RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460558.5

ECHDC1-211, Transcript of ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1, humanhuman

TSL 5

Gene ECHDC1, Length 301 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC1-211ENST00000460558 SLC5A5Q92911 643 aa4.34□□□□□ -1.71
ECHDC1-211ENST00000460558 EXTL1Q92935 676 aa4.34□□□□□ -1.71
ECHDC1-211ENST00000460558 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP4.34□□□□□ -1.71
ECHDC1-211ENST00000460558 IGSF8Q969P0 613 aa4.34□□□□□ -1.71
ECHDC1-211ENST00000460558 VCPIP1Q96JH7 1222 aa4.34□□□□□ -1.71
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ECHDC1-211ENST00000460558 HRASLS5Q96KN8 279 aa4.34□□□□□ -1.71
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ECHDC1-211ENST00000460558 SLC46A2Q9BY10 475 aa4.34□□□□□ -1.71
ECHDC1-211ENST00000460558 SLC25A18Q9H1K4 315 aa4.34□□□□□ -1.71
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ECHDC1-211ENST00000460558 DKK3Q9UBP4 350 aa4.34□□□□□ -1.71
ECHDC1-211ENST00000460558 STK17AQ9UEE5 414 aa4.34□□□□□ -1.71
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ECHDC1-211ENST00000460558 PKDREJQ9NTG1 2253 aa4.34□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 CSPG4Q6UVK1 2322 aa4.34□□□□□ -1.72
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ECHDC1-211ENST00000460558 LOC100996750A0A140TA64 210 aa4.33□□□□□ -1.72
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ECHDC1-211ENST00000460558 A1L4Q6 167 aa4.33□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 TMEM150BA6NC51 233 aa4.33□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 ANTXRLA6NF34 631 aa4.33□□□□□ -1.72
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ECHDC1-211ENST00000460558 TBX3O15119 743 aa4.33□□□□□ -1.72
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ECHDC1-211ENST00000460558 DFNA5O60443 496 aa4.33□□□□□ -1.72
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ECHDC1-211ENST00000460558 NFATC1O95644 943 aa4.33□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 PROCP04070 461 aa4.33□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 APODP05090 189 aa4.33□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 ZGLP1P0C6A0 271 aa4.33□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 NCAM1P13591 858 aa4.33□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 FPR2P25090 351 aa4.33□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP4.33□□□□□ -1.722e-7■■■□□ 18.3
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ECHDC1-211ENST00000460558 ASIC1P78348 528 aa4.33□□□□□ -1.72
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ECHDC1-211ENST00000460558 CADM4Q8NFZ8 388 aa4.33□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP4.33□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP4.33□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP4.33□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 SSC4DQ8WTU2 575 aa4.33□□□□□ -1.72
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ECHDC1-211ENST00000460558 PGLYRP2Q96PD5 576 aa4.33□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 JMJD8Q96S16 334 aa4.33□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP4.33□□□□□ -1.72
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ECHDC1-211ENST00000460558 JAM3Q9BX67 310 aa4.33□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa4.33□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa4.33□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 SLC6A20Q9NP91 592 aa4.33□□□□□ -1.72
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ECHDC1-211ENST00000460558 FBLN5Q9UBX5 448 aa4.33□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 ANAPC2Q9UJX6 822 aa4.33□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 NUB1Q9Y5A7 615 aa4.33□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa4.33□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 JMJD1CQ15652 2540 aa4.33□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 SHANK1Q9Y566 2161 aa4.33□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 PCSK5Q92824 1860 aa4.32□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP4.32□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 A0A1B0GUA9 196 aa4.32□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 SLC12A8A0AV02 714 aa4.32□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 NOTOA8MTQ0 251 aa4.32□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP4.32□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 KAT7O95251 611 aa4.32□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 MT-CO3P00414 261 aa4.32□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 PRNPP04156 253 aa4.32□□□□□ -1.72
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