337004 CLPTM1O96005 669 aa21.69■■□□□ 1.06
PTDSS1-201ENST00000337004 IGLV3-25P01717 112 aa21.69■■□□□ 1.06
PTDSS1-201ENST00000337004 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP21.69■■□□□ 1.068e-9■■■■□ 21.5
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PTDSS1-201ENST00000337004 CSHL1Q14406 222 aa21.69■■□□□ 1.06
PTDSS1-201ENST00000337004 AGAP9Q5VTM2 703 aa21.69■■□□□ 1.06
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PTDSS1-201ENST00000337004 ASB9Q96DX5 294 aa21.69■■□□□ 1.06
PTDSS1-201ENST00000337004 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
PTDSS1-201ENST00000337004 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
PTDSS1-201ENST00000337004 MIOSQ9NXC5 875 aa21.69■■□□□ 1.06
PTDSS1-201ENST00000337004 LZTS1Q9Y250 596 aa21.69■■□□□ 1.06
PTDSS1-201ENST00000337004 TNFAIP8O95379 198 aa21.68■■□□□ 1.06
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PTDSS1-201ENST00000337004 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
PTDSS1-201ENST00000337004 LSAMPQ13449 338 aa21.68■■□□□ 1.06
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PTDSS1-201ENST00000337004 TIGD5Q53EQ6 642 aa21.68■■□□□ 1.06
PTDSS1-201ENST00000337004 KLC3Q6P597 504 aa21.68■■□□□ 1.06
PTDSS1-201ENST00000337004 RANBP10Q6VN20 620 aa21.68■■□□□ 1.06
PTDSS1-201ENST00000337004 METTL23Q86XA0 190 aa21.68■■□□□ 1.06
PTDSS1-201ENST00000337004 SPPL2BQ8TCT7 592 aa21.68■■□□□ 1.06
PTDSS1-201ENST00000337004 CNBD2Q96M20 576 aa21.68■■□□□ 1.06
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PTDSS1-201ENST00000337004 IGSF5Q9NSI5 407 aa21.68■■□□□ 1.06
PTDSS1-201ENST00000337004 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
PTDSS1-201ENST00000337004 CASTOR2A6NHX0 329 aa21.68■■□□□ 1.06
PTDSS1-201ENST00000337004 M0QZ92 97 aa21.68■■□□□ 1.06
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PTDSS1-201ENST00000337004 PAGE1O75459 146 aa21.68■■□□□ 1.06
PTDSS1-201ENST00000337004 HLA-DQB2P05538 268 aa21.68■■□□□ 1.06
PTDSS1-201ENST00000337004 ODC1P11926 461 aa21.68■■□□□ 1.06
PTDSS1-201ENST00000337004 ETS2P15036 469 aa21.68■■□□□ 1.06
PTDSS1-201ENST00000337004 HOXC13P31276 330 aa21.68■■□□□ 1.06
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PTDSS1-201ENST00000337004 PSME3P61289 254 aa21.68■■□□□ 1.06
PTDSS1-201ENST00000337004 SULT2A1Q06520 285 aa21.68■■□□□ 1.06
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PTDSS1-201ENST00000337004 PSMD5Q16401 504 aa21.68■■□□□ 1.06
PTDSS1-201ENST00000337004 FAM171BQ6P995 826 aa21.68■■□□□ 1.06
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PTDSS1-201ENST00000337004 CHSY3Q70JA7 882 aa21.68■■□□□ 1.06
PTDSS1-201ENST00000337004 KDELC2Q7Z4H8 507 aa21.68■■□□□ 1.06
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PTDSS1-201ENST00000337004 KLHL32Q96NJ5 620 aa21.68■■□□□ 1.06
PTDSS1-201ENST00000337004 AP5M1Q9H0R1 490 aa21.68■■□□□ 1.06
PTDSS1-201ENST00000337004 PLK2Q9NYY3 685 aa21.68■■□□□ 1.06
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PTDSS1-201ENST00000337004 KCNU1A8MYU2 1149 aa21.67■■□□□ 1.06
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PTDSS1-201ENST00000337004 TAF2Q6P1X5 1199 aa21.67■■□□□ 1.06
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PTDSS1-201ENST00000337004 TBC1D13Q9NVG8 400 aa21.67■■□□□ 1.06
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PTDSS1-201ENST00000337004 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa21.67■■□□□ 1.06
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PTDSS1-201ENST00000337004 ARL5CA6NH57 179 aa21.67■■□□□ 1.06
PTDSS1-201ENST00000337004 IPO13O94829 963 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
PTDSS1-201ENST00000337004 RBP1P09455 135 aa21.67■■□□□ 1.06
PTDSS1-201ENST00000337004 PSMD8P48556 350 aa21.67■■□□□ 1.06
PTDSS1-201ENST00000337004 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
PTDSS1-201ENST00000337004 SQLEQ14534 574 aa21.67■■□□□ 1.06
PTDSS1-201ENST00000337004 RNF135Q8IUD6 432 aa21.67■■□□□ 1.06
PTDSS1-201ENST00000337004 LPPQ93052 612 aa21.67■■□□□ 1.06
PTDSS1-201ENST00000337004 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
PTDSS1-201ENST00000337004 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
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PTDSS1-201ENST00000337004 ZNF408Q9H9D4 720 aa21.67■■□□□ 1.06
PTDSS1-201ENST00000337004 MEAF6Q9HAF1 191 aa21.67■■□□□ 1.06
PTDSS1-201ENST00000337004 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
PTDSS1-201ENST00000337004 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa21.67■■□□□ 1.06
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PTDSS1-201ENST00000337004 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
PTDSS1-201ENST00000337004 RGS2P41220 211 aa21.66■■□□□ 1.06
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PTDSS1-201ENST00000337004 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
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PTDSS1-201ENST00000337004 FAM156AQ8NDB6 213 aa21.66■■□□□ 1.06
PTDSS1-201ENST00000337004 TOP1MTQ969P6 601 aa21.66■■□□□ 1.06
PTDSS1-201ENST00000337004 TSPAN17Q96FV3 270 aa21.66■■□□□ 1.06
PTDSS1-201ENST00000337004 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
PTDSS1-201ENST00000337004 UNC93B1Q9H1C4 597 aa21.66■■□□□ 1.06
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PTDSS1-201ENST00000337004 ABCC13Q9NSE7 274 aa21.66■■□□□ 1.06
PTDSS1-201ENST00000337004 HEATR9A2RTY3 570 aa21.66■■□□□ 1.06
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