RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485002.6

MEGF6-205, Transcript of multiple EGF like domains 6, human

TSL 5

Gene MEGF6, Length 4,705 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MEGF6-205	ENST00000485002	TWISTNB	Q3B726	338 aa	Predicted RBP	18.98	■□□□□ 0.63
MEGF6-205	ENST00000485002	UQCRHL	A0A096LP55	91 aa		18.98	■□□□□ 0.63
MEGF6-205	ENST00000485002	UQCRH	P07919	91 aa		18.98	■□□□□ 0.63
MEGF6-205	ENST00000485002	CREBRF	Q8IUR6	639 aa		18.98	■□□□□ 0.63
MEGF6-205	ENST00000485002	TSPYL4	Q9UJ04	414 aa		18.97	■□□□□ 0.63
MEGF6-205	ENST00000485002	MPND	Q8N594	471 aa		18.96	■□□□□ 0.63
MEGF6-205	ENST00000485002	TAF7L	Q5H9L4	462 aa		18.96	■□□□□ 0.63
MEGF6-205	ENST00000485002	RARS	P54136	660 aa	Known RBP	18.96	■□□□□ 0.63
MEGF6-205	ENST00000485002	CCDC27	Q2M243	656 aa		18.96	■□□□□ 0.63
MEGF6-205	ENST00000485002	CCDC9	Q9Y3X0	531 aa	Known RBP	18.96	■□□□□ 0.63
MEGF6-205	ENST00000485002	LRPPRC	P42704	1394 aa	Known RBP	18.96	■□□□□ 0.63
MEGF6-205	ENST00000485002	ZMYND15	Q9H091	742 aa		18.96	■□□□□ 0.63
MEGF6-205	ENST00000485002	GPS2	Q13227	327 aa		18.95	■□□□□ 0.62
MEGF6-205	ENST00000485002	TEX35	Q5T0J7	233 aa		18.95	■□□□□ 0.62
MEGF6-205	ENST00000485002	NKTR	P30414	1462 aa	Known RBP	18.95	■□□□□ 0.62
MEGF6-205	ENST00000485002	FIBP	O43427	364 aa		18.95	■□□□□ 0.62
MEGF6-205	ENST00000485002	CSB-PGBD3	P0DP91	1061 aa		18.95	■□□□□ 0.62
MEGF6-205	ENST00000485002	TEF	Q10587	303 aa		18.95	■□□□□ 0.62
MEGF6-205	ENST00000485002	HSP90AB4P	Q58FF6	505 aa		18.94	■□□□□ 0.62
MEGF6-205	ENST00000485002	TRIM5	Q9C035	493 aa		18.94	■□□□□ 0.62
MEGF6-205	ENST00000485002	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		18.94	■□□□□ 0.62
MEGF6-205	ENST00000485002	CCDC73	Q6ZRK6	1079 aa		18.94	■□□□□ 0.62
MEGF6-205	ENST00000485002	BCL11B	Q9C0K0	894 aa	Predicted RBP	18.94	■□□□□ 0.62
MEGF6-205	ENST00000485002	ERC2	O15083	957 aa		18.93	■□□□□ 0.62
MEGF6-205	ENST00000485002	ATP10B	O94823	1461 aa		18.93	■□□□□ 0.62
MEGF6-205	ENST00000485002	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		18.93	■□□□□ 0.62
MEGF6-205	ENST00000485002	PODXL2	Q9NZ53	605 aa		18.93	■□□□□ 0.62
MEGF6-205	ENST00000485002	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		18.93	■□□□□ 0.62
MEGF6-205	ENST00000485002	TMEM57	Q8N5G2	664 aa		18.92	■□□□□ 0.62
MEGF6-205	ENST00000485002	PRAM1	Q96QH2	718 aa		18.92	■□□□□ 0.62
MEGF6-205	ENST00000485002	PDCL3	Q9H2J4	239 aa		18.92	■□□□□ 0.62
MEGF6-205	ENST00000485002	GNAI3	P08754	354 aa		18.91	■□□□□ 0.62
MEGF6-205	ENST00000485002	UBTFL1	P0CB47	393 aa	Predicted RBP	18.91	■□□□□ 0.62
MEGF6-205	ENST00000485002	TOMM22	Q9NS69	142 aa		18.91	■□□□□ 0.62
MEGF6-205	ENST00000485002	NPHP1	O15259	732 aa		18.91	■□□□□ 0.62
MEGF6-205	ENST00000485002	TPD52L1	Q16890	204 aa	Predicted RBP	18.91	■□□□□ 0.62
MEGF6-205	ENST00000485002	FBXW7	Q969H0	707 aa		18.91	■□□□□ 0.62
MEGF6-205	ENST00000485002	CLCN1	P35523	988 aa		18.91	■□□□□ 0.62
MEGF6-205	ENST00000485002	RASSF8	Q8NHQ8	419 aa		18.9	■□□□□ 0.62
MEGF6-205	ENST00000485002	ARGLU1	Q9NWB6	273 aa	Predicted RBP	18.9	■□□□□ 0.62
MEGF6-205	ENST00000485002	IGHD	P01880	384 aa		18.9	■□□□□ 0.62
MEGF6-205	ENST00000485002	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	18.9	■□□□□ 0.62
MEGF6-205	ENST00000485002	SPC24	Q8NBT2	197 aa		18.9	■□□□□ 0.62
MEGF6-205	ENST00000485002	MNS1	Q8NEH6	495 aa		18.89	■□□□□ 0.62
MEGF6-205	ENST00000485002	TNPO1	Q92973	898 aa	Known RBP	18.89	■□□□□ 0.62
MEGF6-205	ENST00000485002	WDR33	Q9C0J8	1336 aa	Known RBP	18.89	■□□□□ 0.61
MEGF6-205	ENST00000485002	TBC1D32	Q96NH3	1257 aa		18.89	■□□□□ 0.61
MEGF6-205	ENST00000485002	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	18.89	■□□□□ 0.61
MEGF6-205	ENST00000485002	NEXN	Q0ZGT2	675 aa		18.89	■□□□□ 0.61
MEGF6-205	ENST00000485002	CPLX2	Q6PUV4	134 aa	Known RBP	18.89	■□□□□ 0.61
MEGF6-205	ENST00000485002	ADAMTS12	P58397	1594 aa		18.89	■□□□□ 0.61
MEGF6-205	ENST00000485002	XRCC6	P12956	609 aa	Known RBP eCLIP	18.88	■□□□□ 0.61
MEGF6-205	ENST00000485002	CNTROB	Q8N137	903 aa		18.88	■□□□□ 0.61
MEGF6-205	ENST00000485002	NOC3L	Q8WTT2	800 aa	Known RBP	18.88	■□□□□ 0.61
MEGF6-205	ENST00000485002	SURF6	O75683	361 aa	Known RBP	18.88	■□□□□ 0.61
MEGF6-205	ENST00000485002	CPLX1	O14810	134 aa		18.88	■□□□□ 0.61
MEGF6-205	ENST00000485002	RPGRIP1L	Q68CZ1	1315 aa		18.88	■□□□□ 0.61
MEGF6-205	ENST00000485002	TPM1	P09493	284 aa		18.87	■□□□□ 0.61
MEGF6-205	ENST00000485002	SYCE3	A1L190	88 aa		18.87	■□□□□ 0.61
MEGF6-205	ENST00000485002	PES1	O00541	588 aa	Known RBP	18.87	■□□□□ 0.61
MEGF6-205	ENST00000485002	PDC	P20941	246 aa		18.86	■□□□□ 0.61
MEGF6-205	ENST00000485002	SSH1	Q8WYL5	1049 aa		18.86	■□□□□ 0.61
MEGF6-205	ENST00000485002	ZNF428	Q96B54	188 aa		18.86	■□□□□ 0.61
MEGF6-205	ENST00000485002	FOSB	P53539	338 aa		18.86	■□□□□ 0.61
MEGF6-205	ENST00000485002	TMPO	P42166	694 aa	Known RBP	18.86	■□□□□ 0.61
MEGF6-205	ENST00000485002	C8orf34	Q49A92	452 aa		18.86	■□□□□ 0.61
MEGF6-205	ENST00000485002	SDF4	Q9BRK5	362 aa		18.86	■□□□□ 0.61
MEGF6-205	ENST00000485002	WDR62	O43379	1518 aa		18.86	■□□□□ 0.61
MEGF6-205	ENST00000485002	C1orf141	Q5JVX7	400 aa		18.85	■□□□□ 0.61
MEGF6-205	ENST00000485002	GNAI2	P04899	355 aa		18.85	■□□□□ 0.61
MEGF6-205	ENST00000485002	CCDC192	P0DO97	292 aa		18.85	■□□□□ 0.61
MEGF6-205	ENST00000485002	PSMA5	P28066	241 aa		18.85	■□□□□ 0.61
MEGF6-205	ENST00000485002	TSR1	Q2NL82	804 aa	Known RBP	18.85	■□□□□ 0.61
MEGF6-205	ENST00000485002	ADGRL1	O94910	1474 aa		18.85	■□□□□ 0.61
MEGF6-205	ENST00000485002	SSFA2	P28290	1259 aa		18.85	■□□□□ 0.61
MEGF6-205	ENST00000485002	CLASRP	Q8N2M8	674 aa	Known RBP	18.85	■□□□□ 0.61
MEGF6-205	ENST00000485002	KIAA0556	O60303	1618 aa		18.84	■□□□□ 0.61
MEGF6-205	ENST00000485002	PANK2	Q9BZ23	570 aa		18.84	■□□□□ 0.61
MEGF6-205	ENST00000485002	NAT10	Q9H0A0	1025 aa	Known RBP	18.84	■□□□□ 0.61
MEGF6-205	ENST00000485002	CCDC66	A2RUB6	948 aa		18.83	■□□□□ 0.61
MEGF6-205	ENST00000485002	CD109	Q6YHK3	1445 aa		18.83	■□□□□ 0.6
MEGF6-205	ENST00000485002	SLC4A2	P04920	1241 aa		18.83	■□□□□ 0.6
MEGF6-205	ENST00000485002	LRRFIP1	Q32MZ4	808 aa	Known RBP	18.82	■□□□□ 0.6
MEGF6-205	ENST00000485002	CABP1	Q9NZU7	370 aa		18.82	■□□□□ 0.6
MEGF6-205	ENST00000485002	NSD3	Q9BZ95	1437 aa		18.82	■□□□□ 0.6
MEGF6-205	ENST00000485002	DDX58	O95786	925 aa	Known RBP	18.82	■□□□□ 0.6
MEGF6-205	ENST00000485002	XPC	Q01831	940 aa	Predicted RBP	18.82	■□□□□ 0.6
MEGF6-205	ENST00000485002	ADGRF5	Q8IZF2	1346 aa		18.81	■□□□□ 0.6
MEGF6-205	ENST00000485002	TRIM29	Q14134	588 aa		18.81	■□□□□ 0.6
MEGF6-205	ENST00000485002	CDK19	Q9BWU1	502 aa		18.81	■□□□□ 0.6
MEGF6-205	ENST00000485002	LRRCC1	Q9C099	1032 aa		18.81	■□□□□ 0.6
MEGF6-205	ENST00000485002	SYNE3	Q6ZMZ3	975 aa		18.81	■□□□□ 0.6
MEGF6-205	ENST00000485002	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		18.8	■□□□□ 0.6
MEGF6-205	ENST00000485002	CCDC30	Q5VVM6	783 aa		18.8	■□□□□ 0.6
MEGF6-205	ENST00000485002	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		18.8	■□□□□ 0.6
MEGF6-205	ENST00000485002	CCDC112	Q8NEF3	446 aa		18.8	■□□□□ 0.6
MEGF6-205	ENST00000485002	KIN	O60870	393 aa	Known RBP	18.8	■□□□□ 0.6
MEGF6-205	ENST00000485002	RPAP2	Q8IXW5	612 aa	Predicted RBP	18.8	■□□□□ 0.6
MEGF6-205	ENST00000485002	FSD1	Q9BTV5	496 aa		18.79	■□□□□ 0.6
MEGF6-205	ENST00000485002	HOOK1	Q9UJC3	728 aa	Known RBP	18.78	■□□□□ 0.6

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