RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564547.1

TRAPPC2L-208, Transcript of trafficking protein particle complex 2 like, humanhuman

TSL 2

Gene TRAPPC2L, Length 980 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2L-208ENST00000564547 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC2L-208ENST00000564547 TRIM49BA6NDI0 452 aa14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC2L-208ENST00000564547 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC2L-208ENST00000564547 TBL1XO60907 577 aa14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC2L-208ENST00000564547 SIN3BO75182 1162 aa14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC2L-208ENST00000564547 CER1O95813 267 aa14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC2L-208ENST00000564547 IGLV3-27P01718 113 aa14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC2L-208ENST00000564547 ACADMP11310 421 aa14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC2L-208ENST00000564547 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC2L-208ENST00000564547 VAV1P15498 845 aa14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC2L-208ENST00000564547 ITPKBP27987 946 aa14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC2L-208ENST00000564547 MXI1P50539 228 aa14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC2L-208ENST00000564547 DAOAP59103 153 aa14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC2L-208ENST00000564547 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC2L-208ENST00000564547 MPPE1Q53F39 396 aa14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC2L-208ENST00000564547 KRBA2Q6ZNG9 492 aa14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC2L-208ENST00000564547 CFAP52Q8N1V2 620 aa14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC2L-208ENST00000564547 FBXL13Q8NEE6 735 aa14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC2L-208ENST00000564547 UCMAQ8WVF2 138 aa14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC2L-208ENST00000564547 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC2L-208ENST00000564547 STIM2Q9P246 746 aa14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC2L-208ENST00000564547 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC2L-208ENST00000564547 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC2L-208ENST00000564547 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC2L-208ENST00000564547 FAM47DPA6NHR8 397 aa14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC2L-208ENST00000564547 TTC34A8MYJ7 566 aa14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC2L-208ENST00000564547 KRT13P13646 458 aa14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC2L-208ENST00000564547 PRCPP42785 496 aa14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC2L-208ENST00000564547 SYKP43405 635 aa14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC2L-208ENST00000564547 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC2L-208ENST00000564547 ZNF132P52740 706 aa14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC2L-208ENST00000564547 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC2L-208ENST00000564547 PNOCQ13519 176 aa14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC2L-208ENST00000564547 CUL2Q13617 745 aa14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC2L-208ENST00000564547 ADGRF1Q5T601 910 aa14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC2L-208ENST00000564547 TADA2BQ86TJ2 420 aa14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC2L-208ENST00000564547 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC2L-208ENST00000564547 ADAM32Q8TC27 787 aa14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC2L-208ENST00000564547 FAM129BQ96TA1 746 aa14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC2L-208ENST00000564547 IMPG2Q9BZV3 1241 aa14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC2L-208ENST00000564547 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC2L-208ENST00000564547 NEUROG2Q9H2A3 272 aa14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC2L-208ENST00000564547 STRIP2Q9ULQ0 834 aa14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC2L-208ENST00000564547 RNF103O00237 685 aa14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC2L-208ENST00000564547 NPC1O15118 1278 aa14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC2L-208ENST00000564547 MID1O15344 667 aa14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC2L-208ENST00000564547 FLRT2O43155 660 aa14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC2L-208ENST00000564547 TIMM44O43615 452 aa14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC2L-208ENST00000564547 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC2L-208ENST00000564547 CYBBP04839 570 aa14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC2L-208ENST00000564547 DLDP09622 509 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC2L-208ENST00000564547 CD19P15391 556 aa14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC2L-208ENST00000564547 CD27P26842 260 aa14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC2L-208ENST00000564547 GTF2H1P32780 548 aa14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC2L-208ENST00000564547 RDXP35241 583 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC2L-208ENST00000564547 CSKP41240 450 aa14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC2L-208ENST00000564547 GALCP54803 685 aa14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC2L-208ENST00000564547 BNIP3Q12983 259 aa14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC2L-208ENST00000564547 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC2L-208ENST00000564547 C9orf64Q5T6V5 341 aa14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC2L-208ENST00000564547 ANKRD40Q6AI12 368 aa14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC2L-208ENST00000564547 NCEH1Q6PIU2 408 aa14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC2L-208ENST00000564547 APCDD1Q8J025 514 aa14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC2L-208ENST00000564547 AADATQ8N5Z0 425 aa14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC2L-208ENST00000564547 SLC35F5Q8WV83 523 aa14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC2L-208ENST00000564547 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC2L-208ENST00000564547 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC2L-208ENST00000564547 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC2L-208ENST00000564547 COQ4Q9Y3A0 265 aa14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC2L-208ENST00000564547 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC2L-208ENST00000564547 RAI2Q9Y5P3 530 aa14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC2L-208ENST00000564547 ZNF462Q96JM2 2506 aa14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC2L-208ENST00000564547 A0A1W2PP55 124 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC2L-208ENST00000564547 A0A1W2PR77 199 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC2L-208ENST00000564547 C1QL1O75973 258 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC2L-208ENST00000564547 BRD2P25440 801 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC2L-208ENST00000564547 GRIA4P48058 902 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC2L-208ENST00000564547 STK19P49842 368 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC2L-208ENST00000564547 BCAT1P54687 386 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC2L-208ENST00000564547 PPP2CBP62714 309 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC2L-208ENST00000564547 PPP2CAP67775 309 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC2L-208ENST00000564547 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC2L-208ENST00000564547 KIAA0895LQ68EN5 471 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC2L-208ENST00000564547 MSANTD2Q6P1R3 559 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC2L-208ENST00000564547 ARHGAP18Q8N392 663 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC2L-208ENST00000564547 LMO3Q8TAP4 145 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC2L-208ENST00000564547 IGSF8Q969P0 613 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC2L-208ENST00000564547 TTC17Q96AE7 1141 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC2L-208ENST00000564547 SPATA32Q96LK8 384 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC2L-208ENST00000564547 BTBD1Q9H0C5 482 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC2L-208ENST00000564547 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC2L-208ENST00000564547 LRRC4Q9HBW1 653 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC2L-208ENST00000564547 TJP2Q9UDY2 1190 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC2L-208ENST00000564547 CYTH4Q9UIA0 394 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC2L-208ENST00000564547 CFAP45Q9UL16 551 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC2L-208ENST00000564547 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC2L-208ENST00000564547 CA5BQ9Y2D0 317 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC2L-208ENST00000564547 DOCK9Q9BZ29 2069 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC2L-208ENST00000564547 A0A1B0GTQ1 180 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-208ENST00000564547 TNFSF14O43557 240 aa14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.1 ms