RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398621.3

PGGT1BP2-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta pseudogene 2, humanhuman

BASIC

Gene PGGT1BP2, Length 1,028 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CALB1P05937 261 aa15.96■□□□□ 0.15
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IRF1P10914 325 aa15.96■□□□□ 0.15
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ARSAP15289 507 aa15.96■□□□□ 0.15
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TNFAIP3P21580 790 aa15.96■□□□□ 0.15
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CTHP32929 405 aa15.96■□□□□ 0.15
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CDK17Q00537 523 aa15.96■□□□□ 0.15
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TNK2Q07912 1038 aa15.96■□□□□ 0.15
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MTA1Q13330 715 aa15.96■□□□□ 0.15
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NUGGCQ68CJ6 796 aa15.96■□□□□ 0.15
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TRIM68Q6AZZ1 485 aa15.96■□□□□ 0.15
PGGT1BP2-201ENST00000398621 VPS36Q86VN1 386 aa15.96■□□□□ 0.15
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GAS2L3Q86XJ1 694 aa15.96■□□□□ 0.15
PGGT1BP2-201ENST00000398621 XYLT1Q86Y38 959 aa15.96■□□□□ 0.15
PGGT1BP2-201ENST00000398621 UNC45BQ8IWX7 931 aa15.96■□□□□ 0.15
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DRC7Q8IY82 874 aa15.96■□□□□ 0.15
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LINC00597Q9H2U6 94 aa15.96■□□□□ 0.15
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HAUS4Q9H6D7 363 aa15.96■□□□□ 0.15
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TBC1D17Q9HA65 648 aa15.96■□□□□ 0.15
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TLR6Q9Y2C9 796 aa15.96■□□□□ 0.15
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NCAM2O15394 837 aa15.95■□□□□ 0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DAB1O75553 588 aa15.95■□□□□ 0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IGLV3-25P01717 112 aa15.95■□□□□ 0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IGLV3-27P01718 113 aa15.95■□□□□ 0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SERPING1P05155 500 aa15.95■□□□□ 0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GZMAP12544 262 aa15.95■□□□□ 0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CASP14P31944 242 aa15.95■□□□□ 0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NOS2P35228 1153 aa15.95■□□□□ 0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CHKAP35790 457 aa15.95■□□□□ 0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MAGEA9P43362 315 aa15.95■□□□□ 0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ARID5BQ14865 1188 aa15.95■□□□□ 0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ACAD10Q6JQN1 1059 aa15.95■□□□□ 0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa15.95■□□□□ 0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 BBS7Q8IWZ6 715 aa15.95■□□□□ 0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CPLX3Q8WVH0 158 aa15.95■□□□□ 0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FAM3CQ92520 227 aa15.95■□□□□ 0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 AZIN2Q96A70 460 aa15.95■□□□□ 0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 VCPIP1Q96JH7 1222 aa15.95■□□□□ 0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ADAM22Q9P0K1 906 aa15.95■□□□□ 0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa15.95■□□□□ 0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 STOML2Q9UJZ1 356 aa15.95■□□□□ 0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 STAP1Q9ULZ2 295 aa15.95■□□□□ 0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa15.95■□□□□ 0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PTPRDP23468 1912 aa15.95■□□□□ 0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FAM86C2PA6NEL3 165 aa15.94■□□□□ 0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SLC2A3P11169 496 aa15.94■□□□□ 0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 AOC1P19801 751 aa15.94■□□□□ 0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GBP1P32455 592 aa15.94■□□□□ 0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MATKP42679 507 aa15.94■□□□□ 0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TBX4P57082 545 aa15.94■□□□□ 0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GAD2Q05329 585 aa15.94■□□□□ 0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DHCR24Q15392 516 aa15.94■□□□□ 0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TAF5Q15542 800 aa15.94■□□□□ 0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DCAF6Q58WW2 860 aa15.94■□□□□ 0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SYPL2Q5VXT5 272 aa15.94■□□□□ 0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HGSNATQ68CP4 663 aa15.94■□□□□ 0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MON1BQ7L1V2 547 aa15.94■□□□□ 0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DEFB106AQ8N104 65 aa15.94■□□□□ 0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FLCNQ8NFG4 579 aa15.94■□□□□ 0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OR8K1Q8NGG5 319 aa15.94■□□□□ 0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa15.94■□□□□ 0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DNAJC7Q99615 494 aa15.94■□□□□ 0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LRFN3Q9BTN0 628 aa15.94■□□□□ 0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LTB4R2Q9NPC1 389 aa15.94■□□□□ 0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SPHK2Q9NRA0 654 aa15.94■□□□□ 0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TTC28Q96AY4 2481 aa15.94■□□□□ 0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IRAK2O43187 625 aa15.93■□□□□ 0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KLKB1P03952 638 aa15.93■□□□□ 0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CYP17A1P05093 508 aa15.93■□□□□ 0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HMBSP08397 361 aa15.93■□□□□ 0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GJA4P35212 333 aa15.93■□□□□ 0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SLC11A2P49281 568 aa15.93■□□□□ 0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PTP4A2Q12974 167 aa15.93■□□□□ 0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IER5LQ5T953 404 aa15.93■□□□□ 0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RHBDF2Q6PJF5 856 aa15.93■□□□□ 0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TAC4Q86UU9 113 aa15.93■□□□□ 0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CNGA4Q8IV77 575 aa15.93■□□□□ 0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FAM217AQ8IXS0 508 aa15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.6 ms