RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538708.5

PTPRB-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-204ENST00000538708 APOC2P02655 101 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 PFKMP08237 780 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 ATP6V1B2P21281 511 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 MC4RP32245 332 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 CCT8P50990 548 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 IRF8Q02556 426 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 MBTD1Q05BQ5 628 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 FOXM1Q08050 763 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 WLSQ5T9L3 541 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 LRRC49Q8IUZ0 686 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 FBXL16Q8N461 479 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 PLD4Q96BZ4 506 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 CATSPER2Q96P56 530 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 ZIM3Q96PE6 472 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 BTBD9Q96Q07 612 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 IL22Q9GZX6 179 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 KCNF1Q9H3M0 494 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 ABCC6O95255 1503 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 FPGTO14772 594 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 KLHL41O60662 606 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 GRK2P25098 689 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 ICAM3P32942 547 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 NAB1Q13506 487 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 DPYSL3Q14195 570 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 RFWD3Q6PCD5 774 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 ZFP28Q8NHY6 868 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 TMEM237Q96Q45 408 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 TLR9Q9NR96 1032 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 CPQQ9Y646 472 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 ATRNO75882 1429 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 A0A087X0B3 334 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 TACR2P21452 398 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 BGNP21810 368 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 MATKP42679 507 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 SLC1A6P48664 564 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 ACSM2AQ08AH3 577 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 ACSM2BQ68CK6 577 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 PAGE2Q7Z2X7 111 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 HEXDCQ8WVB3 486 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 AUTS2Q8WXX7 1259 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 ABI3Q9P2A4 366 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 CD84Q9UIB8 345 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 PHTF1Q9UMS5 762 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 ALBP02768 609 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 PIRTP0C851 137 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 FEN1P39748 380 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 NDUFA9Q16795 377 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 GPAT3Q53EU6 434 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 NT5DC1Q5TFE4 455 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 CLEC17AQ6ZS10 378 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 TRPC4APQ8TEL6 797 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 SNX27Q96L92 541 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 KLQ9UEF7 1012 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 A0A0A0MRY4 1105 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 TK2O00142 265 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 UGT2B4P06133 528 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 ANXA6P08133 673 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 LPOP22079 712 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 IDSP22304 550 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 RUNX1T1Q06455 604 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 MMRN1Q13201 1228 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 DNAJC3Q13217 504 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 FGD2Q7Z6J4 655 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 SPPL2AQ8TCT8 520 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 SPATA13Q96N96 652 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 SLC38A3Q99624 504 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 DPEP2Q9H4A9 486 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 INPPL1O15357 1258 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 CCNE2O96020 404 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 ERBB2P04626 1255 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 ZNF23P17027 643 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 EPORP19235 508 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 VAC14Q08AM6 782 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 ZBTB17Q13105 803 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 PACS1Q6VY07 963 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 ARMCX6Q7L4S7 300 aa9.56□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.7 ms