RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	WISP1	O95388	367 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	YEATS4	O95619	227 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	NOS3	P29474	1203 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	RBMS1	P29558	406 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC6A4	P31645	630 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	NUDT1	P36639	197 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	ME1	P48163	572 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	ERVPABLB-1	P60509	514 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	RPS24	P62847	133 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	ECT2L	Q008S8	904 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	OVGP1	Q12889	678 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	ELAVL3	Q14576	367 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	FOXD4L6	Q3SYB3	417 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	SETMAR	Q53H47	684 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM133B	Q5BKY9	247 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	C1orf220	Q5T0J3	134 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	ERICH6B	Q5W0A0	696 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	KRT39	Q6A163	491 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	FOXD4L3	Q6VB84	417 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	MMS22L	Q6ZRQ5	1243 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	DSG4	Q86SJ6	1040 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	CFAP52	Q8N1V2	620 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	UBA3	Q8TBC4	463 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	CCDC47	Q96A33	483 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	MED8	Q96G25	268 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	KLHDC7B	Q96G42	594 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	VCPIP1	Q96JH7	1222 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	RPL10L	Q96L21	214 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	MRGPRX3	Q96LB0	322 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	MYOC	Q99972	504 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	HNRNPUL1	Q9BUJ2	856 aa	Known RBP eCLIP	11.17	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	DPH1	Q9BZG8	443 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	POLR1B	Q9H9Y6	1135 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	CYTH4	Q9UIA0	394 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	DMTF1	Q9Y222	760 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	HECTD1	Q9ULT8	2610 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	PRAMEF26	H0Y7S4	382 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	EIF1AY	O14602	144 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	MAPK13	O15264	365 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	OPA1	O60313	960 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	RTN2	O75298	545 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	MOCS2	O96007	188 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF18	P17022	549 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	RPL13	P26373	211 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	PSMC2	P35998	433 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	LSS	P48449	732 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	NUMB	P49757	651 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	MXI1	P50539	228 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM46C	Q5VWP2	391 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	BHLHA9	Q7RTU4	235 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	KANSL1	Q7Z3B3	1105 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	CCNJL	Q8IV13	435 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	FBXL13	Q8NEE6	735 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	OR4C6	Q8NH72	309 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	MAPK15	Q8TD08	544 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM174	Q8WUU8	243 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	FOXD4L4	Q8WXT5	416 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	OR8D1	Q8WZ84	308 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	HIC2	Q96JB3	615 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	PRICKLE1	Q96MT3	831 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	LIN7B	Q9HAP6	207 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	CNGB3	Q9NQW8	809 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	TJP2	Q9UDY2	1190 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	SLCO3A1	Q9UIG8	710 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	INTS6	Q9UL03	887 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	PLXNA2	O75051	1894 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	SPTA1	P02549	2419 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	MYO18B	Q8IUG5	2567 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A1B0GVM2	712 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC7A4	O43246	635 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	LAT	O43561	262 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	KLRC4	O43908	158 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	STX10	O60499	249 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	LUC7L3	O95232	432 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	H2AFB1	P0C5Y9	115 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	H2AFB2	P0C5Z0	115 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	THEGL	P0DJG4	465 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	SETSIP	P0DME0	302 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	KRT10	P13645	584 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	DGKA	P23743	735 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	GTF2H1	P32780	548 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	RGS7	P49802	495 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	STK19	P49842	368 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	DUSP3	P51452	185 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	DAOA	P59103	153 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	YWHAE	P62258	255 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	ADAM9	Q13443	819 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	ACCSL	Q4AC99	568 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	FSCB	Q5H9T9	825 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	C3orf38	Q5JPI3	329 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	KIAA1614	Q5VZ46	1190 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	MSANTD2	Q6P1R3	559 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC25A45	Q8N413	288 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	FAXDC2	Q96IV6	333 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	SERPINB11	Q96P15	392 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	SPAG5	Q96R06	1193 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	SSBP4	Q9BWG4	385 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	CALN1	Q9BXU9	219 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	SOX17	Q9H6I2	414 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	RAB20	Q9NX57	234 aa		11.15	□□□□□ -0.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.6 ms