RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367364.5

PTPRC-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 1,017 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-202ENST00000367364 Q6ZTK2 550 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-202ENST00000367364 KRTAP5-2Q701N4 177 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-202ENST00000367364 DENND1CQ8IV53 801 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-202ENST00000367364 ZDHHC12Q96GR4 267 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-202ENST00000367364 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-202ENST00000367364 STK31Q9BXU1 1019 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-202ENST00000367364 SPC25Q9HBM1 224 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-202ENST00000367364 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-202ENST00000367364 LAMP3Q9UQV4 416 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-202ENST00000367364 CUX2O14529 1486 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-202ENST00000367364 NCAPD3P42695 1498 aa4.55□□□□□ -1.68
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PTPRC-202ENST00000367364 NACADO15069 1562 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-202ENST00000367364 AQP7P3A6NL99 342 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-202ENST00000367364 ALG1L2C9J202 215 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-202ENST00000367364 LCATP04180 440 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-202ENST00000367364 DMWDQ09019 674 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-202ENST00000367364 TRAF1Q13077 416 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-202ENST00000367364 SLC29A2Q14542 456 aa4.54□□□□□ -1.68
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PTPRC-202ENST00000367364 MANEALQ5VSG8 457 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-202ENST00000367364 PPP1R35Q8TAP8 253 aa4.54□□□□□ -1.68
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PTPRC-202ENST00000367364 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-202ENST00000367364 NODALQ96S42 347 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-202ENST00000367364 FAM83DQ9H4H8 585 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-202ENST00000367364 SDF2L1Q9HCN8 221 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-202ENST00000367364 HDAC9Q9UKV0 1011 aa4.54□□□□□ -1.68
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PTPRC-202ENST00000367364 H3BML4 177 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-202ENST00000367364 SPRY3O43610 288 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-202ENST00000367364 OFD1O75665 1012 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-202ENST00000367364 IGLV2-11P01706 119 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-202ENST00000367364 SERPINB2P05120 415 aa4.53□□□□□ -1.68
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PTPRC-202ENST00000367364 Q5PR19 223 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-202ENST00000367364 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-202ENST00000367364 HMBOX1Q6NT76 420 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
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PTPRC-202ENST00000367364 SKAP1Q86WV1 359 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-202ENST00000367364 TCF7L1Q9HCS4 588 aa4.53□□□□□ -1.68
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PTPRC-202ENST00000367364 AKR1A1P14550 325 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-202ENST00000367364 IL1R1P14778 569 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-202ENST00000367364 TPH1P17752 444 aa4.52□□□□□ -1.69
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PTPRC-202ENST00000367364 KCNJ12Q14500 433 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-202ENST00000367364 ACOX1Q15067 660 aa4.52□□□□□ -1.69
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PTPRC-202ENST00000367364 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
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PTPRC-202ENST00000367364 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
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PTPRC-202ENST00000367364 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
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PTPRC-202ENST00000367364 EEA1Q15075 1411 aa4.49□□□□□ -1.69
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