RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420515.1

FAAP20-207, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene FAAP20, Length 1,544 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-207ENST00000420515 BUB1O43683 1085 aa28.12■■■□□ 2.09
FAAP20-207ENST00000420515 LATS1O95835 1130 aa28.12■■■□□ 2.09
FAAP20-207ENST00000420515 SLC2A3P11169 496 aa28.12■■■□□ 2.09
FAAP20-207ENST00000420515 MIPP30301 263 aa28.12■■■□□ 2.09
FAAP20-207ENST00000420515 SLC11A2P49281 568 aa28.12■■■□□ 2.09
FAAP20-207ENST00000420515 ADGRF1Q5T601 910 aa28.12■■■□□ 2.09
FAAP20-207ENST00000420515 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP28.12■■■□□ 2.09
FAAP20-207ENST00000420515 OTUB2Q96DC9 234 aa28.12■■■□□ 2.09
FAAP20-207ENST00000420515 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP28.11■■■□□ 2.09
FAAP20-207ENST00000420515 PROSCO94903 275 aa28.11■■■□□ 2.09
FAAP20-207ENST00000420515 IL1R2P27930 398 aa28.11■■■□□ 2.09
FAAP20-207ENST00000420515 NOP2P46087 812 aaKnown RBP28.11■■■□□ 2.09
FAAP20-207ENST00000420515 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP28.11■■■□□ 2.09
FAAP20-207ENST00000420515 ARTNQ5T4W7 220 aa28.11■■■□□ 2.09
FAAP20-207ENST00000420515 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa28.11■■■□□ 2.09
FAAP20-207ENST00000420515 C14orf80Q86SX3 495 aa28.11■■■□□ 2.09
FAAP20-207ENST00000420515 CPXM2Q8N436 756 aa28.11■■■□□ 2.09
FAAP20-207ENST00000420515 SIK2Q9H0K1 926 aa28.11■■■□□ 2.09
FAAP20-207ENST00000420515 PLK2Q9NYY3 685 aa28.11■■■□□ 2.09
FAAP20-207ENST00000420515 RNF8O76064 485 aa28.1■■■□□ 2.09
FAAP20-207ENST00000420515 NFATC1O95644 943 aa28.1■■■□□ 2.09
FAAP20-207ENST00000420515 ADRA1BP35368 520 aa28.1■■■□□ 2.09
FAAP20-207ENST00000420515 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa28.1■■■□□ 2.09
FAAP20-207ENST00000420515 DNASE1L2Q92874 299 aa28.1■■■□□ 2.09
FAAP20-207ENST00000420515 TRPV5Q9NQA5 729 aa28.1■■■□□ 2.09
FAAP20-207ENST00000420515 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa28.1■■■□□ 2.09
FAAP20-207ENST00000420515 CA14Q9ULX7 337 aa28.1■■■□□ 2.09
FAAP20-207ENST00000420515 HYOU1Q9Y4L1 999 aa28.1■■■□□ 2.09
FAAP20-207ENST00000420515 SHISA7A6NL88 538 aa28.09■■■□□ 2.09
FAAP20-207ENST00000420515 TACR2P21452 398 aa28.09■■■□□ 2.09
FAAP20-207ENST00000420515 IRAK1P51617 712 aa28.09■■■□□ 2.09
FAAP20-207ENST00000420515 HADHBP55084 474 aaKnown RBP28.09■■■□□ 2.09
FAAP20-207ENST00000420515 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa28.09■■■□□ 2.09
FAAP20-207ENST00000420515 C12orf40Q86WS4 652 aa28.09■■■□□ 2.09
FAAP20-207ENST00000420515 CHSY1Q86X52 802 aa28.09■■■□□ 2.09
FAAP20-207ENST00000420515 PYROXD2Q8N2H3 581 aa28.09■■■□□ 2.09
FAAP20-207ENST00000420515 FZD10Q9ULW2 581 aa28.09■■■□□ 2.09
FAAP20-207ENST00000420515 BTNL10A8MVZ5 291 aa28.08■■■□□ 2.09
FAAP20-207ENST00000420515 NRDCO43847 1150 aa28.08■■■□□ 2.09
FAAP20-207ENST00000420515 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP28.08■■■□□ 2.09
FAAP20-207ENST00000420515 GJA4P35212 333 aa28.08■■■□□ 2.09
FAAP20-207ENST00000420515 CHKAP35790 457 aa28.08■■■□□ 2.09
FAAP20-207ENST00000420515 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.09
FAAP20-207ENST00000420515 ACAP1Q15027 740 aa28.08■■■□□ 2.09
FAAP20-207ENST00000420515 FYB2Q5VWT5 728 aa28.08■■■□□ 2.09
FAAP20-207ENST00000420515 CPA6Q8N4T0 437 aa28.08■■■□□ 2.09
FAAP20-207ENST00000420515 NTAN1Q96AB6 310 aa28.08■■■□□ 2.09
FAAP20-207ENST00000420515 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa28.08■■■□□ 2.09
FAAP20-207ENST00000420515 USP18Q9UMW8 372 aa28.08■■■□□ 2.09
FAAP20-207ENST00000420515 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa28.08■■■□□ 2.09
FAAP20-207ENST00000420515 TTC28Q96AY4 2481 aa28.08■■■□□ 2.09
FAAP20-207ENST00000420515 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa28.08■■■□□ 2.08
FAAP20-207ENST00000420515 FAM72CH0Y354 149 aa28.08■■■□□ 2.08
FAAP20-207ENST00000420515 ADH5P11766 374 aa28.08■■■□□ 2.08
FAAP20-207ENST00000420515 ARHGAP25P42331 645 aa28.08■■■□□ 2.08
FAAP20-207ENST00000420515 TAS2R40P59535 323 aa28.08■■■□□ 2.08
FAAP20-207ENST00000420515 ZXDAP98168 799 aa28.08■■■□□ 2.08
FAAP20-207ENST00000420515 AUHQ13825 339 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.08
FAAP20-207ENST00000420515 CA9Q16790 459 aa28.08■■■□□ 2.08
FAAP20-207ENST00000420515 SMTNL2Q2TAL5 461 aa28.08■■■□□ 2.08
FAAP20-207ENST00000420515 ANO4Q32M45 955 aa28.08■■■□□ 2.08
FAAP20-207ENST00000420515 FAM72AQ5TYM5 149 aa28.08■■■□□ 2.08
FAAP20-207ENST00000420515 FAM72DQ6L9T8 149 aa28.08■■■□□ 2.08
FAAP20-207ENST00000420515 TXNDC11Q6PKC3 985 aa28.08■■■□□ 2.08
FAAP20-207ENST00000420515 SLFN11Q7Z7L1 901 aa28.08■■■□□ 2.08
FAAP20-207ENST00000420515 FAM72BQ86X60 149 aa28.08■■■□□ 2.08
FAAP20-207ENST00000420515 ZNF683Q8IZ20 524 aa28.08■■■□□ 2.08
FAAP20-207ENST00000420515 LGI2Q8N0V4 545 aa28.08■■■□□ 2.08
FAAP20-207ENST00000420515 CFAP52Q8N1V2 620 aa28.08■■■□□ 2.08
FAAP20-207ENST00000420515 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.08
FAAP20-207ENST00000420515 VANGL2Q9ULK5 521 aa28.08■■■□□ 2.08
FAAP20-207ENST00000420515 CLEC4EQ9ULY5 219 aa28.08■■■□□ 2.08
FAAP20-207ENST00000420515 MACROD2A1Z1Q3 448 aa28.07■■■□□ 2.08
FAAP20-207ENST00000420515 KRBA1A5PL33 1030 aa28.07■■■□□ 2.08
FAAP20-207ENST00000420515 CCDC175P0C221 793 aa28.07■■■□□ 2.08
FAAP20-207ENST00000420515 DESP17661 470 aa28.07■■■□□ 2.08
FAAP20-207ENST00000420515 PCK1P35558 622 aa28.07■■■□□ 2.08
FAAP20-207ENST00000420515 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP28.07■■■□□ 2.08
FAAP20-207ENST00000420515 RPS24P62847 133 aaKnown RBP28.07■■■□□ 2.08
FAAP20-207ENST00000420515 PFKPQ01813 784 aa28.07■■■□□ 2.08
FAAP20-207ENST00000420515 KIF5AQ12840 1032 aa28.07■■■□□ 2.08
FAAP20-207ENST00000420515 SLC44A4Q53GD3 710 aa28.07■■■□□ 2.08
FAAP20-207ENST00000420515 KCNT1Q5JUK3 1230 aa28.07■■■□□ 2.08
FAAP20-207ENST00000420515 FBXL22Q6P050 247 aa28.07■■■□□ 2.08
FAAP20-207ENST00000420515 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP28.07■■■□□ 2.08
FAAP20-207ENST00000420515 UBALD2Q8IYN6 164 aa28.07■■■□□ 2.08
FAAP20-207ENST00000420515 NAT16Q8N8M0 369 aa28.07■■■□□ 2.08
FAAP20-207ENST00000420515 TPCN2Q8NHX9 752 aa28.07■■■□□ 2.08
FAAP20-207ENST00000420515 IGSF8Q969P0 613 aa28.07■■■□□ 2.08
FAAP20-207ENST00000420515 HAPLN3Q96S86 360 aa28.07■■■□□ 2.08
FAAP20-207ENST00000420515 BBS2Q9BXC9 721 aa28.07■■■□□ 2.08
FAAP20-207ENST00000420515 ZWILCHQ9H900 591 aa28.07■■■□□ 2.08
FAAP20-207ENST00000420515 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa28.07■■■□□ 2.08
FAAP20-207ENST00000420515 PIAS3Q9Y6X2 628 aa28.07■■■□□ 2.08
FAAP20-207ENST00000420515 MESP2Q0VG99 397 aa28.06■■■□□ 2.08
FAAP20-207ENST00000420515 SCAPQ12770 1279 aa28.06■■■□□ 2.08
FAAP20-207ENST00000420515 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP28.06■■■□□ 2.08
FAAP20-207ENST00000420515 MARK1Q9P0L2 795 aa28.06■■■□□ 2.08
FAAP20-207ENST00000420515 PYCARDQ9ULZ3 195 aa28.06■■■□□ 2.08
FAAP20-207ENST00000420515 TRIM24O15164 1050 aa28.05■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.3 ms