RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332029.2

SOCS1-201, Transcript of suppressor of cytokine signaling 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SOCS1, Length 1,225 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS1-201ENST00000332029 ABL2P42684 1182 aa21.4■■□□□ 1.02
SOCS1-201ENST00000332029 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
SOCS1-201ENST00000332029 DCUN1D2Q6PH85 259 aa21.4■■□□□ 1.02
SOCS1-201ENST00000332029 ZNF354CQ86Y25 554 aa21.4■■□□□ 1.02
SOCS1-201ENST00000332029 OR2AP1Q8NGE2 309 aa21.4■■□□□ 1.02
SOCS1-201ENST00000332029 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
SOCS1-201ENST00000332029 BPIFA3Q9BQP9 254 aa21.4■■□□□ 1.02
SOCS1-201ENST00000332029 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
SOCS1-201ENST00000332029 KLF15Q9UIH9 416 aa21.4■■□□□ 1.02
SOCS1-201ENST00000332029 GGT7Q9UJ14 662 aa21.4■■□□□ 1.02
SOCS1-201ENST00000332029 MYO6Q9UM54 1294 aa21.4■■□□□ 1.02
SOCS1-201ENST00000332029 ITM2BQ9Y287 266 aa21.4■■□□□ 1.02
SOCS1-201ENST00000332029 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa21.4■■□□□ 1.02
SOCS1-201ENST00000332029 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
SOCS1-201ENST00000332029 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
SOCS1-201ENST00000332029 AQP9O43315 295 aa21.39■■□□□ 1.01
SOCS1-201ENST00000332029 BUB1O43683 1085 aa21.39■■□□□ 1.01
SOCS1-201ENST00000332029 CREB3O43889 395 aa21.39■■□□□ 1.01
SOCS1-201ENST00000332029 POP4O95707 220 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
SOCS1-201ENST00000332029 JUNDP17535 347 aa21.39■■□□□ 1.01
SOCS1-201ENST00000332029 PTMSP20962 102 aa21.39■■□□□ 1.01
SOCS1-201ENST00000332029 TNFAIP3P21580 790 aa21.39■■□□□ 1.01
SOCS1-201ENST00000332029 LSSP48449 732 aa21.39■■□□□ 1.01
SOCS1-201ENST00000332029 AIF1P55008 147 aa21.39■■□□□ 1.01
SOCS1-201ENST00000332029 CDKN3Q16667 212 aa21.39■■□□□ 1.01
SOCS1-201ENST00000332029 MYLK3Q32MK0 819 aa21.39■■□□□ 1.01
SOCS1-201ENST00000332029 ZNF805Q5CZA5 627 aa21.39■■□□□ 1.01
SOCS1-201ENST00000332029 TPRG1LQ5T0D9 272 aa21.39■■□□□ 1.01
SOCS1-201ENST00000332029 DENND6BQ8NEG7 585 aa21.39■■□□□ 1.01
SOCS1-201ENST00000332029 ASB12Q8WXK4 309 aa21.39■■□□□ 1.01
SOCS1-201ENST00000332029 EPAS1Q99814 870 aa21.39■■□□□ 1.01
SOCS1-201ENST00000332029 SYT11Q9BT88 431 aa21.39■■□□□ 1.01
SOCS1-201ENST00000332029 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
SOCS1-201ENST00000332029 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa21.39■■□□□ 1.01
SOCS1-201ENST00000332029 TAS2R14Q9NYV8 317 aa21.39■■□□□ 1.01
SOCS1-201ENST00000332029 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa21.39■■□□□ 1.01
SOCS1-201ENST00000332029 FZD10Q9ULW2 581 aa21.39■■□□□ 1.01
SOCS1-201ENST00000332029 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
SOCS1-201ENST00000332029 KRIT1O00522 736 aa21.38■■□□□ 1.01
SOCS1-201ENST00000332029 SPINT1O43278 529 aa21.38■■□□□ 1.01
SOCS1-201ENST00000332029 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
SOCS1-201ENST00000332029 ERVPABLB-1P60509 514 aa21.38■■□□□ 1.01
SOCS1-201ENST00000332029 PFN3P60673 137 aa21.38■■□□□ 1.01
SOCS1-201ENST00000332029 DEFB133Q30KQ1 61 aa21.38■■□□□ 1.01
SOCS1-201ENST00000332029 GUSBP11Q6P575 273 aa21.38■■□□□ 1.01
SOCS1-201ENST00000332029 LMX1AQ8TE12 382 aa21.38■■□□□ 1.01
SOCS1-201ENST00000332029 VCPIP1Q96JH7 1222 aa21.38■■□□□ 1.01
SOCS1-201ENST00000332029 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa21.38■■□□□ 1.01
SOCS1-201ENST00000332029 SHROOM3Q8TF72 1996 aa21.37■■□□□ 1.01
SOCS1-201ENST00000332029 CPED1A4D0V7 1026 aa21.37■■□□□ 1.01
SOCS1-201ENST00000332029 SMTNL1A8MU46 457 aa21.37■■□□□ 1.01
SOCS1-201ENST00000332029 WASH4PA8MWX3 477 aa21.37■■□□□ 1.01
SOCS1-201ENST00000332029 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
SOCS1-201ENST00000332029 TMCC1O94876 653 aa21.37■■□□□ 1.01
SOCS1-201ENST00000332029 UGT2B4P06133 528 aa21.37■■□□□ 1.01
SOCS1-201ENST00000332029 DESP17661 470 aa21.37■■□□□ 1.01
SOCS1-201ENST00000332029 TGM2P21980 687 aa21.37■■□□□ 1.01
SOCS1-201ENST00000332029 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
SOCS1-201ENST00000332029 OGDHQ02218 1023 aa21.37■■□□□ 1.01
SOCS1-201ENST00000332029 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
SOCS1-201ENST00000332029 ISXQ2M1V0 245 aa21.37■■□□□ 1.01
SOCS1-201ENST00000332029 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
SOCS1-201ENST00000332029 BROXQ5VW32 411 aa21.37■■□□□ 1.01
SOCS1-201ENST00000332029 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa21.37■■□□□ 1.01
SOCS1-201ENST00000332029 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
SOCS1-201ENST00000332029 BTN2A2Q8WVV5 523 aa21.37■■□□□ 1.01
SOCS1-201ENST00000332029 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa21.37■■□□□ 1.01
SOCS1-201ENST00000332029 VOPP1Q96AW1 172 aa21.37■■□□□ 1.01
SOCS1-201ENST00000332029 ARHGEF26Q96DR7 871 aa21.37■■□□□ 1.01
SOCS1-201ENST00000332029 HMCESQ96FZ2 354 aa21.37■■□□□ 1.01
SOCS1-201ENST00000332029 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa21.37■■□□□ 1.01
SOCS1-201ENST00000332029 SALL4Q9UJQ4 1053 aa21.37■■□□□ 1.01
SOCS1-201ENST00000332029 MGAQ8IWI9 3026 aa21.37■■□□□ 1.01
SOCS1-201ENST00000332029 TMCO5BA8MYB1 307 aa21.36■■□□□ 1.01
SOCS1-201ENST00000332029 RASA4BC9J798 803 aa21.36■■□□□ 1.01
SOCS1-201ENST00000332029 TPP1O14773 563 aa21.36■■□□□ 1.01
SOCS1-201ENST00000332029 RASA4O43374 803 aa21.36■■□□□ 1.01
SOCS1-201ENST00000332029 TMPRSS3P57727 454 aa21.36■■□□□ 1.01
SOCS1-201ENST00000332029 MAMLD1Q13495 774 aa21.36■■□□□ 1.01
SOCS1-201ENST00000332029 PARP15Q460N3 678 aa21.36■■□□□ 1.01
SOCS1-201ENST00000332029 FILIP1LQ4L180 1135 aa21.36■■□□□ 1.01
SOCS1-201ENST00000332029 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
SOCS1-201ENST00000332029 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa21.36■■□□□ 1.01
SOCS1-201ENST00000332029 KLHL32Q96NJ5 620 aa21.36■■□□□ 1.01
SOCS1-201ENST00000332029 IL12RB2Q99665 862 aa21.36■■□□□ 1.01
SOCS1-201ENST00000332029 TTYH3Q9C0H2 523 aa21.36■■□□□ 1.01
SOCS1-201ENST00000332029 KLC2Q9H0B6 622 aa21.36■■□□□ 1.01
SOCS1-201ENST00000332029 ASCL3Q9NQ33 180 aa21.36■■□□□ 1.01
SOCS1-201ENST00000332029 THSD1Q9NS62 852 aa21.36■■□□□ 1.01
SOCS1-201ENST00000332029 PARVAQ9NVD7 372 aa21.36■■□□□ 1.01
SOCS1-201ENST00000332029 SPASTQ9UBP0 616 aa21.36■■□□□ 1.01
SOCS1-201ENST00000332029 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
SOCS1-201ENST00000332029 LRRC53A6NM62 1247 aa21.35■■□□□ 1.01
SOCS1-201ENST00000332029 THOP1P52888 689 aa21.35■■□□□ 1.01
SOCS1-201ENST00000332029 UCNP55089 124 aa21.35■■□□□ 1.01
SOCS1-201ENST00000332029 RAD51Q06609 339 aa21.35■■□□□ 1.01
SOCS1-201ENST00000332029 SERINC3Q13530 473 aa21.35■■□□□ 1.01
SOCS1-201ENST00000332029 PTK2BQ14289 1009 aa21.35■■□□□ 1.01
SOCS1-201ENST00000332029 NR0B2Q15466 257 aa21.35■■□□□ 1.01
SOCS1-201ENST00000332029 ASIC2Q16515 512 aa21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.4 ms