RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504450.1

SH3BP2-209, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 844 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SH3BP2-209ENST00000504450 MKS1Q9NXB0 559 aa11.04□□□□□ -0.64
SH3BP2-209ENST00000504450 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa11.04□□□□□ -0.64
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SH3BP2-209ENST00000504450 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
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SH3BP2-209ENST00000504450 TRIM49D1C9J1S8 452 aa11.03□□□□□ -0.64
SH3BP2-209ENST00000504450 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa11.03□□□□□ -0.64
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SH3BP2-209ENST00000504450 E9PAM4 449 aa11.03□□□□□ -0.64
SH3BP2-209ENST00000504450 MATN3O15232 486 aa11.03□□□□□ -0.64
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SH3BP2-209ENST00000504450 KRT37O76014 449 aa11.03□□□□□ -0.64
SH3BP2-209ENST00000504450 TIMP1P01033 207 aa11.03□□□□□ -0.64
SH3BP2-209ENST00000504450 RHOQP17081 205 aa11.03□□□□□ -0.64
SH3BP2-209ENST00000504450 NFKB1P19838 968 aa11.03□□□□□ -0.64
SH3BP2-209ENST00000504450 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
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SH3BP2-209ENST00000504450 CCL23P55773 120 aa11.03□□□□□ -0.64
SH3BP2-209ENST00000504450 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
SH3BP2-209ENST00000504450 NAB1Q13506 487 aa11.03□□□□□ -0.64
SH3BP2-209ENST00000504450 SPANXN3Q5MJ09 141 aa11.03□□□□□ -0.64
SH3BP2-209ENST00000504450 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
SH3BP2-209ENST00000504450 LVRNQ6Q4G3 990 aa11.03□□□□□ -0.64
SH3BP2-209ENST00000504450 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP11.03□□□□□ -0.64
SH3BP2-209ENST00000504450 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa11.03□□□□□ -0.64
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SH3BP2-209ENST00000504450 TMEM135Q86UB9 458 aa11.03□□□□□ -0.64
SH3BP2-209ENST00000504450 TAX1BP1Q86VP1 789 aa11.03□□□□□ -0.64
SH3BP2-209ENST00000504450 LRRC49Q8IUZ0 686 aa11.03□□□□□ -0.64
SH3BP2-209ENST00000504450 CTAGE3PQ8IX95 158 aa11.03□□□□□ -0.64
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SH3BP2-209ENST00000504450 FATE1Q969F0 183 aa11.03□□□□□ -0.64
SH3BP2-209ENST00000504450 TIFAQ96CG3 184 aa11.03□□□□□ -0.64
SH3BP2-209ENST00000504450 GRAMD1AQ96CP6 724 aa11.03□□□□□ -0.64
SH3BP2-209ENST00000504450 MTBPQ96DY7 904 aa11.03□□□□□ -0.64
SH3BP2-209ENST00000504450 APOPT1Q96IL0 206 aa11.03□□□□□ -0.64
SH3BP2-209ENST00000504450 CABS1Q96KC9 395 aa11.03□□□□□ -0.64
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SH3BP2-209ENST00000504450 TTLL2Q9BWV7 592 aa11.03□□□□□ -0.64
SH3BP2-209ENST00000504450 VN1R3Q9BXE9 311 aa11.03□□□□□ -0.64
SH3BP2-209ENST00000504450 VPS11Q9H270 941 aa11.03□□□□□ -0.64
SH3BP2-209ENST00000504450 KDM4CQ9H3R0 1056 aa11.03□□□□□ -0.64
SH3BP2-209ENST00000504450 HIPK3Q9H422 1215 aa11.03□□□□□ -0.64
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SH3BP2-209ENST00000504450 SAMD15Q9P1V8 674 aa11.03□□□□□ -0.64
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SH3BP2-209ENST00000504450 MTRRQ9UBK8 725 aa11.03□□□□□ -0.64
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SH3BP2-209ENST00000504450 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa11.02□□□□□ -0.65
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