RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524325.5

TSNARE1-208, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene TSNARE1, Length 1,963 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-208ENST00000524325 LRRC31Q6UY01 552 aa23.44■■□□□ 1.34
TSNARE1-208ENST00000524325 MFSD6LQ8IWD5 586 aa23.44■■□□□ 1.34
TSNARE1-208ENST00000524325 TP53INP2Q8IXH6 220 aa23.44■■□□□ 1.34
TSNARE1-208ENST00000524325 OSCP1Q8WVF1 389 aa23.44■■□□□ 1.34
TSNARE1-208ENST00000524325 ELSPBP1Q96BH3 223 aa23.44■■□□□ 1.34
TSNARE1-208ENST00000524325 TBC1D31Q96DN5 1066 aa23.44■■□□□ 1.34
TSNARE1-208ENST00000524325 RNF157Q96PX1 679 aa23.44■■□□□ 1.34
TSNARE1-208ENST00000524325 TBL1XO60907 577 aa23.43■■□□□ 1.34
TSNARE1-208ENST00000524325 ERCC2P18074 760 aa23.43■■□□□ 1.34
TSNARE1-208ENST00000524325 LY6G5CQ5SRR4 150 aa23.43■■□□□ 1.34
TSNARE1-208ENST00000524325 FAM217AQ8IXS0 508 aa23.43■■□□□ 1.34
TSNARE1-208ENST00000524325 LRRN4Q8WUT4 740 aa23.43■■□□□ 1.34
TSNARE1-208ENST00000524325 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF670Q9BS34 389 aa23.43■■□□□ 1.34
TSNARE1-208ENST00000524325 TMEM51Q9NW97 253 aa23.43■■□□□ 1.34
TSNARE1-208ENST00000524325 CLEC4EQ9ULY5 219 aa23.43■■□□□ 1.34
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF510Q9Y2H8 683 aa23.43■■□□□ 1.34
TSNARE1-208ENST00000524325 ANHXE9PGG2 379 aa23.43■■□□□ 1.34
TSNARE1-208ENST00000524325 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
TSNARE1-208ENST00000524325 GFRA2O00451 464 aa23.43■■□□□ 1.34
TSNARE1-208ENST00000524325 FGGP02679 453 aa23.43■■□□□ 1.34
TSNARE1-208ENST00000524325 TAZQ16635 292 aa23.43■■□□□ 1.34
TSNARE1-208ENST00000524325 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
TSNARE1-208ENST00000524325 AAK1Q2M2I8 961 aa23.43■■□□□ 1.34
TSNARE1-208ENST00000524325 EML3Q32P44 896 aa23.43■■□□□ 1.34
TSNARE1-208ENST00000524325 SEL1L2Q5TEA6 688 aa23.43■■□□□ 1.34
TSNARE1-208ENST00000524325 RHBDF2Q6PJF5 856 aa23.43■■□□□ 1.34
TSNARE1-208ENST00000524325 NPNTQ6UXI9 565 aa23.43■■□□□ 1.34
TSNARE1-208ENST00000524325 KIF18AQ8NI77 898 aa23.43■■□□□ 1.34
TSNARE1-208ENST00000524325 DDI1Q8WTU0 396 aa23.43■■□□□ 1.34
TSNARE1-208ENST00000524325 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
TSNARE1-208ENST00000524325 CST8O60676 142 aa23.42■■□□□ 1.34
TSNARE1-208ENST00000524325 LATS1O95835 1130 aa23.42■■□□□ 1.34
TSNARE1-208ENST00000524325 PSMC3P17980 439 aa23.42■■□□□ 1.34
TSNARE1-208ENST00000524325 GDI1P31150 447 aa23.42■■□□□ 1.34
TSNARE1-208ENST00000524325 IFNAR2P48551 515 aa23.42■■□□□ 1.34
TSNARE1-208ENST00000524325 ANO4Q32M45 955 aa23.42■■□□□ 1.34
TSNARE1-208ENST00000524325 C1orf228Q6PIY5 440 aa23.42■■□□□ 1.34
TSNARE1-208ENST00000524325 YAF2Q8IY57 180 aa23.42■■□□□ 1.34
TSNARE1-208ENST00000524325 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa23.42■■□□□ 1.34
TSNARE1-208ENST00000524325 FAF2Q96CS3 445 aa23.42■■□□□ 1.34
TSNARE1-208ENST00000524325 FAM83CQ9BQN1 747 aa23.42■■□□□ 1.34
TSNARE1-208ENST00000524325 ZYG11BQ9C0D3 744 aa23.42■■□□□ 1.34
TSNARE1-208ENST00000524325 KCNK12Q9HB15 430 aa23.42■■□□□ 1.34
TSNARE1-208ENST00000524325 OBP2AQ9NY56 170 aa23.42■■□□□ 1.34
TSNARE1-208ENST00000524325 TBC1D14Q9P2M4 693 aa23.42■■□□□ 1.34
TSNARE1-208ENST00000524325 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa23.41■■□□□ 1.34
TSNARE1-208ENST00000524325 DRGXA6NNA5 263 aa23.41■■□□□ 1.34
TSNARE1-208ENST00000524325 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa23.41■■□□□ 1.34
TSNARE1-208ENST00000524325 ECI2O75521 394 aa23.41■■□□□ 1.34
TSNARE1-208ENST00000524325 TCP1P17987 556 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
TSNARE1-208ENST00000524325 CHKAP35790 457 aa23.41■■□□□ 1.34
TSNARE1-208ENST00000524325 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
TSNARE1-208ENST00000524325 FCHO2Q0JRZ9 810 aa23.41■■□□□ 1.34
TSNARE1-208ENST00000524325 FAM182AQ5T1J6 154 aa23.41■■□□□ 1.34
TSNARE1-208ENST00000524325 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa23.41■■□□□ 1.34
TSNARE1-208ENST00000524325 NPWQ8N729 165 aa23.41■■□□□ 1.34
TSNARE1-208ENST00000524325 PBKQ96KB5 322 aa23.41■■□□□ 1.34
TSNARE1-208ENST00000524325 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
TSNARE1-208ENST00000524325 HPS4Q9NQG7 708 aa23.41■■□□□ 1.34
TSNARE1-208ENST00000524325 GTSE1Q9NYZ3 720 aa23.41■■□□□ 1.34
TSNARE1-208ENST00000524325 NR2E1Q9Y466 385 aa23.41■■□□□ 1.34
TSNARE1-208ENST00000524325 DENND4AQ7Z401 1863 aa23.41■■□□□ 1.34
TSNARE1-208ENST00000524325 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
TSNARE1-208ENST00000524325 MTSS1LQ765P7 747 aa23.41■■□□□ 1.34
TSNARE1-208ENST00000524325 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
TSNARE1-208ENST00000524325 CREG2Q8IUH2 290 aa23.41■■□□□ 1.34
TSNARE1-208ENST00000524325 NAT16Q8N8M0 369 aa23.41■■□□□ 1.34
TSNARE1-208ENST00000524325 OR52K2Q8NGK3 314 aa23.41■■□□□ 1.34
TSNARE1-208ENST00000524325 WFDC5Q8TCV5 224 aa23.41■■□□□ 1.34
TSNARE1-208ENST00000524325 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
TSNARE1-208ENST00000524325 IRF7Q92985 503 aa23.41■■□□□ 1.34
TSNARE1-208ENST00000524325 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
TSNARE1-208ENST00000524325 SPHK2Q9NRA0 654 aa23.41■■□□□ 1.34
TSNARE1-208ENST00000524325 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
TSNARE1-208ENST00000524325 THEGQ9P2T0 379 aa23.41■■□□□ 1.34
TSNARE1-208ENST00000524325 DCLK1O15075 740 aa23.4■■□□□ 1.34
TSNARE1-208ENST00000524325 CYP17A1P05093 508 aa23.4■■□□□ 1.34
TSNARE1-208ENST00000524325 HOXC13P31276 330 aa23.4■■□□□ 1.34
TSNARE1-208ENST00000524325 GBE1Q04446 702 aa23.4■■□□□ 1.34
TSNARE1-208ENST00000524325 DHCR24Q15392 516 aa23.4■■□□□ 1.34
TSNARE1-208ENST00000524325 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa23.4■■□□□ 1.34
TSNARE1-208ENST00000524325 NLRP14Q86W24 1093 aa23.4■■□□□ 1.34
TSNARE1-208ENST00000524325 CPXM2Q8N436 756 aa23.4■■□□□ 1.34
TSNARE1-208ENST00000524325 PLD5Q8N7P1 536 aa23.4■■□□□ 1.34
TSNARE1-208ENST00000524325 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
TSNARE1-208ENST00000524325 BBS2Q9BXC9 721 aa23.4■■□□□ 1.34
TSNARE1-208ENST00000524325 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
TSNARE1-208ENST00000524325 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
TSNARE1-208ENST00000524325 MTA1Q13330 715 aa23.4■■□□□ 1.34
TSNARE1-208ENST00000524325 PPP2R5EQ16537 467 aa23.4■■□□□ 1.34
TSNARE1-208ENST00000524325 LONRF2Q1L5Z9 754 aa23.4■■□□□ 1.34
TSNARE1-208ENST00000524325 FSCBQ5H9T9 825 aa23.4■■□□□ 1.34
TSNARE1-208ENST00000524325 RABGAP1LQ5R372 815 aa23.4■■□□□ 1.34
TSNARE1-208ENST00000524325 FYB2Q5VWT5 728 aa23.4■■□□□ 1.34
TSNARE1-208ENST00000524325 CARNMT1Q8N4J0 409 aa23.4■■□□□ 1.34
TSNARE1-208ENST00000524325 AP1M1Q9BXS5 423 aa23.4■■□□□ 1.34
TSNARE1-208ENST00000524325 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
TSNARE1-208ENST00000524325 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
TSNARE1-208ENST00000524325 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.3 ms