RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563200.5

PPP4C-205, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 5

Gene PPP4C, Length 1,447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-205	ENST00000563200	PASD1	Q8IV76	773 aa		22.63	■■□□□ 1.21
PPP4C-205	ENST00000563200	C12orf50	Q8NA57	414 aa	Predicted RBP	22.63	■■□□□ 1.21
PPP4C-205	ENST00000563200	SORCS1	Q8WY21	1168 aa		22.63	■■□□□ 1.21
PPP4C-205	ENST00000563200	TCEAL3	Q969E4	200 aa		22.63	■■□□□ 1.21
PPP4C-205	ENST00000563200	ERLEC1	Q96DZ1	483 aa		22.63	■■□□□ 1.21
PPP4C-205	ENST00000563200	PPP1R13B	Q96KQ4	1090 aa		22.63	■■□□□ 1.21
PPP4C-205	ENST00000563200	MSANTD3-TMEFF1	A0A0A6YYJ0	341 aa		22.62	■■□□□ 1.21
PPP4C-205	ENST00000563200	PTGER3	P43115	390 aa		22.62	■■□□□ 1.21
PPP4C-205	ENST00000563200	FUT11	Q495W5	492 aa		22.62	■■□□□ 1.21
PPP4C-205	ENST00000563200	AASDH	Q4L235	1098 aa	Predicted RBP	22.62	■■□□□ 1.21
PPP4C-205	ENST00000563200	LPCAT2	Q7L5N7	544 aa		22.62	■■□□□ 1.21
PPP4C-205	ENST00000563200	ADIPOR2	Q86V24	386 aa		22.62	■■□□□ 1.21
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEFF1	Q8IYR6	380 aa		22.62	■■□□□ 1.21
PPP4C-205	ENST00000563200	WFDC5	Q8TCV5	224 aa		22.62	■■□□□ 1.21
PPP4C-205	ENST00000563200	MYEOV	Q96EZ4	313 aa		22.62	■■□□□ 1.21
PPP4C-205	ENST00000563200	PRICKLE1	Q96MT3	831 aa	Predicted RBP	22.62	■■□□□ 1.21
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC6A17	Q9H1V8	727 aa		22.62	■■□□□ 1.21
PPP4C-205	ENST00000563200	FHOD1	Q9Y613	1164 aa		22.62	■■□□□ 1.21
PPP4C-205	ENST00000563200	IGHV1OR15-9	A0A0B4J2B8	117 aa		22.61	■■□□□ 1.21
PPP4C-205	ENST00000563200	MED19	A0JLT2	244 aa	Predicted RBP	22.61	■■□□□ 1.21
PPP4C-205	ENST00000563200	DCDC2B	A2VCK2	349 aa		22.61	■■□□□ 1.21
PPP4C-205	ENST00000563200	CAPN9	O14815	690 aa		22.61	■■□□□ 1.21
PPP4C-205	ENST00000563200	MAP3K13	O43283	966 aa		22.61	■■□□□ 1.21
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF217	O75362	1048 aa		22.61	■■□□□ 1.21
PPP4C-205	ENST00000563200	TRUB2	O95900	331 aa	Known RBP	22.61	■■□□□ 1.21
PPP4C-205	ENST00000563200	DHPS	P49366	369 aa	Predicted RBP	22.61	■■□□□ 1.21
PPP4C-205	ENST00000563200	PITX1	P78337	314 aa	Predicted RBP	22.61	■■□□□ 1.21
PPP4C-205	ENST00000563200	DRAP1	Q14919	205 aa	Predicted RBP	22.61	■■□□□ 1.21
PPP4C-205	ENST00000563200	C1orf131	Q8NDD1	294 aa	Known RBP	22.61	■■□□□ 1.21
PPP4C-205	ENST00000563200	LMLN	Q96KR4	655 aa		22.61	■■□□□ 1.21
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC2A13	Q96QE2	648 aa		22.61	■■□□□ 1.21
PPP4C-205	ENST00000563200	CIPC	Q9C0C6	399 aa		22.61	■■□□□ 1.21
PPP4C-205	ENST00000563200	MKRN2	Q9H000	416 aa	Known RBP	22.61	■■□□□ 1.21
PPP4C-205	ENST00000563200	ABCB8	Q9NUT2	735 aa		22.61	■■□□□ 1.21
PPP4C-205	ENST00000563200	ASNSD1	Q9NWL6	643 aa		22.61	■■□□□ 1.21
PPP4C-205	ENST00000563200	TM4SF5	O14894	197 aa		22.6	■■□□□ 1.21
PPP4C-205	ENST00000563200	ZBTB24	O43167	697 aa	Predicted RBP	22.6	■■□□□ 1.21
PPP4C-205	ENST00000563200	TBL1X	O60907	577 aa		22.6	■■□□□ 1.21
PPP4C-205	ENST00000563200	GLI1	P08151	1106 aa		22.6	■■□□□ 1.21
PPP4C-205	ENST00000563200	UCHL3	P15374	230 aa		22.6	■■□□□ 1.21
PPP4C-205	ENST00000563200	STARD3	Q14849	445 aa		22.6	■■□□□ 1.21
PPP4C-205	ENST00000563200	E2F5	Q15329	346 aa		22.6	■■□□□ 1.21
PPP4C-205	ENST00000563200	CYP2U1	Q7Z449	544 aa		22.6	■■□□□ 1.21
PPP4C-205	ENST00000563200	METTL3	Q86U44	580 aa	Known RBP	22.6	■■□□□ 1.21
PPP4C-205	ENST00000563200	WFIKKN2	Q8TEU8	576 aa		22.6	■■□□□ 1.21
PPP4C-205	ENST00000563200	NUCKS1	Q9H1E3	243 aa	Known RBP	22.6	■■□□□ 1.21
PPP4C-205	ENST00000563200	CD93	Q9NPY3	652 aa		22.6	■■□□□ 1.21
PPP4C-205	ENST00000563200	XPO7	Q9UIA9	1087 aa	Known RBP	22.6	■■□□□ 1.21
PPP4C-205	ENST00000563200	PRKCH	P24723	683 aa		22.59	■■□□□ 1.21
PPP4C-205	ENST00000563200	CD70	P32970	193 aa		22.59	■■□□□ 1.21
PPP4C-205	ENST00000563200	KRT9	P35527	623 aa		22.59	■■□□□ 1.21
PPP4C-205	ENST00000563200	BPIFB4	P59827	614 aa		22.59	■■□□□ 1.21
PPP4C-205	ENST00000563200	PTPRN	Q16849	979 aa		22.59	■■□□□ 1.21
PPP4C-205	ENST00000563200	ZC3H12A	Q5D1E8	599 aa	Known RBP	22.59	■■□□□ 1.21
PPP4C-205	ENST00000563200	MS4A13	Q5J8X5	152 aa		22.59	■■□□□ 1.21
PPP4C-205	ENST00000563200	OLFML1	Q6UWY5	402 aa		22.59	■■□□□ 1.21
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC36A4	Q6YBV0	504 aa		22.59	■■□□□ 1.21
PPP4C-205	ENST00000563200	AHI1	Q8N157	1196 aa		22.59	■■□□□ 1.21
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM74B	Q9NUR3	256 aa		22.59	■■□□□ 1.21
PPP4C-205	ENST00000563200	TAB2	Q9NYJ8	693 aa		22.59	■■□□□ 1.21
PPP4C-205	ENST00000563200	GGA2	Q9UJY4	613 aa		22.59	■■□□□ 1.21
PPP4C-205	ENST00000563200	LNP1	A1A4G5	178 aa		22.58	■■□□□ 1.21
PPP4C-205	ENST00000563200	PATE3	B3GLJ2	98 aa		22.58	■■□□□ 1.21
PPP4C-205	ENST00000563200	ERBB2	P04626	1255 aa		22.58	■■□□□ 1.21
PPP4C-205	ENST00000563200	C7	P10643	843 aa		22.58	■■□□□ 1.21
PPP4C-205	ENST00000563200	PABPC1	P11940	636 aa	Known RBP	22.58	■■□□□ 1.21
PPP4C-205	ENST00000563200	CYP11B1	P15538	503 aa		22.58	■■□□□ 1.21
PPP4C-205	ENST00000563200	CDH5	P33151	784 aa	Predicted RBP	22.58	■■□□□ 1.21
PPP4C-205	ENST00000563200	COPA	P53621	1224 aa		22.58	■■□□□ 1.21
PPP4C-205	ENST00000563200	RPS24	P62847	133 aa	Known RBP	22.58	■■□□□ 1.21
PPP4C-205	ENST00000563200	RAPGEF1	Q13905	1077 aa		22.58	■■□□□ 1.21
PPP4C-205	ENST00000563200	KRT31	Q15323	416 aa		22.58	■■□□□ 1.21
PPP4C-205	ENST00000563200	PTPN20	Q4JDL3	420 aa		22.58	■■□□□ 1.21
PPP4C-205	ENST00000563200	DCAF6	Q58WW2	860 aa		22.58	■■□□□ 1.21
PPP4C-205	ENST00000563200	EFHC1	Q5JVL4	640 aa		22.58	■■□□□ 1.21
PPP4C-205	ENST00000563200	STPG1	Q5TH74	334 aa		22.58	■■□□□ 1.21
PPP4C-205	ENST00000563200	PEAR1	Q5VY43	1037 aa	Predicted RBP	22.58	■■□□□ 1.21
PPP4C-205	ENST00000563200	C11orf57	Q6ZUT1	292 aa	Predicted RBP	22.58	■■□□□ 1.21
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM183BP	Q6ZVS7	135 aa		22.58	■■□□□ 1.21
PPP4C-205	ENST00000563200	CHST9	Q7L1S5	443 aa		22.58	■■□□□ 1.21
PPP4C-205	ENST00000563200	DEFB106A	Q8N104	65 aa		22.58	■■□□□ 1.21
PPP4C-205	ENST00000563200	HJURP	Q8NCD3	748 aa	Predicted RBP	22.58	■■□□□ 1.21
PPP4C-205	ENST00000563200	FIBIN	Q8TAL6	211 aa		22.58	■■□□□ 1.21
PPP4C-205	ENST00000563200	NOX5	Q96PH1	765 aa		22.58	■■□□□ 1.21
PPP4C-205	ENST00000563200	DDX50	Q9BQ39	737 aa	Known RBP	22.58	■■□□□ 1.21
PPP4C-205	ENST00000563200	LSM14B	Q9BX40	385 aa	Known RBP	22.58	■■□□□ 1.21
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM245	Q9H330	911 aa		22.58	■■□□□ 1.21
PPP4C-205	ENST00000563200	PLCB1	Q9NQ66	1216 aa		22.58	■■□□□ 1.21
PPP4C-205	ENST00000563200	CYP8B1	Q9UNU6	501 aa		22.58	■■□□□ 1.21
PPP4C-205	ENST00000563200	PES1	O00541	588 aa	Known RBP	22.57	■■□□□ 1.2
PPP4C-205	ENST00000563200	AP5Z1	O43299	807 aa		22.57	■■□□□ 1.2
PPP4C-205	ENST00000563200	HSF2BP	O75031	334 aa		22.57	■■□□□ 1.2
PPP4C-205	ENST00000563200	RPL6	Q02878	288 aa	Known RBP	22.57	■■□□□ 1.2
PPP4C-205	ENST00000563200	SERPINA13P	Q6UXR4	307 aa		22.57	■■□□□ 1.2
PPP4C-205	ENST00000563200	ARMCX6	Q7L4S7	300 aa		22.57	■■□□□ 1.2
PPP4C-205	ENST00000563200	SYT12	Q8IV01	421 aa		22.57	■■□□□ 1.2
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF557	Q8N988	423 aa	Predicted RBP	22.57	■■□□□ 1.2
PPP4C-205	ENST00000563200	DDX1	Q92499	740 aa	Known RBP	22.57	■■□□□ 1.2
PPP4C-205	ENST00000563200	PIGK	Q92643	395 aa		22.57	■■□□□ 1.2
PPP4C-205	ENST00000563200	BTN2A3P	Q96KV6	586 aa		22.57	■■□□□ 1.2

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