RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482936.5

RTEL1-TNFRSF6B-202, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P5 TSL 2 BASIC

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 4,931 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PAGE1O75459 146 aa16.73■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CTPS1P17812 591 aa16.73■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PSME3P61289 254 aa16.73■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ACOX1Q15067 660 aa16.73■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa16.73■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZFP1Q6P2D0 407 aa16.73■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PPTC7Q8NI37 304 aa16.73■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 OSCP1Q8WVF1 389 aa16.73■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CCL22O00626 93 aa16.73■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TNFAIP8O95379 198 aa16.73■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CYP2A7P20853 494 aa16.73■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MFSD5Q6N075 450 aa16.73■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CLPTM1LQ96KA5 538 aa16.73■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DPEP3Q9H4B8 488 aa16.73■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PDZD7Q9H5P4 517 aa16.73■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa16.73■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CYLDQ9NQC7 956 aa16.73■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SOWAHBA6NEL2 793 aa16.73■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RRM2P31350 389 aa16.73■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IRF8Q02556 426 aa16.73■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ADRM1Q16186 407 aa16.73■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZBTB46Q86UZ6 589 aa16.73■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa16.73■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MPP4Q96JB8 637 aa16.73■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RGSL1A5PLK6 1076 aa16.73■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ATG7O95352 703 aa16.73■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 BPGMP07738 259 aa16.73■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DEFA1P59665 94 aa16.73■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DEFA3P59666 94 aa16.73■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CCDC15Q0P6D6 951 aa16.73■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ULK2Q8IYT8 1036 aa16.73■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF398Q8TD17 642 aa16.73■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 INVSQ9Y283 1065 aa16.73■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RAP2CQ9Y3L5 183 aa16.73■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa16.72■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 OR56A5P0C7T3 313 aa16.72■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 STRADAQ7RTN6 431 aa16.72■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FAM228AQ86W67 206 aa16.72■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa16.72■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MAF1Q9H063 256 aa16.72■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GRHL1Q9NZI5 618 aa16.72■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 EGFL7Q9UHF1 273 aa16.72■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZBTB14O43829 449 aa16.72■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DLGAP3O95886 979 aa16.72■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GABRB2P47870 512 aa16.72■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CLCN5P51795 746 aa16.72■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FBXO48Q5FWF7 155 aa16.72■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 OOSP2Q86WS3 158 aa16.72■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 OSBPL7Q9BZF2 842 aa16.72■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CACNG4Q9UBN1 327 aa16.72■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DNM1LO00429 736 aa16.72■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SERPINI2O75830 405 aa16.72■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SERPINA4P29622 427 aa16.72■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GRK3P35626 688 aa16.72■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NDUFV1P49821 464 aa16.72■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RPS7P62081 194 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 XRCC4Q13426 336 aa16.72■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP16.72■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP16.72■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RIBC2Q9H4K1 309 aa16.72■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CHKBQ9Y259 395 aa16.72■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MYRFQ9Y2G1 1151 aa16.72■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CYP7B1O75881 506 aa16.72■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TSHRP16473 764 aa16.72■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NELFEP18615 380 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PTGIRP43119 386 aa16.72■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GDF10P55107 478 aa16.72■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CDK18Q07002 472 aa16.72■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DUSP4Q13115 394 aa16.72■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DGCR6Q14129 220 aa16.72■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C16orf72Q14CZ0 275 aa16.72■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PLCL1Q15111 1095 aa16.72■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TEX44Q53QW1 395 aa16.72■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MFSD4BQ5TF39 518 aa16.72■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa16.72■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CCDC103Q8IW40 242 aa16.72■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TMEM192Q8IY95 271 aa16.72■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FBXW8Q8N3Y1 598 aa16.72■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C10orf53Q8N6V4 93 aa16.72■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FAM13CQ8NE31 585 aa16.72■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SPATA22Q8NHS9 363 aa16.72■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SORCS3Q9UPU3 1222 aa16.72■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PLLPQ9Y342 182 aa16.72■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.8 ms