RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366976.3

NSL1-201, Transcript of NSL1, MIS12 kinetochore complex component, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene NSL1, Length 722 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSL1-201ENST00000366976 DCDC2BA2VCK2 349 aa16.01■□□□□ 0.15
NSL1-201ENST00000366976 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
NSL1-201ENST00000366976 NDUFS2O75306 463 aa16.01■□□□□ 0.15
NSL1-201ENST00000366976 ADCY5O95622 1261 aa16.01■□□□□ 0.15
NSL1-201ENST00000366976 PDGFRAP16234 1089 aa16.01■□□□□ 0.15
NSL1-201ENST00000366976 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
NSL1-201ENST00000366976 AIF1P55008 147 aa16.01■□□□□ 0.15
NSL1-201ENST00000366976 DUOXA1Q1HG43 343 aa16.01■□□□□ 0.15
NSL1-201ENST00000366976 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
NSL1-201ENST00000366976 WDR45BQ5MNZ6 344 aa16.01■□□□□ 0.15
NSL1-201ENST00000366976 ACAD10Q6JQN1 1059 aa16.01■□□□□ 0.15
NSL1-201ENST00000366976 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
NSL1-201ENST00000366976 TMEFF1Q8IYR6 380 aa16.01■□□□□ 0.15
NSL1-201ENST00000366976 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa16.01■□□□□ 0.15
NSL1-201ENST00000366976 IGSF8Q969P0 613 aa16.01■□□□□ 0.15
NSL1-201ENST00000366976 ALG14Q96F25 216 aa16.01■□□□□ 0.15
NSL1-201ENST00000366976 ADAM33Q9BZ11 813 aa16.01■□□□□ 0.15
NSL1-201ENST00000366976 INVSQ9Y283 1065 aa16.01■□□□□ 0.15
NSL1-201ENST00000366976 OR51B4Q9Y5P0 310 aa16.01■□□□□ 0.15
NSL1-201ENST00000366976 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
NSL1-201ENST00000366976 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa16■□□□□ 0.15
NSL1-201ENST00000366976 ANKRD62A6NC57 917 aa16■□□□□ 0.15
NSL1-201ENST00000366976 TM4SF5O14894 197 aa16■□□□□ 0.15
NSL1-201ENST00000366976 SERPINC1P01008 464 aa16■□□□□ 0.15
NSL1-201ENST00000366976 DESP17661 470 aa16■□□□□ 0.15
NSL1-201ENST00000366976 ADRA1BP35368 520 aa16■□□□□ 0.15
NSL1-201ENST00000366976 PTGER3P43115 390 aa16■□□□□ 0.15
NSL1-201ENST00000366976 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
NSL1-201ENST00000366976 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
NSL1-201ENST00000366976 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
NSL1-201ENST00000366976 MON1BQ7L1V2 547 aa16■□□□□ 0.15
NSL1-201ENST00000366976 SLC30A5Q8TAD4 765 aa16■□□□□ 0.15
NSL1-201ENST00000366976 NTAN1Q96AB6 310 aa16■□□□□ 0.15
NSL1-201ENST00000366976 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
NSL1-201ENST00000366976 TTYH3Q9C0H2 523 aa16■□□□□ 0.15
NSL1-201ENST00000366976 SGK2Q9HBY8 427 aa16■□□□□ 0.15
NSL1-201ENST00000366976 CBX8Q9HC52 389 aa16■□□□□ 0.15
NSL1-201ENST00000366976 OSGEPQ9NPF4 335 aa16■□□□□ 0.15
NSL1-201ENST00000366976 VANGL2Q9ULK5 521 aa16■□□□□ 0.15
NSL1-201ENST00000366976 SDK1Q7Z5N4 2213 aa15.99■□□□□ 0.15
NSL1-201ENST00000366976 THADAQ6YHU6 1953 aa15.99■□□□□ 0.15
NSL1-201ENST00000366976 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa15.99■□□□□ 0.15
NSL1-201ENST00000366976 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
NSL1-201ENST00000366976 ILVBLA1L0T0 632 aa15.99■□□□□ 0.15
NSL1-201ENST00000366976 METTL12A8MUP2 240 aa15.99■□□□□ 0.15
NSL1-201ENST00000366976 GOLGA8SH3BPF8 625 aa15.99■□□□□ 0.15
NSL1-201ENST00000366976 ALOX15BO15296 676 aa15.99■□□□□ 0.15
NSL1-201ENST00000366976 ATP9BO43861 1147 aa15.99■□□□□ 0.15
NSL1-201ENST00000366976 DNTTP04053 509 aa15.99■□□□□ 0.15
NSL1-201ENST00000366976 SERPINF2P08697 491 aa15.99■□□□□ 0.15
NSL1-201ENST00000366976 GNSP15586 552 aa15.99■□□□□ 0.15
NSL1-201ENST00000366976 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
NSL1-201ENST00000366976 TNFAIP3P21580 790 aa15.99■□□□□ 0.15
NSL1-201ENST00000366976 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
NSL1-201ENST00000366976 KRT83P78385 493 aa15.99■□□□□ 0.15
NSL1-201ENST00000366976 SLC20A2Q08357 652 aa15.99■□□□□ 0.15
NSL1-201ENST00000366976 SCAPQ12770 1279 aa15.99■□□□□ 0.15
NSL1-201ENST00000366976 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
NSL1-201ENST00000366976 ST3GAL2Q16842 350 aa15.99■□□□□ 0.15
NSL1-201ENST00000366976 CCDC14Q49A88 953 aa15.99■□□□□ 0.15
NSL1-201ENST00000366976 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
NSL1-201ENST00000366976 C6orf118Q5T5N4 469 aa15.99■□□□□ 0.15
NSL1-201ENST00000366976 C9orf64Q5T6V5 341 aa15.99■□□□□ 0.15
NSL1-201ENST00000366976 TRNP1Q6NT89 227 aa15.99■□□□□ 0.15
NSL1-201ENST00000366976 FRMD1Q8N878 549 aa15.99■□□□□ 0.15
NSL1-201ENST00000366976 RXFP2Q8WXD0 754 aa15.99■□□□□ 0.15
NSL1-201ENST00000366976 PIGKQ92643 395 aa15.99■□□□□ 0.15
NSL1-201ENST00000366976 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
NSL1-201ENST00000366976 CFAP57Q96MR6 1250 aa15.99■□□□□ 0.15
NSL1-201ENST00000366976 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
NSL1-201ENST00000366976 C11orf70Q9BRQ4 267 aa15.99■□□□□ 0.15
NSL1-201ENST00000366976 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
NSL1-201ENST00000366976 SELENOOQ9BVL4 669 aa15.99■□□□□ 0.15
NSL1-201ENST00000366976 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa15.99■□□□□ 0.15
NSL1-201ENST00000366976 SIK2Q9H0K1 926 aa15.99■□□□□ 0.15
NSL1-201ENST00000366976 COX16Q9P0S2 106 aa15.99■□□□□ 0.15
NSL1-201ENST00000366976 SLC6A14Q9UN76 642 aa15.99■□□□□ 0.15
NSL1-201ENST00000366976 CYP8B1Q9UNU6 501 aa15.99■□□□□ 0.15
NSL1-201ENST00000366976 HS3ST2Q9Y278 367 aa15.99■□□□□ 0.15
NSL1-201ENST00000366976 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
NSL1-201ENST00000366976 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
NSL1-201ENST00000366976 E9PAM4 449 aa15.98■□□□□ 0.15
NSL1-201ENST00000366976 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa15.98■□□□□ 0.15
NSL1-201ENST00000366976 I6L893 689 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
NSL1-201ENST00000366976 HTR7P34969 479 aa15.98■□□□□ 0.15
NSL1-201ENST00000366976 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
NSL1-201ENST00000366976 ETFBP38117 255 aa15.98■□□□□ 0.15
NSL1-201ENST00000366976 PBX1P40424 430 aa15.98■□□□□ 0.15
NSL1-201ENST00000366976 RPS14P62263 151 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
NSL1-201ENST00000366976 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
NSL1-201ENST00000366976 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa15.98■□□□□ 0.15
NSL1-201ENST00000366976 ARTNQ5T4W7 220 aa15.98■□□□□ 0.15
NSL1-201ENST00000366976 STPG1Q5TH74 334 aa15.98■□□□□ 0.15
NSL1-201ENST00000366976 SFMBT2Q5VUG0 894 aa15.98■□□□□ 0.15
NSL1-201ENST00000366976 LRSAM1Q6UWE0 723 aa15.98■□□□□ 0.15
NSL1-201ENST00000366976 DSG4Q86SJ6 1040 aa15.98■□□□□ 0.15
NSL1-201ENST00000366976 MCOLN2Q8IZK6 566 aa15.98■□□□□ 0.15
NSL1-201ENST00000366976 APCDD1Q8J025 514 aa15.98■□□□□ 0.15
NSL1-201ENST00000366976 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
NSL1-201ENST00000366976 NCAPGQ9BPX3 1015 aa15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.3 ms