RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368547.3

ECHS1-201, Transcript of enoyl-CoA hydratase, short chain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ECHS1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1-201ENST00000368547 SERPINB6P35237 376 aa30.3■■■□□ 2.44
ECHS1-201ENST00000368547 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP30.3■■■□□ 2.44
ECHS1-201ENST00000368547 SLC44A4Q53GD3 710 aa30.3■■■□□ 2.44
ECHS1-201ENST00000368547 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP30.3■■■□□ 2.44
ECHS1-201ENST00000368547 BBS12Q6ZW61 710 aa30.3■■■□□ 2.44
ECHS1-201ENST00000368547 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP30.3■■■□□ 2.44
ECHS1-201ENST00000368547 LZTR1Q8N653 840 aa30.3■■■□□ 2.44
ECHS1-201ENST00000368547 LMLNQ96KR4 655 aa30.3■■■□□ 2.44
ECHS1-201ENST00000368547 A0A0D9SEW6 157 aa30.29■■■□□ 2.44
ECHS1-201ENST00000368547 ILVBLA1L0T0 632 aa30.29■■■□□ 2.44
ECHS1-201ENST00000368547 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP30.29■■■□□ 2.44
ECHS1-201ENST00000368547 TJP3O95049 919 aa30.29■■■□□ 2.44
ECHS1-201ENST00000368547 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP30.29■■■□□ 2.44
ECHS1-201ENST00000368547 CSKP41240 450 aa30.29■■■□□ 2.44
ECHS1-201ENST00000368547 NUMBP49757 651 aa30.29■■■□□ 2.44
ECHS1-201ENST00000368547 GNA12Q03113 381 aa30.29■■■□□ 2.44
ECHS1-201ENST00000368547 GBE1Q04446 702 aa30.29■■■□□ 2.44
ECHS1-201ENST00000368547 KDSRQ06136 332 aa30.29■■■□□ 2.44
ECHS1-201ENST00000368547 MESP2Q0VG99 397 aa30.29■■■□□ 2.44
ECHS1-201ENST00000368547 GRAMD4Q6IC98 578 aa30.29■■■□□ 2.44
ECHS1-201ENST00000368547 MUC3BQ9H195 1237 aa30.29■■■□□ 2.44
ECHS1-201ENST00000368547 GGA2Q9UJY4 613 aa30.29■■■□□ 2.44
ECHS1-201ENST00000368547 HEY1Q9Y5J3 304 aa30.29■■■□□ 2.44
ECHS1-201ENST00000368547 TRIOO75962 3097 aa30.29■■■□□ 2.44
ECHS1-201ENST00000368547 NDST2P52849 883 aa30.29■■■□□ 2.44
ECHS1-201ENST00000368547 OXCT1P55809 520 aa30.29■■■□□ 2.44
ECHS1-201ENST00000368547 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP30.29■■■□□ 2.44
ECHS1-201ENST00000368547 C1orf228Q6PIY5 440 aa30.29■■■□□ 2.44
ECHS1-201ENST00000368547 TXNDC11Q6PKC3 985 aa30.29■■■□□ 2.44
ECHS1-201ENST00000368547 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa30.29■■■□□ 2.44
ECHS1-201ENST00000368547 TP53INP2Q8IXH6 220 aa30.29■■■□□ 2.44
ECHS1-201ENST00000368547 UBALD2Q8IYN6 164 aa30.29■■■□□ 2.44
ECHS1-201ENST00000368547 RUBCNQ92622 972 aa30.29■■■□□ 2.44
ECHS1-201ENST00000368547 PNKPQ96T60 521 aa30.29■■■□□ 2.44
ECHS1-201ENST00000368547 AP1M1Q9BXS5 423 aa30.29■■■□□ 2.44
ECHS1-201ENST00000368547 LRRC19Q9H756 370 aa30.29■■■□□ 2.44
ECHS1-201ENST00000368547 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa30.29■■■□□ 2.44
ECHS1-201ENST00000368547 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa30.28■■■□□ 2.44
ECHS1-201ENST00000368547 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP30.28■■■□□ 2.44
ECHS1-201ENST00000368547 MAP3K6O95382 1288 aa30.28■■■□□ 2.44
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ECHS1-201ENST00000368547 GLULP15104 373 aa30.28■■■□□ 2.44
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ECHS1-201ENST00000368547 NPNTQ6UXI9 565 aa30.28■■■□□ 2.44
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF783Q6ZMS7 281 aa30.28■■■□□ 2.44
ECHS1-201ENST00000368547 PHTF2Q8N3S3 785 aa30.28■■■□□ 2.44
ECHS1-201ENST00000368547 OR7D4Q8NG98 312 aa30.28■■■□□ 2.44
ECHS1-201ENST00000368547 FEM1AQ9BSK4 669 aa30.28■■■□□ 2.44
ECHS1-201ENST00000368547 SLC39A8Q9C0K1 460 aa30.28■■■□□ 2.44
ECHS1-201ENST00000368547 MAGEH1Q9H213 219 aa30.28■■■□□ 2.44
ECHS1-201ENST00000368547 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa30.28■■■□□ 2.44
ECHS1-201ENST00000368547 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP30.28■■■□□ 2.44
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ECHS1-201ENST00000368547 CA14Q9ULX7 337 aa30.28■■■□□ 2.44
ECHS1-201ENST00000368547 RASA4BC9J798 803 aa30.27■■■□□ 2.44
ECHS1-201ENST00000368547 RASA4O43374 803 aa30.27■■■□□ 2.44
ECHS1-201ENST00000368547 TGM2P21980 687 aa30.27■■■□□ 2.44
ECHS1-201ENST00000368547 GALK1P51570 392 aa30.27■■■□□ 2.44
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ECHS1-201ENST00000368547 SLC12A1Q13621 1099 aa30.27■■■□□ 2.44
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ECHS1-201ENST00000368547 GEN1Q17RS7 908 aa30.27■■■□□ 2.44
ECHS1-201ENST00000368547 APCDD1Q8J025 514 aa30.27■■■□□ 2.44
ECHS1-201ENST00000368547 CCDC33Q8N5R6 958 aa30.27■■■□□ 2.44
ECHS1-201ENST00000368547 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP30.27■■■□□ 2.44
ECHS1-201ENST00000368547 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP30.27■■■□□ 2.44
ECHS1-201ENST00000368547 HAUS1Q96CS2 278 aa30.27■■■□□ 2.44
ECHS1-201ENST00000368547 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP30.27■■■□□ 2.44
ECHS1-201ENST00000368547 P2RY13Q9BPV8 354 aa30.27■■■□□ 2.44
ECHS1-201ENST00000368547 DTLQ9NZJ0 730 aa30.27■■■□□ 2.44
ECHS1-201ENST00000368547 OR51B4Q9Y5P0 310 aa30.27■■■□□ 2.44
ECHS1-201ENST00000368547 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP30.26■■■□□ 2.44
ECHS1-201ENST00000368547 ACVRL1P37023 503 aa30.26■■■□□ 2.44
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ECHS1-201ENST00000368547 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP30.26■■■□□ 2.44
ECHS1-201ENST00000368547 PARP15Q460N3 678 aa30.26■■■□□ 2.44
ECHS1-201ENST00000368547 C8orf74Q6P047 294 aa30.26■■■□□ 2.44
ECHS1-201ENST00000368547 TPRG1Q6ZUI0 275 aa30.26■■■□□ 2.44
ECHS1-201ENST00000368547 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP30.26■■■□□ 2.44
ECHS1-201ENST00000368547 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP30.26■■■□□ 2.44
ECHS1-201ENST00000368547 ALG14Q96F25 216 aa30.26■■■□□ 2.44
ECHS1-201ENST00000368547 HMCESQ96FZ2 354 aa30.26■■■□□ 2.44
ECHS1-201ENST00000368547 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP30.26■■■□□ 2.44
ECHS1-201ENST00000368547 WNT16Q9UBV4 365 aa30.26■■■□□ 2.44
ECHS1-201ENST00000368547 VPS28Q9UK41 221 aa30.26■■■□□ 2.44
ECHS1-201ENST00000368547 FBXL21Q9UKT6 434 aa30.26■■■□□ 2.44
ECHS1-201ENST00000368547 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP30.26■■■□□ 2.44
ECHS1-201ENST00000368547 DFFAO00273 331 aa30.25■■■□□ 2.43
ECHS1-201ENST00000368547 PLEKHG6Q3KR16 790 aa30.25■■■□□ 2.43
ECHS1-201ENST00000368547 FUT11Q495W5 492 aa30.25■■■□□ 2.43
ECHS1-201ENST00000368547 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP30.25■■■□□ 2.43
ECHS1-201ENST00000368547 P3H4Q92791 437 aa30.25■■■□□ 2.43
ECHS1-201ENST00000368547 MSANTD3Q96H12 275 aa30.25■■■□□ 2.43
ECHS1-201ENST00000368547 KRT12Q99456 494 aa30.25■■■□□ 2.43
ECHS1-201ENST00000368547 HOMER3Q9NSC5 361 aa30.25■■■□□ 2.43
ECHS1-201ENST00000368547 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa30.25■■■□□ 2.43
ECHS1-201ENST00000368547 APOC2P02655 101 aa30.25■■■□□ 2.43
ECHS1-201ENST00000368547 RHOXF2BP0C7M4 288 aa30.25■■■□□ 2.43
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