RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409402.8

SPIRE1-202, Transcript of spire type actin nucleation factor 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPIRE1, Length 5,665 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIRE1-202ENST00000409402 MAB21L3Q8N8X9 362 aa25.38■■□□□ 1.65
SPIRE1-202ENST00000409402 NSMCE2Q96MF7 247 aa25.38■■□□□ 1.65
SPIRE1-202ENST00000409402 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
SPIRE1-202ENST00000409402 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa25.38■■□□□ 1.65
SPIRE1-202ENST00000409402 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa25.37■■□□□ 1.65
SPIRE1-202ENST00000409402 MAGEC1O60732 1142 aa25.37■■□□□ 1.65
SPIRE1-202ENST00000409402 DNTTP04053 509 aa25.37■■□□□ 1.65
SPIRE1-202ENST00000409402 CPA6Q8N4T0 437 aa25.37■■□□□ 1.65
SPIRE1-202ENST00000409402 GPR152Q8TDT2 470 aa25.37■■□□□ 1.65
SPIRE1-202ENST00000409402 ACP6Q9NPH0 428 aa25.37■■□□□ 1.65
SPIRE1-202ENST00000409402 PSME2Q9UL46 239 aa25.37■■□□□ 1.65
SPIRE1-202ENST00000409402 MEI4A8MW99 385 aa25.37■■□□□ 1.65
SPIRE1-202ENST00000409402 SPATA31D3P0C874 917 aa25.37■■□□□ 1.65
SPIRE1-202ENST00000409402 LRRC55Q6ZSA7 311 aa25.37■■□□□ 1.65
SPIRE1-202ENST00000409402 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa25.37■■□□□ 1.65
SPIRE1-202ENST00000409402 FBXO22Q8NEZ5 403 aa25.37■■□□□ 1.65
SPIRE1-202ENST00000409402 SHC3Q92529 594 aa25.37■■□□□ 1.65
SPIRE1-202ENST00000409402 BRD9Q9H8M2 597 aa25.37■■□□□ 1.65
SPIRE1-202ENST00000409402 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
SPIRE1-202ENST00000409402 YDJCA8MPS7 323 aa25.37■■□□□ 1.65
SPIRE1-202ENST00000409402 NQO1P15559 274 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
SPIRE1-202ENST00000409402 S100A3P33764 101 aa25.37■■□□□ 1.65
SPIRE1-202ENST00000409402 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
SPIRE1-202ENST00000409402 PHACTR1Q9C0D0 580 aa25.37■■□□□ 1.65
SPIRE1-202ENST00000409402 RWDD3Q9Y3V2 267 aa25.37■■□□□ 1.65
SPIRE1-202ENST00000409402 PCYT1AP49585 367 aa25.37■■□□□ 1.65
SPIRE1-202ENST00000409402 PLK1P53350 603 aa25.37■■□□□ 1.65
SPIRE1-202ENST00000409402 MFSD14AQ96MC6 490 aa25.37■■□□□ 1.65
SPIRE1-202ENST00000409402 OSBPL6Q9BZF3 934 aa25.37■■□□□ 1.65
SPIRE1-202ENST00000409402 SLC39A8Q9C0K1 460 aa25.37■■□□□ 1.65
SPIRE1-202ENST00000409402 BPIFA1Q9NP55 256 aa25.37■■□□□ 1.65
SPIRE1-202ENST00000409402 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
SPIRE1-202ENST00000409402 SGTAO43765 313 aa25.37■■□□□ 1.65
SPIRE1-202ENST00000409402 SH3BGRLO75368 114 aa25.37■■□□□ 1.65
SPIRE1-202ENST00000409402 ACADSP16219 412 aa25.37■■□□□ 1.65
SPIRE1-202ENST00000409402 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa25.37■■□□□ 1.65
SPIRE1-202ENST00000409402 GPR158Q5T848 1215 aa25.37■■□□□ 1.65
SPIRE1-202ENST00000409402 CEP68Q76N32 757 aa25.37■■□□□ 1.65
SPIRE1-202ENST00000409402 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
SPIRE1-202ENST00000409402 HS6ST1O60243 411 aa25.36■■□□□ 1.65
SPIRE1-202ENST00000409402 C21orf59P57076 290 aa25.36■■□□□ 1.65
SPIRE1-202ENST00000409402 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
SPIRE1-202ENST00000409402 SNX6Q9UNH7 406 aa25.36■■□□□ 1.65
SPIRE1-202ENST00000409402 KLRC4O43908 158 aa25.36■■□□□ 1.65
SPIRE1-202ENST00000409402 AIF1P55008 147 aa25.36■■□□□ 1.65
SPIRE1-202ENST00000409402 C12orf29Q8N999 325 aa25.36■■□□□ 1.65
SPIRE1-202ENST00000409402 RSPH1Q8WYR4 309 aa25.36■■□□□ 1.65
SPIRE1-202ENST00000409402 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
SPIRE1-202ENST00000409402 COX7A2P14406 83 aa25.36■■□□□ 1.65
SPIRE1-202ENST00000409402 CLCN5P51795 746 aa25.36■■□□□ 1.65
SPIRE1-202ENST00000409402 DUSP4Q13115 394 aa25.36■■□□□ 1.65
SPIRE1-202ENST00000409402 TBCELQ5QJ74 424 aa25.36■■□□□ 1.65
SPIRE1-202ENST00000409402 TMEM26Q6ZUK4 368 aa25.36■■□□□ 1.65
SPIRE1-202ENST00000409402 FAM228AQ86W67 206 aa25.36■■□□□ 1.65
SPIRE1-202ENST00000409402 NLGN2Q8NFZ4 835 aa25.36■■□□□ 1.65
SPIRE1-202ENST00000409402 BMT2Q1RMZ1 405 aa25.36■■□□□ 1.65
SPIRE1-202ENST00000409402 LUZP2Q86TE4 346 aa25.36■■□□□ 1.65
SPIRE1-202ENST00000409402 ALG9Q9H6U8 611 aa25.36■■□□□ 1.65
SPIRE1-202ENST00000409402 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa25.36■■□□□ 1.65
SPIRE1-202ENST00000409402 BUD23O43709 281 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
SPIRE1-202ENST00000409402 GOT1P17174 413 aa25.35■■□□□ 1.65
SPIRE1-202ENST00000409402 DEFB107AQ8IZN7 70 aa25.35■■□□□ 1.65
SPIRE1-202ENST00000409402 CFAP97Q9P2B7 532 aa25.35■■□□□ 1.65
SPIRE1-202ENST00000409402 PADI3Q9ULW8 664 aa25.35■■□□□ 1.65
SPIRE1-202ENST00000409402 L1RE1Q9UN81 338 aa25.35■■□□□ 1.65
SPIRE1-202ENST00000409402 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa25.35■■□□□ 1.65
SPIRE1-202ENST00000409402 JAK1P23458 1154 aa25.35■■□□□ 1.65
SPIRE1-202ENST00000409402 MORF4L1Q9UBU8 362 aa25.35■■□□□ 1.65
SPIRE1-202ENST00000409402 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
SPIRE1-202ENST00000409402 ATRNO75882 1429 aa25.35■■□□□ 1.65
SPIRE1-202ENST00000409402 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa25.35■■□□□ 1.65
SPIRE1-202ENST00000409402 TPP1O14773 563 aa25.35■■□□□ 1.65
SPIRE1-202ENST00000409402 UQCRBP14927 111 aa25.35■■□□□ 1.65
SPIRE1-202ENST00000409402 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
SPIRE1-202ENST00000409402 FMO1Q01740 532 aa25.35■■□□□ 1.65
SPIRE1-202ENST00000409402 SELENOMQ8WWX9 145 aa25.35■■□□□ 1.65
SPIRE1-202ENST00000409402 VAV3Q9UKW4 847 aa25.35■■□□□ 1.65
SPIRE1-202ENST00000409402 PSMC3P17980 439 aa25.35■■□□□ 1.65
SPIRE1-202ENST00000409402 NOMO3P69849 1222 aa25.35■■□□□ 1.65
SPIRE1-202ENST00000409402 ANGPT1Q15389 498 aa25.35■■□□□ 1.65
SPIRE1-202ENST00000409402 TPD52L3Q96J77 140 aa25.35■■□□□ 1.65
SPIRE1-202ENST00000409402 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa25.35■■□□□ 1.65
SPIRE1-202ENST00000409402 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
SPIRE1-202ENST00000409402 BCL9LQ86UU0 1499 aa25.34■■□□□ 1.65
SPIRE1-202ENST00000409402 LRRC10BA6NIK2 292 aa25.34■■□□□ 1.65
SPIRE1-202ENST00000409402 LIASO43766 372 aa25.34■■□□□ 1.65
SPIRE1-202ENST00000409402 FGRP09769 529 aa25.34■■□□□ 1.65
SPIRE1-202ENST00000409402 PRMT2P55345 433 aa25.34■■□□□ 1.65
SPIRE1-202ENST00000409402 TCEA2Q15560 299 aa25.34■■□□□ 1.65
SPIRE1-202ENST00000409402 VSTM1Q6UX27 236 aa25.34■■□□□ 1.65
SPIRE1-202ENST00000409402 ZBTB10Q96DT7 871 aa25.34■■□□□ 1.65
SPIRE1-202ENST00000409402 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa25.34■■□□□ 1.65
SPIRE1-202ENST00000409402 TBC1D14Q9P2M4 693 aa25.34■■□□□ 1.65
SPIRE1-202ENST00000409402 KLQ9UEF7 1012 aa25.34■■□□□ 1.65
SPIRE1-202ENST00000409402 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
SPIRE1-202ENST00000409402 IFNA16P05015 189 aa25.34■■□□□ 1.65
SPIRE1-202ENST00000409402 APODP05090 189 aa25.34■■□□□ 1.65
SPIRE1-202ENST00000409402 ARHGAP17Q68EM7 881 aa25.34■■□□□ 1.65
SPIRE1-202ENST00000409402 PRR23CQ6ZRP0 262 aa25.34■■□□□ 1.65
SPIRE1-202ENST00000409402 ZNF621Q6ZSS3 439 aa25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68.1 ms