RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000229304.4

APOBEC1-201, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene APOBEC1, Length 879 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1-201ENST00000229304 KCNK1O00180 336 aa9.76□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 MATN3O15232 486 aa9.76□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 MAFKO60675 156 aa9.76□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 AP2A1O95782 977 aa9.76□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 TBX18O95935 607 aa9.76□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 FGBP02675 491 aa9.76□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 LINC00271P0C7V0 271 aa9.76□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 ACRP10323 421 aa9.76□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 CTSAP10619 480 aa9.76□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 PRKCHP24723 683 aa9.76□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 PSMB4P28070 264 aa9.76□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 SSTR1P30872 391 aa9.76□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 HPDP32754 393 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 CD68P34810 354 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 IFNAR2P48551 515 aa9.76□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 ATP1A2P50993 1020 aa9.76□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 SLC18A1P54219 525 aa9.76□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 GNGT1P63211 74 aa9.76□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 TNK2Q07912 1038 aa9.76□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 PLD1Q13393 1074 aa9.76□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 VEPH1Q14D04 833 aa9.76□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 HECTD3Q5T447 861 aa9.76□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 FAXCQ5TGI0 409 aa9.76□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 KCTD11Q693B1 232 aa9.76□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 FBXL22Q6P050 247 aa9.76□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 ZNF449Q6P9G9 518 aa9.76□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 ANKMY2Q8IV38 441 aa9.76□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 IGDCC3Q8IVU1 814 aa9.76□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP9.76□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 FIBCD1Q8N539 461 aa9.76□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 ATPAF2Q8N5M1 289 aa9.76□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 CCDC33Q8N5R6 958 aa9.76□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa9.76□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 FBF1Q8TES7 1133 aa9.76□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 LRRN4Q8WUT4 740 aa9.76□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 PLD4Q96BZ4 506 aa9.76□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 IL12RB2Q99665 862 aa9.76□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 NAT9Q9BTE0 207 aa9.76□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 ZYG11BQ9C0D3 744 aa9.76□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 SLC39A8Q9C0K1 460 aa9.76□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 ZBP1Q9H171 429 aa9.76□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 CYP4F11Q9HBI6 524 aa9.76□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa9.76□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 SEPT10Q9P0V9 454 aa9.76□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 CHMP2BQ9UQN3 213 aa9.76□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 ASB3Q9Y575 518 aa9.76□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa9.75□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 SDR42E2A6NKP2 422 aa9.75□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 C2CD2LO14523 706 aa9.75□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 TEX28O15482 410 aa9.75□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 AVILO75366 819 aa9.75□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 BANF1O75531 89 aa9.75□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 FAM155BO75949 473 aa9.75□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 FGF18O76093 207 aa9.75□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 ALDH1A2O94788 518 aa9.75□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 CPP00450 1065 aa9.75□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 C1QAP02745 245 aa9.75□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 CD46P15529 392 aa9.75□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 ELF1P32519 619 aa9.75□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 LSP1P33241 339 aa9.75□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 MAPKAPK2P49137 400 aa9.75□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 FOXC1Q12948 553 aa9.75□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 ZBTB17Q13105 803 aa9.75□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 PRPSAP1Q14558 356 aa9.75□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 ANO4Q32M45 955 aa9.75□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 ARMC3Q5W041 872 aa9.75□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 STEAP4Q687X5 459 aa9.75□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 FAM117BQ6P1L5 589 aa9.75□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 OTOP2Q7RTS6 562 aa9.75□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 ITIH5Q86UX2 942 aa9.75□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 TRABD2AQ86V40 505 aa9.75□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 CYP4X1Q8N118 509 aa9.75□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 GSDMBQ8TAX9 411 aa9.75□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 SLC44A1Q8WWI5 657 aa9.75□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 PSMG2Q969U7 264 aa9.75□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 FCRL5Q96RD9 977 aa9.75□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 GORASP1Q9BQQ3 440 aa9.75□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 CCDC134Q9H6E4 229 aa9.75□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 CCSER2Q9H7U1 834 aa9.75□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 PLAC1Q9HBJ0 212 aa9.75□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 CASS4Q9NQ75 786 aa9.75□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 ZNF212Q9UDV6 495 aa9.75□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa9.75□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 RSPH14Q9UHP6 348 aa9.75□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 ZNF180Q9UJW8 692 aa9.75□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.7 ms