RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473406.5

RABGGTB-209, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 721 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-209ENST00000473406 MCTP2Q6DN12 878 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-209ENST00000473406 KRT27Q7Z3Y8 459 aa6.6□□□□□ -1.35
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RABGGTB-209ENST00000473406 TEX11Q8IYF3 940 aa6.6□□□□□ -1.35
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RABGGTB-209ENST00000473406 SYNE4Q8N205 404 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-209ENST00000473406 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP6.6□□□□□ -1.353e-9■■■■■ 50.3
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RABGGTB-209ENST00000473406 ELP4Q96EB1 424 aa6.6□□□□□ -1.35
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RABGGTB-209ENST00000473406 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
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RABGGTB-209ENST00000473406 E7ENX8 843 aa6.59□□□□□ -1.35
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RABGGTB-209ENST00000473406 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
RABGGTB-209ENST00000473406 KIF1BPQ96EK5 621 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGGTB-209ENST00000473406 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP6.59□□□□□ -1.35
RABGGTB-209ENST00000473406 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
RABGGTB-209ENST00000473406 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
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RABGGTB-209ENST00000473406 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
RABGGTB-209ENST00000473406 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
RABGGTB-209ENST00000473406 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
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RABGGTB-209ENST00000473406 TMEM232C9JQI7 657 aa6.58□□□□□ -1.36
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RABGGTB-209ENST00000473406 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 SUN1O94901 812 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 HSPA4LO95757 839 aa6.58□□□□□ -1.36
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RABGGTB-209ENST00000473406 NDUFV1P49821 464 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 CDH15P55291 814 aa6.58□□□□□ -1.36
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RABGGTB-209ENST00000473406 GPR135Q8IZ08 494 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF366Q8N895 744 aa6.58□□□□□ -1.36
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RABGGTB-209ENST00000473406 VN1R3Q9BXE9 311 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 SIL1Q9H173 461 aa6.58□□□□□ -1.36
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RABGGTB-209ENST00000473406 HSFX1Q9UBD0 423 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 STEAP1Q9UHE8 339 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 SERTAD3Q9UJW9 196 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 RAB21Q9UL25 225 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 SORCS3Q9UPU3 1222 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 NEU2Q9Y3R4 380 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa6.57□□□□□ -1.36
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