RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409024.3

POLR1A-202, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 3

Gene POLR1A, Length 560 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-202ENST00000409024 RFWD3Q6PCD5 774 aa9.96□□□□□ -0.82
POLR1A-202ENST00000409024 ADGRD1Q6QNK2 874 aa9.96□□□□□ -0.82
POLR1A-202ENST00000409024 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa9.96□□□□□ -0.82
POLR1A-202ENST00000409024 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa9.96□□□□□ -0.82
POLR1A-202ENST00000409024 ANKMY2Q8IV38 441 aa9.96□□□□□ -0.82
POLR1A-202ENST00000409024 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
POLR1A-202ENST00000409024 LRRN4Q8WUT4 740 aa9.96□□□□□ -0.82
POLR1A-202ENST00000409024 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa9.96□□□□□ -0.82
POLR1A-202ENST00000409024 SLC22A12Q96S37 553 aa9.96□□□□□ -0.82
POLR1A-202ENST00000409024 CYP2S1Q96SQ9 504 aa9.96□□□□□ -0.82
POLR1A-202ENST00000409024 GORASP1Q9BQQ3 440 aa9.96□□□□□ -0.82
POLR1A-202ENST00000409024 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
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POLR1A-202ENST00000409024 SFXN1Q9H9B4 322 aa9.96□□□□□ -0.82
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POLR1A-202ENST00000409024 TDP1Q9NUW8 608 aa9.96□□□□□ -0.82
POLR1A-202ENST00000409024 EURLQ9NYK6 297 aa9.96□□□□□ -0.82
POLR1A-202ENST00000409024 SAMD15Q9P1V8 674 aa9.96□□□□□ -0.82
POLR1A-202ENST00000409024 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
POLR1A-202ENST00000409024 SEPT3Q9UH03 358 aa9.96□□□□□ -0.82
POLR1A-202ENST00000409024 ADAM21Q9UKJ8 722 aa9.96□□□□□ -0.82
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POLR1A-202ENST00000409024 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa9.96□□□□□ -0.82
POLR1A-202ENST00000409024 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
POLR1A-202ENST00000409024 C5orf42Q9H799 3197 aa9.96□□□□□ -0.82
POLR1A-202ENST00000409024 DENND4CQ5VZ89 1909 aa9.95□□□□□ -0.82
POLR1A-202ENST00000409024 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa9.95□□□□□ -0.82
POLR1A-202ENST00000409024 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa9.95□□□□□ -0.82
POLR1A-202ENST00000409024 TLDC2A0PJX2 215 aa9.95□□□□□ -0.82
POLR1A-202ENST00000409024 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
POLR1A-202ENST00000409024 H0Y626 953 aa9.95□□□□□ -0.82
POLR1A-202ENST00000409024 J3KR12 359 aa9.95□□□□□ -0.82
POLR1A-202ENST00000409024 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
POLR1A-202ENST00000409024 TBL1XO60907 577 aa9.95□□□□□ -0.82
POLR1A-202ENST00000409024 MOSPD3O75425 235 aa9.95□□□□□ -0.82
POLR1A-202ENST00000409024 USP1O94782 785 aa9.95□□□□□ -0.82
POLR1A-202ENST00000409024 ARHGEF15O94989 841 aa9.95□□□□□ -0.82
POLR1A-202ENST00000409024 HLA-DQB2P05538 268 aa9.95□□□□□ -0.82
POLR1A-202ENST00000409024 EPCAMP16422 314 aa9.95□□□□□ -0.82
POLR1A-202ENST00000409024 NR1D1P20393 614 aa9.95□□□□□ -0.82
POLR1A-202ENST00000409024 CNTFP26441 200 aa9.95□□□□□ -0.82
POLR1A-202ENST00000409024 SSTR1P30872 391 aa9.95□□□□□ -0.82
POLR1A-202ENST00000409024 ADRA1AP35348 466 aa9.95□□□□□ -0.82
POLR1A-202ENST00000409024 MSH2P43246 934 aa9.95□□□□□ -0.82
POLR1A-202ENST00000409024 SLC18A1P54219 525 aa9.95□□□□□ -0.82
POLR1A-202ENST00000409024 RPS24P62847 133 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
POLR1A-202ENST00000409024 PPP2R2AP63151 447 aa9.95□□□□□ -0.82
POLR1A-202ENST00000409024 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP9.95□□□□□ -0.82
POLR1A-202ENST00000409024 IL31Q6EBC2 164 aa9.95□□□□□ -0.82
POLR1A-202ENST00000409024 RANBP10Q6VN20 620 aa9.95□□□□□ -0.82
POLR1A-202ENST00000409024 ERMP1Q7Z2K6 904 aa9.95□□□□□ -0.82
POLR1A-202ENST00000409024 TMEM135Q86UB9 458 aa9.95□□□□□ -0.82
POLR1A-202ENST00000409024 ZNF354CQ86Y25 554 aa9.95□□□□□ -0.82
POLR1A-202ENST00000409024 CFAP52Q8N1V2 620 aa9.95□□□□□ -0.82
POLR1A-202ENST00000409024 DNAAF3Q8N9W5 541 aa9.95□□□□□ -0.82
POLR1A-202ENST00000409024 NETO2Q8NC67 525 aa9.95□□□□□ -0.82
POLR1A-202ENST00000409024 PRSS33Q8NF86 280 aa9.95□□□□□ -0.82
POLR1A-202ENST00000409024 FIBINQ8TAL6 211 aa9.95□□□□□ -0.82
POLR1A-202ENST00000409024 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
POLR1A-202ENST00000409024 FBF1Q8TES7 1133 aa9.95□□□□□ -0.82
POLR1A-202ENST00000409024 CDKL2Q92772 493 aa9.95□□□□□ -0.82
POLR1A-202ENST00000409024 ACDQ96AP0 544 aa9.95□□□□□ -0.82
POLR1A-202ENST00000409024 CENPTQ96BT3 561 aa9.95□□□□□ -0.82
POLR1A-202ENST00000409024 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
POLR1A-202ENST00000409024 MYEOVQ96EZ4 313 aa9.95□□□□□ -0.82
POLR1A-202ENST00000409024 PSKH2Q96QS6 385 aa9.95□□□□□ -0.82
POLR1A-202ENST00000409024 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
POLR1A-202ENST00000409024 RANBP9Q96S59 729 aa9.95□□□□□ -0.82
POLR1A-202ENST00000409024 TBL1YQ9BQ87 522 aa9.95□□□□□ -0.82
POLR1A-202ENST00000409024 MGME1Q9BQP7 344 aa9.95□□□□□ -0.82
POLR1A-202ENST00000409024 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
POLR1A-202ENST00000409024 CENPHQ9H3R5 247 aa9.95□□□□□ -0.82
POLR1A-202ENST00000409024 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
POLR1A-202ENST00000409024 SMPD4Q9NXE4 827 aa9.95□□□□□ -0.82
POLR1A-202ENST00000409024 MOCS1Q9NZB8 636 aa9.95□□□□□ -0.82
POLR1A-202ENST00000409024 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
POLR1A-202ENST00000409024 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP9.95□□□□□ -0.82
POLR1A-202ENST00000409024 CFAP97Q9P2B7 532 aa9.95□□□□□ -0.82
POLR1A-202ENST00000409024 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
POLR1A-202ENST00000409024 CHMP2BQ9UQN3 213 aa9.95□□□□□ -0.82
POLR1A-202ENST00000409024 FAM50BQ9Y247 325 aa9.95□□□□□ -0.82
POLR1A-202ENST00000409024 IKBKGQ9Y6K9 419 aa9.95□□□□□ -0.82
POLR1A-202ENST00000409024 OBSL1O75147 1896 aa9.95□□□□□ -0.82
POLR1A-202ENST00000409024 FAM186AA6NE01 2351 aa9.95□□□□□ -0.82
POLR1A-202ENST00000409024 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa9.94□□□□□ -0.82
POLR1A-202ENST00000409024 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa9.94□□□□□ -0.82
POLR1A-202ENST00000409024 FAM159BA6NKW6 160 aa9.94□□□□□ -0.82
POLR1A-202ENST00000409024 AVILO75366 819 aa9.94□□□□□ -0.82
POLR1A-202ENST00000409024 RFPL2O75678 378 aa9.94□□□□□ -0.82
POLR1A-202ENST00000409024 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
POLR1A-202ENST00000409024 ACVRL1P37023 503 aa9.94□□□□□ -0.82
POLR1A-202ENST00000409024 CCR2P41597 374 aa9.94□□□□□ -0.82
POLR1A-202ENST00000409024 SERPINB9P50453 376 aa9.94□□□□□ -0.82
POLR1A-202ENST00000409024 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
POLR1A-202ENST00000409024 ZXDBP98169 803 aa9.94□□□□□ -0.82
POLR1A-202ENST00000409024 SLC10A7Q0GE19 358 aa9.94□□□□□ -0.82
POLR1A-202ENST00000409024 USP4Q13107 963 aa9.94□□□□□ -0.82
POLR1A-202ENST00000409024 DNAJC3Q13217 504 aa9.94□□□□□ -0.82
POLR1A-202ENST00000409024 KCNC3Q14003 757 aa9.94□□□□□ -0.82
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